Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E7

PCDHB2, Protocadherin beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB2Q9Y5E7 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC37.61■■■■□ 3.61
PCDHB2Q9Y5E7 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC36.69■■■■□ 3.46
PCDHB2Q9Y5E7 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
PCDHB2Q9Y5E7 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
PCDHB2Q9Y5E7 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
PCDHB2Q9Y5E7 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
PCDHB2Q9Y5E7 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
PCDHB2Q9Y5E7 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.07■■■■□ 3.36
PCDHB2Q9Y5E7 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
PCDHB2Q9Y5E7 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
PCDHB2Q9Y5E7 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
PCDHB2Q9Y5E7 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
PCDHB2Q9Y5E7 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
PCDHB2Q9Y5E7 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC35■■■■□ 3.19
PCDHB2Q9Y5E7 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
PCDHB2Q9Y5E7 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
PCDHB2Q9Y5E7 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
PCDHB2Q9Y5E7 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
PCDHB2Q9Y5E7 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
PCDHB2Q9Y5E7 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
PCDHB2Q9Y5E7 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
PCDHB2Q9Y5E7 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
PCDHB2Q9Y5E7 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
PCDHB2Q9Y5E7 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
PCDHB2Q9Y5E7 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
PCDHB2Q9Y5E7 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
PCDHB2Q9Y5E7 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
PCDHB2Q9Y5E7 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
PCDHB2Q9Y5E7 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PCDHB2Q9Y5E7 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.85■■■■□ 3.01
PCDHB2Q9Y5E7 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
PCDHB2Q9Y5E7 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
PCDHB2Q9Y5E7 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
PCDHB2Q9Y5E7 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PCDHB2Q9Y5E7 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PCDHB2Q9Y5E7 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
PCDHB2Q9Y5E7 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
PCDHB2Q9Y5E7 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.94
PCDHB2Q9Y5E7 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
PCDHB2Q9Y5E7 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
PCDHB2Q9Y5E7 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
PCDHB2Q9Y5E7 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
PCDHB2Q9Y5E7 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
PCDHB2Q9Y5E7 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
PCDHB2Q9Y5E7 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
PCDHB2Q9Y5E7 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
PCDHB2Q9Y5E7 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
PCDHB2Q9Y5E7 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
PCDHB2Q9Y5E7 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
PCDHB2Q9Y5E7 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
PCDHB2Q9Y5E7 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
PCDHB2Q9Y5E7 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
PCDHB2Q9Y5E7 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
PCDHB2Q9Y5E7 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
PCDHB2Q9Y5E7 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
PCDHB2Q9Y5E7 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PCDHB2Q9Y5E7 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
PCDHB2Q9Y5E7 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
PCDHB2Q9Y5E7 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
PCDHB2Q9Y5E7 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
PCDHB2Q9Y5E7 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
PCDHB2Q9Y5E7 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
PCDHB2Q9Y5E7 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
PCDHB2Q9Y5E7 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
PCDHB2Q9Y5E7 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
PCDHB2Q9Y5E7 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
PCDHB2Q9Y5E7 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
PCDHB2Q9Y5E7 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
PCDHB2Q9Y5E7 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PCDHB2Q9Y5E7 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC32.4■■■□□ 2.78
PCDHB2Q9Y5E7 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC32.37■■■□□ 2.77
PCDHB2Q9Y5E7 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
PCDHB2Q9Y5E7 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PCDHB2Q9Y5E7 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PCDHB2Q9Y5E7 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
PCDHB2Q9Y5E7 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
PCDHB2Q9Y5E7 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
PCDHB2Q9Y5E7 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PCDHB2Q9Y5E7 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
PCDHB2Q9Y5E7 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PCDHB2Q9Y5E7 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PCDHB2Q9Y5E7 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PCDHB2Q9Y5E7 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
PCDHB2Q9Y5E7 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
PCDHB2Q9Y5E7 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
PCDHB2Q9Y5E7 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PCDHB2Q9Y5E7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
PCDHB2Q9Y5E7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
PCDHB2Q9Y5E7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
PCDHB2Q9Y5E7 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
PCDHB2Q9Y5E7 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
PCDHB2Q9Y5E7 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
PCDHB2Q9Y5E7 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
PCDHB2Q9Y5E7 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
PCDHB2Q9Y5E7 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
PCDHB2Q9Y5E7 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
PCDHB2Q9Y5E7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
PCDHB2Q9Y5E7 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
PCDHB2Q9Y5E7 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
PCDHB2Q9Y5E7 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms