Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4H4

GPSM3, G-protein-signaling modulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPSM3Q9Y4H4 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC33.85■■■■□ 3.01
GPSM3Q9Y4H4 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
GPSM3Q9Y4H4 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
GPSM3Q9Y4H4 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
GPSM3Q9Y4H4 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
GPSM3Q9Y4H4 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
GPSM3Q9Y4H4 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
GPSM3Q9Y4H4 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
GPSM3Q9Y4H4 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
GPSM3Q9Y4H4 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.69
GPSM3Q9Y4H4 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
GPSM3Q9Y4H4 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
GPSM3Q9Y4H4 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
GPSM3Q9Y4H4 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
GPSM3Q9Y4H4 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
GPSM3Q9Y4H4 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
GPSM3Q9Y4H4 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
GPSM3Q9Y4H4 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
GPSM3Q9Y4H4 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
GPSM3Q9Y4H4 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
GPSM3Q9Y4H4 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
GPSM3Q9Y4H4 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
GPSM3Q9Y4H4 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
GPSM3Q9Y4H4 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
GPSM3Q9Y4H4 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
GPSM3Q9Y4H4 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
GPSM3Q9Y4H4 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
GPSM3Q9Y4H4 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
GPSM3Q9Y4H4 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
GPSM3Q9Y4H4 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
GPSM3Q9Y4H4 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
GPSM3Q9Y4H4 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
GPSM3Q9Y4H4 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
GPSM3Q9Y4H4 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
GPSM3Q9Y4H4 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
GPSM3Q9Y4H4 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
GPSM3Q9Y4H4 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
GPSM3Q9Y4H4 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
GPSM3Q9Y4H4 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
GPSM3Q9Y4H4 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
GPSM3Q9Y4H4 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
GPSM3Q9Y4H4 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
GPSM3Q9Y4H4 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
GPSM3Q9Y4H4 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
GPSM3Q9Y4H4 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
GPSM3Q9Y4H4 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
GPSM3Q9Y4H4 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
GPSM3Q9Y4H4 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
GPSM3Q9Y4H4 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
GPSM3Q9Y4H4 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
GPSM3Q9Y4H4 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
GPSM3Q9Y4H4 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
GPSM3Q9Y4H4 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
GPSM3Q9Y4H4 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
GPSM3Q9Y4H4 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
GPSM3Q9Y4H4 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
GPSM3Q9Y4H4 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
GPSM3Q9Y4H4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
GPSM3Q9Y4H4 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
GPSM3Q9Y4H4 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
GPSM3Q9Y4H4 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
GPSM3Q9Y4H4 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
GPSM3Q9Y4H4 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
GPSM3Q9Y4H4 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
GPSM3Q9Y4H4 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GPSM3Q9Y4H4 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GPSM3Q9Y4H4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
GPSM3Q9Y4H4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GPSM3Q9Y4H4 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
GPSM3Q9Y4H4 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
GPSM3Q9Y4H4 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GPSM3Q9Y4H4 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GPSM3Q9Y4H4 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GPSM3Q9Y4H4 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
GPSM3Q9Y4H4 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GPSM3Q9Y4H4 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
GPSM3Q9Y4H4 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GPSM3Q9Y4H4 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
GPSM3Q9Y4H4 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GPSM3Q9Y4H4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
GPSM3Q9Y4H4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GPSM3Q9Y4H4 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GPSM3Q9Y4H4 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
GPSM3Q9Y4H4 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GPSM3Q9Y4H4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
GPSM3Q9Y4H4 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GPSM3Q9Y4H4 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GPSM3Q9Y4H4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GPSM3Q9Y4H4 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
GPSM3Q9Y4H4 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
GPSM3Q9Y4H4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GPSM3Q9Y4H4 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GPSM3Q9Y4H4 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GPSM3Q9Y4H4 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GPSM3Q9Y4H4 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GPSM3Q9Y4H4 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GPSM3Q9Y4H4 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GPSM3Q9Y4H4 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GPSM3Q9Y4H4 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GPSM3Q9Y4H4 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms