Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC36.14■■■■□ 3.38
COMMD8Q9NX08 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
COMMD8Q9NX08 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
COMMD8Q9NX08 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC35.07■■■■□ 3.2
COMMD8Q9NX08 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
COMMD8Q9NX08 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
COMMD8Q9NX08 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
COMMD8Q9NX08 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
COMMD8Q9NX08 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
COMMD8Q9NX08 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
COMMD8Q9NX08 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
COMMD8Q9NX08 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
COMMD8Q9NX08 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
COMMD8Q9NX08 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
COMMD8Q9NX08 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
COMMD8Q9NX08 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
COMMD8Q9NX08 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
COMMD8Q9NX08 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
COMMD8Q9NX08 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
COMMD8Q9NX08 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
COMMD8Q9NX08 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
COMMD8Q9NX08 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
COMMD8Q9NX08 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
COMMD8Q9NX08 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
COMMD8Q9NX08 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
COMMD8Q9NX08 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
COMMD8Q9NX08 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
COMMD8Q9NX08 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
COMMD8Q9NX08 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
COMMD8Q9NX08 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
COMMD8Q9NX08 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
COMMD8Q9NX08 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
COMMD8Q9NX08 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
COMMD8Q9NX08 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
COMMD8Q9NX08 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
COMMD8Q9NX08 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
COMMD8Q9NX08 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
COMMD8Q9NX08 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
COMMD8Q9NX08 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
COMMD8Q9NX08 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
COMMD8Q9NX08 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
COMMD8Q9NX08 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
COMMD8Q9NX08 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
COMMD8Q9NX08 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.69
COMMD8Q9NX08 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC31.75■■■□□ 2.67
COMMD8Q9NX08 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
COMMD8Q9NX08 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
COMMD8Q9NX08 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
COMMD8Q9NX08 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
COMMD8Q9NX08 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
COMMD8Q9NX08 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
COMMD8Q9NX08 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
COMMD8Q9NX08 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
COMMD8Q9NX08 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
COMMD8Q9NX08 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
COMMD8Q9NX08 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
COMMD8Q9NX08 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.34■■■□□ 2.61
COMMD8Q9NX08 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
COMMD8Q9NX08 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
COMMD8Q9NX08 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.61
COMMD8Q9NX08 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
COMMD8Q9NX08 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
COMMD8Q9NX08 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
COMMD8Q9NX08 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
COMMD8Q9NX08 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
COMMD8Q9NX08 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC31.14■■■□□ 2.58
COMMD8Q9NX08 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
COMMD8Q9NX08 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
COMMD8Q9NX08 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
COMMD8Q9NX08 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
COMMD8Q9NX08 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
COMMD8Q9NX08 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
COMMD8Q9NX08 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
COMMD8Q9NX08 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
COMMD8Q9NX08 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
COMMD8Q9NX08 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
COMMD8Q9NX08 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
COMMD8Q9NX08 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
COMMD8Q9NX08 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
COMMD8Q9NX08 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
COMMD8Q9NX08 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
COMMD8Q9NX08 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
COMMD8Q9NX08 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
COMMD8Q9NX08 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
COMMD8Q9NX08 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
COMMD8Q9NX08 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
COMMD8Q9NX08 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
COMMD8Q9NX08 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
COMMD8Q9NX08 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
COMMD8Q9NX08 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
COMMD8Q9NX08 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
COMMD8Q9NX08 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
COMMD8Q9NX08 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
COMMD8Q9NX08 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
COMMD8Q9NX08 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
COMMD8Q9NX08 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
COMMD8Q9NX08 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
COMMD8Q9NX08 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
COMMD8Q9NX08 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
COMMD8Q9NX08 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
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