Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL01

DSE, Dermatan-sulfate epimerase, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSEQ9UL01 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC36.77■■■■□ 3.48
DSEQ9UL01 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
DSEQ9UL01 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC35.73■■■■□ 3.31
DSEQ9UL01 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
DSEQ9UL01 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
DSEQ9UL01 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
DSEQ9UL01 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
DSEQ9UL01 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
DSEQ9UL01 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
DSEQ9UL01 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
DSEQ9UL01 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
DSEQ9UL01 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
DSEQ9UL01 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
DSEQ9UL01 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
DSEQ9UL01 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
DSEQ9UL01 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
DSEQ9UL01 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
DSEQ9UL01 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
DSEQ9UL01 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
DSEQ9UL01 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
DSEQ9UL01 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
DSEQ9UL01 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
DSEQ9UL01 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
DSEQ9UL01 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
DSEQ9UL01 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
DSEQ9UL01 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
DSEQ9UL01 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
DSEQ9UL01 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
DSEQ9UL01 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
DSEQ9UL01 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
DSEQ9UL01 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
DSEQ9UL01 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
DSEQ9UL01 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
DSEQ9UL01 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
DSEQ9UL01 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
DSEQ9UL01 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
DSEQ9UL01 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
DSEQ9UL01 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
DSEQ9UL01 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
DSEQ9UL01 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
DSEQ9UL01 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
DSEQ9UL01 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
DSEQ9UL01 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
DSEQ9UL01 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
DSEQ9UL01 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
DSEQ9UL01 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
DSEQ9UL01 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
DSEQ9UL01 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
DSEQ9UL01 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
DSEQ9UL01 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
DSEQ9UL01 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
DSEQ9UL01 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
DSEQ9UL01 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
DSEQ9UL01 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
DSEQ9UL01 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
DSEQ9UL01 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
DSEQ9UL01 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
DSEQ9UL01 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
DSEQ9UL01 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
DSEQ9UL01 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
DSEQ9UL01 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.83■■■□□ 2.69
DSEQ9UL01 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
DSEQ9UL01 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
DSEQ9UL01 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
DSEQ9UL01 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC31.7■■■□□ 2.67
DSEQ9UL01 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
DSEQ9UL01 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
DSEQ9UL01 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
DSEQ9UL01 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
DSEQ9UL01 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
DSEQ9UL01 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
DSEQ9UL01 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
DSEQ9UL01 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
DSEQ9UL01 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
DSEQ9UL01 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
DSEQ9UL01 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
DSEQ9UL01 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
DSEQ9UL01 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
DSEQ9UL01 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
DSEQ9UL01 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
DSEQ9UL01 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
DSEQ9UL01 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
DSEQ9UL01 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
DSEQ9UL01 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
DSEQ9UL01 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
DSEQ9UL01 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
DSEQ9UL01 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
DSEQ9UL01 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
DSEQ9UL01 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
DSEQ9UL01 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
DSEQ9UL01 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
DSEQ9UL01 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
DSEQ9UL01 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
DSEQ9UL01 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
DSEQ9UL01 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
DSEQ9UL01 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
DSEQ9UL01 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
DSEQ9UL01 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
DSEQ9UL01 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
DSEQ9UL01 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms