Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW2

PLXNA1, Plexin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 1,896 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA1Q9UIW2 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC39.43■■■■□ 3.9
PLXNA1Q9UIW2 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC38.81■■■■□ 3.8
PLXNA1Q9UIW2 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
PLXNA1Q9UIW2 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.37■■■■□ 3.73
PLXNA1Q9UIW2 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
PLXNA1Q9UIW2 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
PLXNA1Q9UIW2 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
PLXNA1Q9UIW2 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC37.86■■■■□ 3.65
PLXNA1Q9UIW2 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
PLXNA1Q9UIW2 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC37.18■■■■□ 3.54
PLXNA1Q9UIW2 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC37.13■■■■□ 3.54
PLXNA1Q9UIW2 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
PLXNA1Q9UIW2 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
PLXNA1Q9UIW2 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
PLXNA1Q9UIW2 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
PLXNA1Q9UIW2 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
PLXNA1Q9UIW2 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
PLXNA1Q9UIW2 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
PLXNA1Q9UIW2 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
PLXNA1Q9UIW2 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.41
PLXNA1Q9UIW2 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
PLXNA1Q9UIW2 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
PLXNA1Q9UIW2 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
PLXNA1Q9UIW2 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
PLXNA1Q9UIW2 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
PLXNA1Q9UIW2 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
PLXNA1Q9UIW2 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
PLXNA1Q9UIW2 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC35.91■■■■□ 3.34
PLXNA1Q9UIW2 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
PLXNA1Q9UIW2 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
PLXNA1Q9UIW2 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
PLXNA1Q9UIW2 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
PLXNA1Q9UIW2 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
PLXNA1Q9UIW2 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
PLXNA1Q9UIW2 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC35.39■■■■□ 3.26
PLXNA1Q9UIW2 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
PLXNA1Q9UIW2 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
PLXNA1Q9UIW2 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
PLXNA1Q9UIW2 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
PLXNA1Q9UIW2 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
PLXNA1Q9UIW2 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
PLXNA1Q9UIW2 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
PLXNA1Q9UIW2 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
PLXNA1Q9UIW2 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
PLXNA1Q9UIW2 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
PLXNA1Q9UIW2 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
PLXNA1Q9UIW2 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
PLXNA1Q9UIW2 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
PLXNA1Q9UIW2 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
PLXNA1Q9UIW2 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
PLXNA1Q9UIW2 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
PLXNA1Q9UIW2 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
PLXNA1Q9UIW2 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
PLXNA1Q9UIW2 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
PLXNA1Q9UIW2 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
PLXNA1Q9UIW2 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
PLXNA1Q9UIW2 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
PLXNA1Q9UIW2 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
PLXNA1Q9UIW2 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
PLXNA1Q9UIW2 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
PLXNA1Q9UIW2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
PLXNA1Q9UIW2 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
PLXNA1Q9UIW2 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
PLXNA1Q9UIW2 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
PLXNA1Q9UIW2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
PLXNA1Q9UIW2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
PLXNA1Q9UIW2 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
PLXNA1Q9UIW2 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
PLXNA1Q9UIW2 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
PLXNA1Q9UIW2 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
PLXNA1Q9UIW2 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
PLXNA1Q9UIW2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
PLXNA1Q9UIW2 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
PLXNA1Q9UIW2 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
PLXNA1Q9UIW2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
PLXNA1Q9UIW2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
PLXNA1Q9UIW2 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
PLXNA1Q9UIW2 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
PLXNA1Q9UIW2 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
PLXNA1Q9UIW2 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
PLXNA1Q9UIW2 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
PLXNA1Q9UIW2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
PLXNA1Q9UIW2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PLXNA1Q9UIW2 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PLXNA1Q9UIW2 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
PLXNA1Q9UIW2 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
PLXNA1Q9UIW2 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC33.8■■■■□ 3
PLXNA1Q9UIW2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PLXNA1Q9UIW2 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
PLXNA1Q9UIW2 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
PLXNA1Q9UIW2 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
PLXNA1Q9UIW2 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
PLXNA1Q9UIW2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
PLXNA1Q9UIW2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PLXNA1Q9UIW2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
PLXNA1Q9UIW2 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
PLXNA1Q9UIW2 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
PLXNA1Q9UIW2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
PLXNA1Q9UIW2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
PLXNA1Q9UIW2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms