Protein–RNA interactions for Protein: P27692

SPT5, Transcription elongation factor SPT5, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPT5P27692 YML009W-BYML009W-B 477 nt21.66■■□□□ 1.06
SPT5P27692 NSR1YGR159C 1245 nt21.59■■□□□ 1.05
SPT5P27692 NOP1YDL014W 984 nt21.22■□□□□ 0.99
SPT5P27692 YKL036CYKL036C 393 nt19.45■□□□□ 0.7
SPT5P27692 MDJ1YFL016C 1536 nt19■□□□□ 0.63
SPT5P27692 Q0297Q0297 156 nt18.41■□□□□ 0.54
SPT5P27692 SRX1YKL086W 384 nt18.4■□□□□ 0.54
SPT5P27692 YJL027CYJL027C 417 nt18.15■□□□□ 0.5
SPT5P27692 SCS3YGL126W 1143 nt17.55■□□□□ 0.4
SPT5P27692 YCR051WYCR051W 669 nt17.49■□□□□ 0.39
SPT5P27692 YOL085CYOL085C 342 nt16.75■□□□□ 0.27
SPT5P27692 DBP2YNL112W 1641 nt16.71■□□□□ 0.27
SPT5P27692 TRN1tP(UGG)A 72 nt16.57■□□□□ 0.24
SPT5P27692 SUF9tP(UGG)F 72 nt16.57■□□□□ 0.24
SPT5P27692 SUF8tP(UGG)H 72 nt16.57■□□□□ 0.24
SPT5P27692 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt16.57■□□□□ 0.24
SPT5P27692 SUF7tP(UGG)M 72 nt16.57■□□□□ 0.24
SPT5P27692 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt16.57■□□□□ 0.24
SPT5P27692 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt16.57■□□□□ 0.24
SPT5P27692 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt16.57■□□□□ 0.24
SPT5P27692 SUF11tP(UGG)O2 72 nt16.57■□□□□ 0.24
SPT5P27692 RPP1BYDL130W 321 nt16.54■□□□□ 0.24
SPT5P27692 CCC1YLR220W 969 nt16.45■□□□□ 0.22
SPT5P27692 PKP1YIL042C 1185 nt16.44■□□□□ 0.22
SPT5P27692 YBR190WYBR190W 312 nt16.36■□□□□ 0.21
SPT5P27692 SSA3YBL075C 1950 nt16.35■□□□□ 0.21
SPT5P27692 RVS167YDR388W 1449 nt16.08■□□□□ 0.16
SPT5P27692 RTC3YHR087W 336 nt16.04■□□□□ 0.16
SPT5P27692 Q0182Q0182 405 nt15.98■□□□□ 0.15
SPT5P27692 SCR1SCR1 522 nt15.77■□□□□ 0.12
SPT5P27692 ATS1YAL020C 1002 nt15.73■□□□□ 0.11
SPT5P27692 SCJ1YMR214W 1134 nt15.71■□□□□ 0.11
SPT5P27692 PET122YER153C 765 nt15.7■□□□□ 0.1
SPT5P27692 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt15.7■□□□□ 0.1
SPT5P27692 MOT3YMR070W 1473 nt15.68■□□□□ 0.1
SPT5P27692 SHR5YOL110W 714 nt15.39■□□□□ 0.05
SPT5P27692 RRN5YLR141W 1092 nt15.28■□□□□ 0.04
SPT5P27692 YDJ1YNL064C 1230 nt15.25■□□□□ 0.03
SPT5P27692 RSB1YOR049C 1065 nt15.04■□□□□ -0
SPT5P27692 YER088W-BYER088W-B 147 nt14.96□□□□□ -0.01
SPT5P27692 URN1YPR152C 1398 nt14.93□□□□□ -0.02
SPT5P27692 RPN10YHR200W 807 nt14.91□□□□□ -0.02
SPT5P27692 GAR1YHR089C 618 nt14.86□□□□□ -0.03
SPT5P27692 DEP1YAL013W 1218 nt14.85□□□□□ -0.03
SPT5P27692 YNL208WYNL208W 600 nt14.76□□□□□ -0.05
SPT5P27692 OPI9YLR338W 858 nt14.72□□□□□ -0.05
SPT5P27692 PUT4YOR348C 1884 nt14.68□□□□□ -0.06
SPT5P27692 SAH1YER043C 1350 nt14.56□□□□□ -0.08
SPT5P27692 PST2YDR032C 597 nt14.53□□□□□ -0.08
