Protein–RNA interactions for Protein: Q12266

TY1A-BL, Transposon Ty1-BL Gag polyprotein, yeastyeast

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-BLQ12266 NSR1YGR159C 1245 nt17.97■□□□□ 0.47
TY1A-BLQ12266 YML009W-BYML009W-B 477 nt17.93■□□□□ 0.46
TY1A-BLQ12266 NOP1YDL014W 984 nt17.32■□□□□ 0.36
TY1A-BLQ12266 MDJ1YFL016C 1536 nt16.18■□□□□ 0.18
TY1A-BLQ12266 YKL036CYKL036C 393 nt15.84■□□□□ 0.13
TY1A-BLQ12266 SRX1YKL086W 384 nt15.17■□□□□ 0.02
TY1A-BLQ12266 Q0297Q0297 156 nt15.14■□□□□ 0.01
TY1A-BLQ12266 YJL027CYJL027C 417 nt14.87□□□□□ -0.03
TY1A-BLQ12266 YCR051WYCR051W 669 nt14.37□□□□□ -0.11
TY1A-BLQ12266 SCS3YGL126W 1143 nt14.35□□□□□ -0.11
TY1A-BLQ12266 DBP2YNL112W 1641 nt14.26□□□□□ -0.13
TY1A-BLQ12266 TRN1tP(UGG)A 72 nt13.84□□□□□ -0.19
TY1A-BLQ12266 SUF9tP(UGG)F 72 nt13.84□□□□□ -0.19
TY1A-BLQ12266 SUF8tP(UGG)H 72 nt13.84□□□□□ -0.19
TY1A-BLQ12266 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt13.84□□□□□ -0.19
TY1A-BLQ12266 SUF7tP(UGG)M 72 nt13.84□□□□□ -0.19
TY1A-BLQ12266 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt13.84□□□□□ -0.19
TY1A-BLQ12266 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt13.84□□□□□ -0.19
TY1A-BLQ12266 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt13.84□□□□□ -0.19
TY1A-BLQ12266 SUF11tP(UGG)O2 72 nt13.84□□□□□ -0.19
TY1A-BLQ12266 YBR190WYBR190W 312 nt13.81□□□□□ -0.2
TY1A-BLQ12266 YOL085CYOL085C 342 nt13.76□□□□□ -0.21
TY1A-BLQ12266 CCC1YLR220W 969 nt13.69□□□□□ -0.22
TY1A-BLQ12266 RPP1BYDL130W 321 nt13.58□□□□□ -0.24
TY1A-BLQ12266 PKP1YIL042C 1185 nt13.58□□□□□ -0.24
TY1A-BLQ12266 RTC3YHR087W 336 nt13.47□□□□□ -0.25
TY1A-BLQ12266 RVS167YDR388W 1449 nt13.26□□□□□ -0.29
TY1A-BLQ12266 SCJ1YMR214W 1134 nt13.26□□□□□ -0.29
TY1A-BLQ12266 SSA3YBL075C 1950 nt13.21□□□□□ -0.29
TY1A-BLQ12266 YGR139WYGR139W 339 nt13.1□□□□□ -0.31
TY1A-BLQ12266 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.03□□□□□ -0.32
TY1A-BLQ12266 PET122YER153C 765 nt13.02□□□□□ -0.33
TY1A-BLQ12266 PUT4YOR348C 1884 nt12.89□□□□□ -0.35
TY1A-BLQ12266 SHR5YOL110W 714 nt12.8□□□□□ -0.36
TY1A-BLQ12266 ATS1YAL020C 1002 nt12.78□□□□□ -0.36
TY1A-BLQ12266 SCR1SCR1 522 nt12.76□□□□□ -0.37
TY1A-BLQ12266 RRN5YLR141W 1092 nt12.63□□□□□ -0.39
TY1A-BLQ12266 YDJ1YNL064C 1230 nt12.59□□□□□ -0.39
TY1A-BLQ12266 URN1YPR152C 1398 nt12.56□□□□□ -0.4
TY1A-BLQ12266 DEP1YAL013W 1218 nt12.53□□□□□ -0.4
TY1A-BLQ12266 ARE1YCR048W 1833 nt12.51□□□□□ -0.41
TY1A-BLQ12266 MOT3YMR070W 1473 nt12.49□□□□□ -0.41
TY1A-BLQ12266 Q0182Q0182 405 nt12.46□□□□□ -0.41
TY1A-BLQ12266 OPI9YLR338W 858 nt12.42□□□□□ -0.42
TY1A-BLQ12266 POA1YBR022W 534 nt12.42□□□□□ -0.42
TY1A-BLQ12266 SAH1YER043C 1350 nt12.42□□□□□ -0.42
TY1A-BLQ12266 YER088W-BYER088W-B 147 nt12.39□□□□□ -0.43
TY1A-BLQ12266 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.35□□□□□ -0.43
