Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHY1

NRBP1, Nuclear receptor-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRBP1Q9UHY1 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC39.26■■■■□ 3.88
NRBP1Q9UHY1 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC38.95■■■■□ 3.83
NRBP1Q9UHY1 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.33■■■■□ 3.73
NRBP1Q9UHY1 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
NRBP1Q9UHY1 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
NRBP1Q9UHY1 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
NRBP1Q9UHY1 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
NRBP1Q9UHY1 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC37.44■■■■□ 3.58
NRBP1Q9UHY1 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC37.43■■■■□ 3.58
NRBP1Q9UHY1 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
NRBP1Q9UHY1 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC37.05■■■■□ 3.52
NRBP1Q9UHY1 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
NRBP1Q9UHY1 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
NRBP1Q9UHY1 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC36.86■■■■□ 3.49
NRBP1Q9UHY1 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
NRBP1Q9UHY1 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
NRBP1Q9UHY1 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
NRBP1Q9UHY1 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
NRBP1Q9UHY1 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
NRBP1Q9UHY1 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
NRBP1Q9UHY1 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
NRBP1Q9UHY1 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
NRBP1Q9UHY1 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
NRBP1Q9UHY1 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC36.13■■■■□ 3.37
NRBP1Q9UHY1 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
NRBP1Q9UHY1 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
NRBP1Q9UHY1 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
NRBP1Q9UHY1 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC35.94■■■■□ 3.34
NRBP1Q9UHY1 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
NRBP1Q9UHY1 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
NRBP1Q9UHY1 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
NRBP1Q9UHY1 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
NRBP1Q9UHY1 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
NRBP1Q9UHY1 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
NRBP1Q9UHY1 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
NRBP1Q9UHY1 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
NRBP1Q9UHY1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
NRBP1Q9UHY1 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC35.47■■■■□ 3.27
NRBP1Q9UHY1 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
NRBP1Q9UHY1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
NRBP1Q9UHY1 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC35.31■■■■□ 3.24
NRBP1Q9UHY1 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
NRBP1Q9UHY1 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
NRBP1Q9UHY1 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
NRBP1Q9UHY1 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
NRBP1Q9UHY1 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
NRBP1Q9UHY1 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
NRBP1Q9UHY1 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
NRBP1Q9UHY1 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
NRBP1Q9UHY1 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
NRBP1Q9UHY1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
NRBP1Q9UHY1 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
NRBP1Q9UHY1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
NRBP1Q9UHY1 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
NRBP1Q9UHY1 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
NRBP1Q9UHY1 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
NRBP1Q9UHY1 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
NRBP1Q9UHY1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
NRBP1Q9UHY1 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
NRBP1Q9UHY1 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
NRBP1Q9UHY1 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
NRBP1Q9UHY1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
NRBP1Q9UHY1 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
NRBP1Q9UHY1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
NRBP1Q9UHY1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
NRBP1Q9UHY1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
NRBP1Q9UHY1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
NRBP1Q9UHY1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
NRBP1Q9UHY1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
NRBP1Q9UHY1 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
NRBP1Q9UHY1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
NRBP1Q9UHY1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
NRBP1Q9UHY1 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
NRBP1Q9UHY1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
NRBP1Q9UHY1 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
NRBP1Q9UHY1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
NRBP1Q9UHY1 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
NRBP1Q9UHY1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
NRBP1Q9UHY1 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
NRBP1Q9UHY1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
NRBP1Q9UHY1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
NRBP1Q9UHY1 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
NRBP1Q9UHY1 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
NRBP1Q9UHY1 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
NRBP1Q9UHY1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
NRBP1Q9UHY1 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
NRBP1Q9UHY1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
NRBP1Q9UHY1 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
NRBP1Q9UHY1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
NRBP1Q9UHY1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
NRBP1Q9UHY1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
NRBP1Q9UHY1 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
NRBP1Q9UHY1 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
NRBP1Q9UHY1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
NRBP1Q9UHY1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
NRBP1Q9UHY1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
NRBP1Q9UHY1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
NRBP1Q9UHY1 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC33.73■■■□□ 2.99
NRBP1Q9UHY1 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.98
NRBP1Q9UHY1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms