Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN4

EHD2, EH domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD2Q9NZN4 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC36.16■■■■□ 3.38
EHD2Q9NZN4 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
EHD2Q9NZN4 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC35.23■■■■□ 3.23
EHD2Q9NZN4 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC35.22■■■■□ 3.23
EHD2Q9NZN4 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
EHD2Q9NZN4 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
EHD2Q9NZN4 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
EHD2Q9NZN4 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
EHD2Q9NZN4 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
EHD2Q9NZN4 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
EHD2Q9NZN4 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
EHD2Q9NZN4 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
EHD2Q9NZN4 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
EHD2Q9NZN4 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
EHD2Q9NZN4 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC33.91■■■■□ 3.02
EHD2Q9NZN4 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
EHD2Q9NZN4 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
EHD2Q9NZN4 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
EHD2Q9NZN4 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
EHD2Q9NZN4 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
EHD2Q9NZN4 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
EHD2Q9NZN4 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
EHD2Q9NZN4 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
EHD2Q9NZN4 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
EHD2Q9NZN4 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
EHD2Q9NZN4 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
EHD2Q9NZN4 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
EHD2Q9NZN4 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
EHD2Q9NZN4 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
EHD2Q9NZN4 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
EHD2Q9NZN4 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
EHD2Q9NZN4 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
EHD2Q9NZN4 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
EHD2Q9NZN4 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
EHD2Q9NZN4 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
EHD2Q9NZN4 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
EHD2Q9NZN4 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
EHD2Q9NZN4 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
EHD2Q9NZN4 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
EHD2Q9NZN4 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
EHD2Q9NZN4 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
EHD2Q9NZN4 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
EHD2Q9NZN4 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
EHD2Q9NZN4 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
EHD2Q9NZN4 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
EHD2Q9NZN4 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
EHD2Q9NZN4 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
EHD2Q9NZN4 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
EHD2Q9NZN4 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
EHD2Q9NZN4 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
EHD2Q9NZN4 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
EHD2Q9NZN4 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
EHD2Q9NZN4 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
EHD2Q9NZN4 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
EHD2Q9NZN4 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
EHD2Q9NZN4 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
EHD2Q9NZN4 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
EHD2Q9NZN4 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
EHD2Q9NZN4 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
EHD2Q9NZN4 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
EHD2Q9NZN4 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
EHD2Q9NZN4 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
EHD2Q9NZN4 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
EHD2Q9NZN4 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
EHD2Q9NZN4 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
EHD2Q9NZN4 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC31.86■■■□□ 2.69
EHD2Q9NZN4 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
EHD2Q9NZN4 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
EHD2Q9NZN4 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
EHD2Q9NZN4 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
EHD2Q9NZN4 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
EHD2Q9NZN4 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
EHD2Q9NZN4 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
EHD2Q9NZN4 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
EHD2Q9NZN4 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
EHD2Q9NZN4 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
EHD2Q9NZN4 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
EHD2Q9NZN4 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
EHD2Q9NZN4 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
EHD2Q9NZN4 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
EHD2Q9NZN4 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
EHD2Q9NZN4 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
EHD2Q9NZN4 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
EHD2Q9NZN4 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
EHD2Q9NZN4 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
EHD2Q9NZN4 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.61
EHD2Q9NZN4 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
EHD2Q9NZN4 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
EHD2Q9NZN4 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
EHD2Q9NZN4 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
EHD2Q9NZN4 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC31.18■■■□□ 2.58
EHD2Q9NZN4 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
EHD2Q9NZN4 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
EHD2Q9NZN4 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
EHD2Q9NZN4 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
EHD2Q9NZN4 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
EHD2Q9NZN4 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
EHD2Q9NZN4 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
EHD2Q9NZN4 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
EHD2Q9NZN4 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms