Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKE5

TNIK, TRAF2 and NCK-interacting protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIKQ9UKE5 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC55.76■■■■■ 6.52
TNIKQ9UKE5 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC55.74■■■■■ 6.51
TNIKQ9UKE5 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC55■■■■■ 6.39
TNIKQ9UKE5 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.56■■■■■ 6.33
TNIKQ9UKE5 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.51■■■■■ 6.32
TNIKQ9UKE5 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC53.98■■■■■ 6.23
TNIKQ9UKE5 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC53.93■■■■■ 6.22
TNIKQ9UKE5 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.9■■■■■ 6.22
TNIKQ9UKE5 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC53.23■■■■■ 6.11
TNIKQ9UKE5 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC53.07■■■■■ 6.09
TNIKQ9UKE5 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC53.06■■■■■ 6.08
TNIKQ9UKE5 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC52.94■■■■■ 6.06
TNIKQ9UKE5 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC52.85■■■■■ 6.05
TNIKQ9UKE5 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC52.74■■■■■ 6.03
TNIKQ9UKE5 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC52.71■■■■■ 6.03
TNIKQ9UKE5 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.53■■■■■ 6
TNIKQ9UKE5 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC52.51■■■■■ 6
TNIKQ9UKE5 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC52.47■■■■■ 5.99
TNIKQ9UKE5 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.31■■■■■ 5.96
TNIKQ9UKE5 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC51.97■■■■■ 5.91
TNIKQ9UKE5 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC51.97■■■■■ 5.91
TNIKQ9UKE5 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC51.93■■■■■ 5.9
TNIKQ9UKE5 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.74■■■■■ 5.87
TNIKQ9UKE5 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC51.66■■■■■ 5.86
TNIKQ9UKE5 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC51.58■■■■■ 5.85
TNIKQ9UKE5 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.53■■■■■ 5.84
TNIKQ9UKE5 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC51.53■■■■■ 5.84
TNIKQ9UKE5 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC51.42■■■■■ 5.82
TNIKQ9UKE5 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.4■■■■■ 5.82
TNIKQ9UKE5 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.32■■■■■ 5.81
TNIKQ9UKE5 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC51.29■■■■■ 5.8
TNIKQ9UKE5 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC51.11■■■■■ 5.77
TNIKQ9UKE5 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC51.11■■■■■ 5.77
TNIKQ9UKE5 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC50.89■■■■■ 5.74
TNIKQ9UKE5 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC50.84■■■■■ 5.73
TNIKQ9UKE5 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC50.73■■■■■ 5.71
TNIKQ9UKE5 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.59■■■■■ 5.69
TNIKQ9UKE5 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.35■■■■■ 5.65
TNIKQ9UKE5 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC50.33■■■■■ 5.65
TNIKQ9UKE5 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC50.31■■■■■ 5.64
TNIKQ9UKE5 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.3■■■■■ 5.64
TNIKQ9UKE5 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC50.2■■■■■ 5.63
TNIKQ9UKE5 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC50.13■■■■■ 5.62
TNIKQ9UKE5 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC50.1■■■■■ 5.61
TNIKQ9UKE5 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC49.72■■■■■ 5.55
TNIKQ9UKE5 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC49.68■■■■■ 5.54
TNIKQ9UKE5 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC49.63■■■■■ 5.54
TNIKQ9UKE5 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC49.62■■■■■ 5.53
TNIKQ9UKE5 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.53■■■■■ 5.52
TNIKQ9UKE5 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC49.45■■■■■ 5.51
TNIKQ9UKE5 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC49.34■■■■■ 5.49
TNIKQ9UKE5 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC49.29■■■■■ 5.48
TNIKQ9UKE5 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC49.27■■■■■ 5.48
TNIKQ9UKE5 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC49.26■■■■■ 5.48
TNIKQ9UKE5 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC49.26■■■■■ 5.48
TNIKQ9UKE5 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC49.22■■■■■ 5.47
TNIKQ9UKE5 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.2■■■■■ 5.47
TNIKQ9UKE5 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC49.16■■■■■ 5.46
TNIKQ9UKE5 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.15■■■■■ 5.46
TNIKQ9UKE5 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC49.13■■■■■ 5.46
TNIKQ9UKE5 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC49.1■■■■■ 5.45
TNIKQ9UKE5 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC49.1■■■■■ 5.45
TNIKQ9UKE5 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC49.07■■■■■ 5.45
TNIKQ9UKE5 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC49.05■■■■■ 5.44
TNIKQ9UKE5 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.03■■■■■ 5.44
TNIKQ9UKE5 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC49.01■■■■■ 5.44
TNIKQ9UKE5 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC48.97■■■■■ 5.43
TNIKQ9UKE5 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC48.95■■■■■ 5.43
TNIKQ9UKE5 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC48.95■■■■■ 5.43
TNIKQ9UKE5 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC48.93■■■■■ 5.42
TNIKQ9UKE5 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC48.92■■■■■ 5.42
TNIKQ9UKE5 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC48.66■■■■■ 5.38
TNIKQ9UKE5 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC48.66■■■■■ 5.38
TNIKQ9UKE5 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC48.63■■■■■ 5.38
TNIKQ9UKE5 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC48.62■■■■■ 5.37
TNIKQ9UKE5 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.58■■■■■ 5.37
TNIKQ9UKE5 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.58■■■■■ 5.37
TNIKQ9UKE5 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.56■■■■■ 5.36
TNIKQ9UKE5 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC48.52■■■■■ 5.36
TNIKQ9UKE5 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC48.51■■■■■ 5.36
TNIKQ9UKE5 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC48.51■■■■■ 5.36
TNIKQ9UKE5 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.46■■■■■ 5.35
TNIKQ9UKE5 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.44■■■■■ 5.35
TNIKQ9UKE5 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.35■■■■■ 5.33
TNIKQ9UKE5 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC48.33■■■■■ 5.33
TNIKQ9UKE5 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC48.33■■■■■ 5.33
TNIKQ9UKE5 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.31■■■■■ 5.32
TNIKQ9UKE5 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.3■■■■■ 5.32
TNIKQ9UKE5 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.28■■■■■ 5.32
TNIKQ9UKE5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC48.25■■■■■ 5.31
TNIKQ9UKE5 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.25■■■■■ 5.31
TNIKQ9UKE5 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC48.25■■■■■ 5.31
TNIKQ9UKE5 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC48.16■■■■■ 5.3
TNIKQ9UKE5 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC48.15■■■■■ 5.3
TNIKQ9UKE5 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC48.11■■■■■ 5.29
TNIKQ9UKE5 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.05■■■■■ 5.28
TNIKQ9UKE5 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.03■■■■■ 5.28
TNIKQ9UKE5 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC48■■■■■ 5.28
TNIKQ9UKE5 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48■■■■■ 5.28
TNIKQ9UKE5 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC47.96■■■■■ 5.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms