Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJW3

DNMT3L, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3-like, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3LQ9UJW3 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC35.86■■■■□ 3.33
DNMT3LQ9UJW3 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
DNMT3LQ9UJW3 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
DNMT3LQ9UJW3 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC34.77■■■■□ 3.16
DNMT3LQ9UJW3 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
DNMT3LQ9UJW3 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
DNMT3LQ9UJW3 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
DNMT3LQ9UJW3 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
DNMT3LQ9UJW3 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
DNMT3LQ9UJW3 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
DNMT3LQ9UJW3 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
DNMT3LQ9UJW3 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
DNMT3LQ9UJW3 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
DNMT3LQ9UJW3 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
DNMT3LQ9UJW3 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
DNMT3LQ9UJW3 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
DNMT3LQ9UJW3 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
DNMT3LQ9UJW3 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
DNMT3LQ9UJW3 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
DNMT3LQ9UJW3 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
DNMT3LQ9UJW3 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
DNMT3LQ9UJW3 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
DNMT3LQ9UJW3 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
DNMT3LQ9UJW3 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
DNMT3LQ9UJW3 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
DNMT3LQ9UJW3 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
DNMT3LQ9UJW3 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
DNMT3LQ9UJW3 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
DNMT3LQ9UJW3 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
DNMT3LQ9UJW3 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
DNMT3LQ9UJW3 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
DNMT3LQ9UJW3 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
DNMT3LQ9UJW3 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
DNMT3LQ9UJW3 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
DNMT3LQ9UJW3 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
DNMT3LQ9UJW3 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
DNMT3LQ9UJW3 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
DNMT3LQ9UJW3 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
DNMT3LQ9UJW3 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC31.79■■■□□ 2.68
DNMT3LQ9UJW3 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
DNMT3LQ9UJW3 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
DNMT3LQ9UJW3 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
DNMT3LQ9UJW3 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
DNMT3LQ9UJW3 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
DNMT3LQ9UJW3 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
DNMT3LQ9UJW3 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
DNMT3LQ9UJW3 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
DNMT3LQ9UJW3 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
DNMT3LQ9UJW3 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
DNMT3LQ9UJW3 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
DNMT3LQ9UJW3 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
DNMT3LQ9UJW3 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
DNMT3LQ9UJW3 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.29■■■□□ 2.6
DNMT3LQ9UJW3 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
DNMT3LQ9UJW3 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
DNMT3LQ9UJW3 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
DNMT3LQ9UJW3 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
DNMT3LQ9UJW3 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
DNMT3LQ9UJW3 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
DNMT3LQ9UJW3 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
DNMT3LQ9UJW3 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
DNMT3LQ9UJW3 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
DNMT3LQ9UJW3 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
DNMT3LQ9UJW3 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
DNMT3LQ9UJW3 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC30.92■■■□□ 2.54
DNMT3LQ9UJW3 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
DNMT3LQ9UJW3 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
DNMT3LQ9UJW3 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
DNMT3LQ9UJW3 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
DNMT3LQ9UJW3 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
DNMT3LQ9UJW3 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
DNMT3LQ9UJW3 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
DNMT3LQ9UJW3 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
DNMT3LQ9UJW3 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
DNMT3LQ9UJW3 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
DNMT3LQ9UJW3 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
DNMT3LQ9UJW3 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
DNMT3LQ9UJW3 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
DNMT3LQ9UJW3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
DNMT3LQ9UJW3 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
DNMT3LQ9UJW3 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
DNMT3LQ9UJW3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
DNMT3LQ9UJW3 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
DNMT3LQ9UJW3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
DNMT3LQ9UJW3 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
DNMT3LQ9UJW3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
DNMT3LQ9UJW3 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
DNMT3LQ9UJW3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
DNMT3LQ9UJW3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
DNMT3LQ9UJW3 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
DNMT3LQ9UJW3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
DNMT3LQ9UJW3 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
DNMT3LQ9UJW3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
DNMT3LQ9UJW3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
DNMT3LQ9UJW3 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
DNMT3LQ9UJW3 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
DNMT3LQ9UJW3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
DNMT3LQ9UJW3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
DNMT3LQ9UJW3 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
DNMT3LQ9UJW3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms