Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZJ6

COQ3, Ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COQ3Q9NZJ6 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC30.6■■■□□ 2.49
COQ3Q9NZJ6 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
COQ3Q9NZJ6 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
COQ3Q9NZJ6 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
COQ3Q9NZJ6 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
COQ3Q9NZJ6 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
COQ3Q9NZJ6 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
COQ3Q9NZJ6 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
COQ3Q9NZJ6 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
COQ3Q9NZJ6 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
COQ3Q9NZJ6 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
COQ3Q9NZJ6 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
COQ3Q9NZJ6 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
COQ3Q9NZJ6 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
COQ3Q9NZJ6 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
COQ3Q9NZJ6 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
COQ3Q9NZJ6 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
COQ3Q9NZJ6 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
COQ3Q9NZJ6 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
COQ3Q9NZJ6 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
COQ3Q9NZJ6 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
COQ3Q9NZJ6 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
COQ3Q9NZJ6 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
COQ3Q9NZJ6 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
COQ3Q9NZJ6 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
COQ3Q9NZJ6 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
COQ3Q9NZJ6 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
COQ3Q9NZJ6 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
COQ3Q9NZJ6 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
COQ3Q9NZJ6 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
COQ3Q9NZJ6 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
COQ3Q9NZJ6 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
COQ3Q9NZJ6 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
COQ3Q9NZJ6 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
COQ3Q9NZJ6 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
COQ3Q9NZJ6 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.57■■■□□ 2
COQ3Q9NZJ6 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.54■■■□□ 2
COQ3Q9NZJ6 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
COQ3Q9NZJ6 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
COQ3Q9NZJ6 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
COQ3Q9NZJ6 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
COQ3Q9NZJ6 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
COQ3Q9NZJ6 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
COQ3Q9NZJ6 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
COQ3Q9NZJ6 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
COQ3Q9NZJ6 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
COQ3Q9NZJ6 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
COQ3Q9NZJ6 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
COQ3Q9NZJ6 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
COQ3Q9NZJ6 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
COQ3Q9NZJ6 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
COQ3Q9NZJ6 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
COQ3Q9NZJ6 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
COQ3Q9NZJ6 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
COQ3Q9NZJ6 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
COQ3Q9NZJ6 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
COQ3Q9NZJ6 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
COQ3Q9NZJ6 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
COQ3Q9NZJ6 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
COQ3Q9NZJ6 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
COQ3Q9NZJ6 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
COQ3Q9NZJ6 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
COQ3Q9NZJ6 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
COQ3Q9NZJ6 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
COQ3Q9NZJ6 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
COQ3Q9NZJ6 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
COQ3Q9NZJ6 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
COQ3Q9NZJ6 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
COQ3Q9NZJ6 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
COQ3Q9NZJ6 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
COQ3Q9NZJ6 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
COQ3Q9NZJ6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
COQ3Q9NZJ6 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
COQ3Q9NZJ6 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
COQ3Q9NZJ6 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
COQ3Q9NZJ6 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
COQ3Q9NZJ6 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
COQ3Q9NZJ6 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
COQ3Q9NZJ6 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
COQ3Q9NZJ6 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
COQ3Q9NZJ6 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
COQ3Q9NZJ6 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
COQ3Q9NZJ6 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
COQ3Q9NZJ6 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
COQ3Q9NZJ6 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
COQ3Q9NZJ6 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
COQ3Q9NZJ6 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
COQ3Q9NZJ6 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
COQ3Q9NZJ6 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
COQ3Q9NZJ6 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
COQ3Q9NZJ6 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
COQ3Q9NZJ6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
COQ3Q9NZJ6 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
COQ3Q9NZJ6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
COQ3Q9NZJ6 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
COQ3Q9NZJ6 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
COQ3Q9NZJ6 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
COQ3Q9NZJ6 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
COQ3Q9NZJ6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
COQ3Q9NZJ6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.9 ms