TY1A-BLQ12266 GAR1YHR089C 618 nt12.35□□□□□ -0.43
TY1A-BLQ12266 RPN10YHR200W 807 nt12.28□□□□□ -0.44
TY1A-BLQ12266 YNL208WYNL208W 600 nt12.28□□□□□ -0.44
TY1A-BLQ12266 RSB1YOR049C 1065 nt12.28□□□□□ -0.44
TY1A-BLQ12266 BSC6YOL137W 1494 nt12.27□□□□□ -0.45
TY1A-BLQ12266 NME1NME1 340 nt12.1□□□□□ -0.47
TY1A-BLQ12266 SPT5YML010W 3192 nt12.06□□□□□ -0.48
TY1A-BLQ12266 PUN1YLR414C 792 nt12.03□□□□□ -0.48
TY1A-BLQ12266 BUD23YCR047C 828 nt12□□□□□ -0.49
TY1A-BLQ12266 YJR018WYJR018W 363 nt11.97□□□□□ -0.49
TY1A-BLQ12266 PTC2YER089C 1395 nt11.95□□□□□ -0.5
TY1A-BLQ12266 TIR1YER011W 765 nt11.94□□□□□ -0.5
TY1A-BLQ12266 PST2YDR032C 597 nt11.88□□□□□ -0.51
TY1A-BLQ12266 SSA1YAL005C 1929 nt11.87□□□□□ -0.51
TY1A-BLQ12266 SSA4YER103W 1929 nt11.86□□□□□ -0.51
TY1A-BLQ12266 YJR120WYJR120W 351 nt11.83□□□□□ -0.52
TY1A-BLQ12266 NAB2YGL122C 1578 nt11.81□□□□□ -0.52
TY1A-BLQ12266 CSM2YIL132C 642 nt11.74□□□□□ -0.53
TY1A-BLQ12266 SRB2YHR041C 633 nt11.7□□□□□ -0.54
TY1A-BLQ12266 FIS1YIL065C 468 nt11.66□□□□□ -0.54
TY1A-BLQ12266 RPP2BYDR382W 333 nt11.64□□□□□ -0.55
TY1A-BLQ12266 DAL1YIR027C 1383 nt11.62□□□□□ -0.55
TY1A-BLQ12266 MEP2YNL142W 1500 nt11.57□□□□□ -0.56
TY1A-BLQ12266 FPR4YLR449W 1179 nt11.57□□□□□ -0.56
TY1A-BLQ12266 PAU21YOR394W 495 nt11.56□□□□□ -0.56
TY1A-BLQ12266 PAU22YPL282C 495 nt11.56□□□□□ -0.56
TY1A-BLQ12266 INM2YDR287W 879 nt11.54□□□□□ -0.56
TY1A-BLQ12266 PHO4YFR034C 939 nt11.52□□□□□ -0.57
TY1A-BLQ12266 ARO7YPR060C 771 nt11.46□□□□□ -0.57
TY1A-BLQ12266 BDF1YLR399C 2061 nt11.46□□□□□ -0.57
TY1A-BLQ12266 SHU1YHL006C 453 nt11.45□□□□□ -0.58
TY1A-BLQ12266 YBL100CYBL100C 315 nt11.43□□□□□ -0.58
TY1A-BLQ12266 YPS1YLR120C 1710 nt11.41□□□□□ -0.58
TY1A-BLQ12266 WWM1YFL010C 636 nt11.41□□□□□ -0.58
TY1A-BLQ12266 BDH2YAL061W 1254 nt11.41□□□□□ -0.58
TY1A-BLQ12266 PAM17YKR065C 594 nt11.39□□□□□ -0.59
TY1A-BLQ12266 DCW1YKL046C 1350 nt11.37□□□□□ -0.59
TY1A-BLQ12266 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt11.34□□□□□ -0.59
TY1A-BLQ12266 VAR1Q0140 1197 nt11.33□□□□□ -0.6
TY1A-BLQ12266 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.31□□□□□ -0.6
TY1A-BLQ12266 TAT1YBR069C 1860 nt11.31□□□□□ -0.6
TY1A-BLQ12266 FUN26YAL022C 1554 nt11.29□□□□□ -0.6
TY1A-BLQ12266 YDR095CYDR095C 411 nt11.28□□□□□ -0.6
TY1A-BLQ12266 YKL097CYKL097C 411 nt11.26□□□□□ -0.61
TY1A-BLQ12266 YGR021WYGR021W 873 nt11.23□□□□□ -0.61
TY1A-BLQ12266 HOM6YJR139C 1080 nt11.23□□□□□ -0.61
TY1A-BLQ12266 LSM3YLR438C-A 270 nt11.22□□□□□ -0.61
TY1A-BLQ12266 EMI2YDR516C 1503 nt11.21□□□□□ -0.61
TY1A-BLQ12266 TRM9YML014W 840 nt11.21□□□□□ -0.61
TY1A-BLQ12266 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.19□□□□□ -0.62
TY1A-BLQ12266 YDR509WYDR509W 348 nt11.18□□□□□ -0.62
TY1A-BLQ12266 REG2YBR050C 1017 nt11.18□□□□□ -0.62
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