Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I1

NISCH, Nischarin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCHQ9Y2I1 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC82,01■■■■■ 10,72
NISCHQ9Y2I1 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC81,38■■■■■ 10,62
NISCHQ9Y2I1 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC80,22■■■■■ 10,43
NISCHQ9Y2I1 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC80,09■■■■■ 10,41
NISCHQ9Y2I1 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC79,3■■■■■ 10,29
NISCHQ9Y2I1 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC78,79■■■■■ 10,2
NISCHQ9Y2I1 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC78,46■■■■■ 10,15
NISCHQ9Y2I1 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC78,16■■■■■ 10,1
NISCHQ9Y2I1 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC77,76■■■■■ 10,04
NISCHQ9Y2I1 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC77,48■■■■■ 9,99
NISCHQ9Y2I1 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC77,34■■■■■ 9,97
NISCHQ9Y2I1 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC77,32■■■■■ 9,97
NISCHQ9Y2I1 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC77,15■■■■■ 9,94
NISCHQ9Y2I1 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC76,88■■■■■ 9,9
NISCHQ9Y2I1 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC76,47■■■■■ 9,83
NISCHQ9Y2I1 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC76,38■■■■■ 9,82
NISCHQ9Y2I1 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC76,36■■■■■ 9,81
NISCHQ9Y2I1 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC76,33■■■■■ 9,81
NISCHQ9Y2I1 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC76,26■■■■■ 9,8
NISCHQ9Y2I1 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC75,47■■■■■ 9,67
NISCHQ9Y2I1 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC75,29■■■■■ 9,64
NISCHQ9Y2I1 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC75,29■■■■■ 9,64
NISCHQ9Y2I1 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC75,24■■■■■ 9,64
NISCHQ9Y2I1 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC75,02■■■■■ 9,6
NISCHQ9Y2I1 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC75■■■■■ 9,6
NISCHQ9Y2I1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC74,96■■■■■ 9,59
NISCHQ9Y2I1 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC74,94■■■■■ 9,59
NISCHQ9Y2I1 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC74,82■■■■■ 9,57
NISCHQ9Y2I1 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC74,78■■■■■ 9,56
NISCHQ9Y2I1 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC74,68■■■■■ 9,55
NISCHQ9Y2I1 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC74,56■■■■■ 9,53
NISCHQ9Y2I1 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC74,34■■■■■ 9,49
NISCHQ9Y2I1 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC74,06■■■■■ 9,45
NISCHQ9Y2I1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC74,03■■■■■ 9,44
NISCHQ9Y2I1 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC74,03■■■■■ 9,44
NISCHQ9Y2I1 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC73,62■■■■■ 9,38
NISCHQ9Y2I1 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC73,59■■■■■ 9,37
NISCHQ9Y2I1 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC73,45■■■■■ 9,35
NISCHQ9Y2I1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC73,1■■■■■ 9,29
NISCHQ9Y2I1 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC73,05■■■■■ 9,28
NISCHQ9Y2I1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC72,84■■■■■ 9,25
NISCHQ9Y2I1 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC72,68■■■■■ 9,22
NISCHQ9Y2I1 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC72,57■■■■■ 9,21
NISCHQ9Y2I1 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC72,35■■■■■ 9,17
NISCHQ9Y2I1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC72,3■■■■■ 9,17
NISCHQ9Y2I1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC72,3■■■■■ 9,16
NISCHQ9Y2I1 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC72,21■■■■■ 9,15
NISCHQ9Y2I1 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC72,09■■■■■ 9,13
NISCHQ9Y2I1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC71,83■■■■■ 9,09
NISCHQ9Y2I1 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC71,83■■■■■ 9,09
NISCHQ9Y2I1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC71,83■■■■■ 9,09
NISCHQ9Y2I1 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC71,82■■■■■ 9,09
NISCHQ9Y2I1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC71,75■■■■■ 9,08
NISCHQ9Y2I1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC71,69■■■■■ 9,07
NISCHQ9Y2I1 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC71,62■■■■■ 9,06
NISCHQ9Y2I1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC71,54■■■■■ 9,04
NISCHQ9Y2I1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC71,48■■■■■ 9,03
NISCHQ9Y2I1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC71,45■■■■■ 9,03
NISCHQ9Y2I1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC71,43■■■■■ 9,03
NISCHQ9Y2I1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC71,31■■■■■ 9,01
NISCHQ9Y2I1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC71,31■■■■■ 9,01
NISCHQ9Y2I1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC71,31■■■■■ 9,01
NISCHQ9Y2I1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC71,26■■■■■ 9
NISCHQ9Y2I1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC71,19■■■■■ 8,99
NISCHQ9Y2I1 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC71■■■■■ 8,96
NISCHQ9Y2I1 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC70,94■■■■■ 8,95
NISCHQ9Y2I1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC70,94■■■■■ 8,95
NISCHQ9Y2I1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC70,93■■■■■ 8,95
NISCHQ9Y2I1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC70,85■■■■■ 8,93
NISCHQ9Y2I1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC70,77■■■■■ 8,92
NISCHQ9Y2I1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC70,77■■■■■ 8,92
NISCHQ9Y2I1 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC70,72■■■■■ 8,91
NISCHQ9Y2I1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC70,69■■■■■ 8,91
NISCHQ9Y2I1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC70,68■■■■■ 8,91
NISCHQ9Y2I1 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC70,65■■■■■ 8,9
NISCHQ9Y2I1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC70,53■■■■■ 8,88
NISCHQ9Y2I1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC70,52■■■■■ 8,88
NISCHQ9Y2I1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC70,51■■■■■ 8,88
NISCHQ9Y2I1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC70,51■■■■■ 8,88
NISCHQ9Y2I1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC70,49■■■■■ 8,87
NISCHQ9Y2I1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC70,49■■■■■ 8,87
NISCHQ9Y2I1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC70,48■■■■■ 8,87
NISCHQ9Y2I1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC70,42■■■■■ 8,86
NISCHQ9Y2I1 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC70,33■■■■■ 8,85
NISCHQ9Y2I1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC70,25■■■■■ 8,84
NISCHQ9Y2I1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC70,17■■■■■ 8,82
NISCHQ9Y2I1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC70,16■■■■■ 8,82
NISCHQ9Y2I1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC70,13■■■■■ 8,82
NISCHQ9Y2I1 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC70,13■■■■■ 8,82
NISCHQ9Y2I1 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC70,08■■■■■ 8,81
NISCHQ9Y2I1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC70,02■■■■■ 8,8
NISCHQ9Y2I1 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC69,95■■■■■ 8,79
NISCHQ9Y2I1 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC69,92■■■■■ 8,78
NISCHQ9Y2I1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC69,91■■■■■ 8,78
NISCHQ9Y2I1 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC69,81■■■■■ 8,77
NISCHQ9Y2I1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC69,79■■■■■ 8,76
NISCHQ9Y2I1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC69,79■■■■■ 8,76
NISCHQ9Y2I1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC69,78■■■■■ 8,76
NISCHQ9Y2I1 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC69,74■■■■■ 8,75
NISCHQ9Y2I1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC69,71■■■■■ 8,75
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