SPT5P27692 ARE1YCR048W 1833 nt14.41□□□□□ -0.1
SPT5P27692 PUN1YLR414C 792 nt14.39□□□□□ -0.11
SPT5P27692 TIR1YER011W 765 nt14.38□□□□□ -0.11
SPT5P27692 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt14.32□□□□□ -0.12
SPT5P27692 POA1YBR022W 534 nt14.29□□□□□ -0.12
SPT5P27692 YJR018WYJR018W 363 nt14.27□□□□□ -0.13
SPT5P27692 SSA4YER103W 1929 nt14.15□□□□□ -0.14
SPT5P27692 SPT5YML010W 3192 nt14.15□□□□□ -0.14
SPT5P27692 RPP2BYDR382W 333 nt14.14□□□□□ -0.15
SPT5P27692 PTC2YER089C 1395 nt14.1□□□□□ -0.15
SPT5P27692 SSA1YAL005C 1929 nt14.07□□□□□ -0.16
SPT5P27692 YKL097CYKL097C 411 nt14.07□□□□□ -0.16
SPT5P27692 BUD23YCR047C 828 nt14.06□□□□□ -0.16
SPT5P27692 NAB2YGL122C 1578 nt13.99□□□□□ -0.17
SPT5P27692 NME1NME1 340 nt13.97□□□□□ -0.17
SPT5P27692 BSC6YOL137W 1494 nt13.97□□□□□ -0.17
SPT5P27692 YGR139WYGR139W 339 nt13.96□□□□□ -0.17
SPT5P27692 SHU1YHL006C 453 nt13.91□□□□□ -0.18
SPT5P27692 INM2YDR287W 879 nt13.86□□□□□ -0.19
SPT5P27692 DAL1YIR027C 1383 nt13.79□□□□□ -0.2
SPT5P27692 YGR021WYGR021W 873 nt13.78□□□□□ -0.2
SPT5P27692 YJR120WYJR120W 351 nt13.78□□□□□ -0.2
SPT5P27692 FPR4YLR449W 1179 nt13.78□□□□□ -0.2
SPT5P27692 BDF1YLR399C 2061 nt13.77□□□□□ -0.21
SPT5P27692 BDH2YAL061W 1254 nt13.72□□□□□ -0.21
SPT5P27692 PAC11YDR488C 1602 nt13.7□□□□□ -0.22
SPT5P27692 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt13.67□□□□□ -0.22
SPT5P27692 WWM1YFL010C 636 nt13.66□□□□□ -0.22
SPT5P27692 YBL100CYBL100C 315 nt13.64□□□□□ -0.23
SPT5P27692 SRB2YHR041C 633 nt13.63□□□□□ -0.23
SPT5P27692 FIS1YIL065C 468 nt13.62□□□□□ -0.23
SPT5P27692 PHO4YFR034C 939 nt13.6□□□□□ -0.23
SPT5P27692 LSM3YLR438C-A 270 nt13.59□□□□□ -0.23
SPT5P27692 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt13.58□□□□□ -0.24
SPT5P27692 HOM6YJR139C 1080 nt13.55□□□□□ -0.24
SPT5P27692 TRM9YML014W 840 nt13.54□□□□□ -0.24
SPT5P27692 TAT1YBR069C 1860 nt13.54□□□□□ -0.24
SPT5P27692 NVJ2YPR091C 2313 nt13.47□□□□□ -0.25
SPT5P27692 NPL3YDR432W 1245 nt13.45□□□□□ -0.26
SPT5P27692 FUN26YAL022C 1554 nt13.45□□□□□ -0.26
SPT5P27692 MNP1YGL068W 585 nt13.41□□□□□ -0.26
SPT5P27692 ALF1YNL148C 765 nt13.41□□□□□ -0.26
SPT5P27692 YOL037CYOL037C 354 nt13.39□□□□□ -0.27
SPT5P27692 RKM5YLR137W 1104 nt13.38□□□□□ -0.27
SPT5P27692 SUF2tP(AGG)C 72 nt13.36□□□□□ -0.27
SPT5P27692 SUF10tP(AGG)N 72 nt13.36□□□□□ -0.27
SPT5P27692 YPS1YLR120C 1710 nt13.31□□□□□ -0.28
SPT5P27692 YOR139CYOR139C 393 nt13.31□□□□□ -0.28
SPT5P27692 CCT6YDR188W 1641 nt13.29□□□□□ -0.28
SPT5P27692 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt13.27□□□□□ -0.29
SPT5P27692 YDR095CYDR095C 411 nt13.24□□□□□ -0.29
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