Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL4

GJD2, Gap junction delta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD2Q9UKL4 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC39.75■■■■□ 3.95
GJD2Q9UKL4 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC39.47■■■■□ 3.91
GJD2Q9UKL4 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.94■■■■□ 3.82
GJD2Q9UKL4 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
GJD2Q9UKL4 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
GJD2Q9UKL4 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
GJD2Q9UKL4 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
GJD2Q9UKL4 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC37.79■■■■□ 3.64
GJD2Q9UKL4 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
GJD2Q9UKL4 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC37.55■■■■□ 3.6
GJD2Q9UKL4 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
GJD2Q9UKL4 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
GJD2Q9UKL4 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
GJD2Q9UKL4 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC37.38■■■■□ 3.57
GJD2Q9UKL4 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
GJD2Q9UKL4 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
GJD2Q9UKL4 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
GJD2Q9UKL4 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
GJD2Q9UKL4 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
GJD2Q9UKL4 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
GJD2Q9UKL4 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
GJD2Q9UKL4 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC36.47■■■■□ 3.43
GJD2Q9UKL4 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
GJD2Q9UKL4 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
GJD2Q9UKL4 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
GJD2Q9UKL4 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
GJD2Q9UKL4 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
GJD2Q9UKL4 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
GJD2Q9UKL4 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
GJD2Q9UKL4 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
GJD2Q9UKL4 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
GJD2Q9UKL4 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
GJD2Q9UKL4 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
GJD2Q9UKL4 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
GJD2Q9UKL4 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC35.86■■■■□ 3.33
GJD2Q9UKL4 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
GJD2Q9UKL4 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
GJD2Q9UKL4 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
GJD2Q9UKL4 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
GJD2Q9UKL4 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
GJD2Q9UKL4 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
GJD2Q9UKL4 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
GJD2Q9UKL4 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
GJD2Q9UKL4 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
GJD2Q9UKL4 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
GJD2Q9UKL4 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
GJD2Q9UKL4 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
GJD2Q9UKL4 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
GJD2Q9UKL4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
GJD2Q9UKL4 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
GJD2Q9UKL4 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
GJD2Q9UKL4 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
GJD2Q9UKL4 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC34.79■■■■□ 3.16
GJD2Q9UKL4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
GJD2Q9UKL4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
GJD2Q9UKL4 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
GJD2Q9UKL4 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
GJD2Q9UKL4 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
GJD2Q9UKL4 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
GJD2Q9UKL4 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
GJD2Q9UKL4 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
GJD2Q9UKL4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC34.57■■■■□ 3.12
GJD2Q9UKL4 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
GJD2Q9UKL4 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
GJD2Q9UKL4 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
GJD2Q9UKL4 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
GJD2Q9UKL4 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
GJD2Q9UKL4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
GJD2Q9UKL4 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
GJD2Q9UKL4 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
GJD2Q9UKL4 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
GJD2Q9UKL4 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
GJD2Q9UKL4 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
GJD2Q9UKL4 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
GJD2Q9UKL4 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
GJD2Q9UKL4 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
GJD2Q9UKL4 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
GJD2Q9UKL4 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
GJD2Q9UKL4 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
GJD2Q9UKL4 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
GJD2Q9UKL4 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
GJD2Q9UKL4 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
GJD2Q9UKL4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC34.14■■■■□ 3.06
GJD2Q9UKL4 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC34.1■■■■□ 3.05
GJD2Q9UKL4 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
GJD2Q9UKL4 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
GJD2Q9UKL4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
GJD2Q9UKL4 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
GJD2Q9UKL4 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
GJD2Q9UKL4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
GJD2Q9UKL4 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
GJD2Q9UKL4 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
GJD2Q9UKL4 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
GJD2Q9UKL4 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
GJD2Q9UKL4 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
GJD2Q9UKL4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
GJD2Q9UKL4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
GJD2Q9UKL4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
GJD2Q9UKL4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
GJD2Q9UKL4 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms