Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I1

NISCH, Nischarin, humanhuman

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Length 1,504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCHQ9Y2I1 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC82.01■■■■■ 10.72
NISCHQ9Y2I1 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC81.38■■■■■ 10.62
NISCHQ9Y2I1 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC80.22■■■■■ 10.43
NISCHQ9Y2I1 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC80.09■■■■■ 10.41
NISCHQ9Y2I1 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC79.3■■■■■ 10.29
NISCHQ9Y2I1 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC78.79■■■■■ 10.2
NISCHQ9Y2I1 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC78.46■■■■■ 10.15
NISCHQ9Y2I1 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC78.16■■■■■ 10.1
NISCHQ9Y2I1 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC77.76■■■■■ 10.04
NISCHQ9Y2I1 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC77.48■■■■■ 9.99
NISCHQ9Y2I1 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC77.34■■■■■ 9.97
NISCHQ9Y2I1 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC77.32■■■■■ 9.97
NISCHQ9Y2I1 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC77.15■■■■■ 9.94
NISCHQ9Y2I1 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC76.88■■■■■ 9.9
NISCHQ9Y2I1 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC76.47■■■■■ 9.83
NISCHQ9Y2I1 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC76.38■■■■■ 9.82
NISCHQ9Y2I1 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC76.36■■■■■ 9.81
NISCHQ9Y2I1 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC76.33■■■■■ 9.81
NISCHQ9Y2I1 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC76.26■■■■■ 9.8
NISCHQ9Y2I1 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC75.47■■■■■ 9.67
NISCHQ9Y2I1 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC75.29■■■■■ 9.64
NISCHQ9Y2I1 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC75.29■■■■■ 9.64
NISCHQ9Y2I1 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC75.24■■■■■ 9.64
NISCHQ9Y2I1 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC75.02■■■■■ 9.6
NISCHQ9Y2I1 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC75■■■■■ 9.6
NISCHQ9Y2I1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC74.96■■■■■ 9.59
NISCHQ9Y2I1 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC74.94■■■■■ 9.59
NISCHQ9Y2I1 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC74.82■■■■■ 9.57
NISCHQ9Y2I1 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC74.78■■■■■ 9.56
NISCHQ9Y2I1 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC74.68■■■■■ 9.55
NISCHQ9Y2I1 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC74.56■■■■■ 9.53
NISCHQ9Y2I1 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC74.34■■■■■ 9.49
NISCHQ9Y2I1 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC74.06■■■■■ 9.45
NISCHQ9Y2I1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC74.03■■■■■ 9.44
NISCHQ9Y2I1 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC74.03■■■■■ 9.44
NISCHQ9Y2I1 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC73.62■■■■■ 9.38
NISCHQ9Y2I1 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC73.59■■■■■ 9.37
NISCHQ9Y2I1 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC73.45■■■■■ 9.35
NISCHQ9Y2I1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC73.1■■■■■ 9.29
NISCHQ9Y2I1 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC73.05■■■■■ 9.28
NISCHQ9Y2I1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC72.84■■■■■ 9.25
NISCHQ9Y2I1 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC72.68■■■■■ 9.22
NISCHQ9Y2I1 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC72.57■■■■■ 9.21
NISCHQ9Y2I1 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC72.35■■■■■ 9.17
NISCHQ9Y2I1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC72.3■■■■■ 9.17
NISCHQ9Y2I1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC72.3■■■■■ 9.16
NISCHQ9Y2I1 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC72.21■■■■■ 9.15
NISCHQ9Y2I1 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC72.09■■■■■ 9.13
NISCHQ9Y2I1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC71.83■■■■■ 9.09
NISCHQ9Y2I1 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC71.83■■■■■ 9.09
NISCHQ9Y2I1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC71.83■■■■■ 9.09
NISCHQ9Y2I1 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC71.82■■■■■ 9.09
NISCHQ9Y2I1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC71.75■■■■■ 9.08
NISCHQ9Y2I1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC71.69■■■■■ 9.07
NISCHQ9Y2I1 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC71.62■■■■■ 9.06
NISCHQ9Y2I1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC71.54■■■■■ 9.04
NISCHQ9Y2I1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC71.48■■■■■ 9.03
NISCHQ9Y2I1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC71.45■■■■■ 9.03
NISCHQ9Y2I1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC71.43■■■■■ 9.03
NISCHQ9Y2I1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC71.31■■■■■ 9.01
NISCHQ9Y2I1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC71.31■■■■■ 9.01
NISCHQ9Y2I1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC71.31■■■■■ 9.01
NISCHQ9Y2I1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC71.26■■■■■ 9
NISCHQ9Y2I1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC71.19■■■■■ 8.99
NISCHQ9Y2I1 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC71■■■■■ 8.96
NISCHQ9Y2I1 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC70.94■■■■■ 8.95
NISCHQ9Y2I1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC70.94■■■■■ 8.95
NISCHQ9Y2I1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC70.93■■■■■ 8.95
NISCHQ9Y2I1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC70.85■■■■■ 8.93
NISCHQ9Y2I1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC70.77■■■■■ 8.92
NISCHQ9Y2I1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC70.77■■■■■ 8.92
NISCHQ9Y2I1 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC70.72■■■■■ 8.91
NISCHQ9Y2I1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC70.69■■■■■ 8.91
NISCHQ9Y2I1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC70.68■■■■■ 8.91
NISCHQ9Y2I1 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC70.65■■■■■ 8.9
NISCHQ9Y2I1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC70.53■■■■■ 8.88
NISCHQ9Y2I1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC70.52■■■■■ 8.88
NISCHQ9Y2I1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC70.51■■■■■ 8.88
NISCHQ9Y2I1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC70.51■■■■■ 8.88
NISCHQ9Y2I1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC70.49■■■■■ 8.87
NISCHQ9Y2I1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC70.49■■■■■ 8.87
NISCHQ9Y2I1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC70.48■■■■■ 8.87
NISCHQ9Y2I1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC70.42■■■■■ 8.86
NISCHQ9Y2I1 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC70.33■■■■■ 8.85
NISCHQ9Y2I1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC70.25■■■■■ 8.84
NISCHQ9Y2I1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC70.17■■■■■ 8.82
NISCHQ9Y2I1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC70.16■■■■■ 8.82
NISCHQ9Y2I1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC70.13■■■■■ 8.82
NISCHQ9Y2I1 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC70.13■■■■■ 8.82
NISCHQ9Y2I1 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC70.08■■■■■ 8.81
NISCHQ9Y2I1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC70.02■■■■■ 8.8
NISCHQ9Y2I1 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC69.95■■■■■ 8.79
NISCHQ9Y2I1 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC69.92■■■■■ 8.78
NISCHQ9Y2I1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC69.91■■■■■ 8.78
NISCHQ9Y2I1 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC69.81■■■■■ 8.77
NISCHQ9Y2I1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC69.79■■■■■ 8.76
NISCHQ9Y2I1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC69.79■■■■■ 8.76
NISCHQ9Y2I1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC69.78■■■■■ 8.76
NISCHQ9Y2I1 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC69.74■■■■■ 8.75
NISCHQ9Y2I1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC69.71■■■■■ 8.75
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