Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS71

GKN1, Gastrokine-1, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKN1Q9NS71 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC35.86■■■■□ 3.33
GKN1Q9NS71 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC35.08■■■■□ 3.21
GKN1Q9NS71 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
GKN1Q9NS71 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
GKN1Q9NS71 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
GKN1Q9NS71 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
GKN1Q9NS71 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
GKN1Q9NS71 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
GKN1Q9NS71 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
GKN1Q9NS71 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
GKN1Q9NS71 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
GKN1Q9NS71 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
GKN1Q9NS71 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
GKN1Q9NS71 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
GKN1Q9NS71 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
GKN1Q9NS71 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
GKN1Q9NS71 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
GKN1Q9NS71 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
GKN1Q9NS71 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
GKN1Q9NS71 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
GKN1Q9NS71 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
GKN1Q9NS71 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
GKN1Q9NS71 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
GKN1Q9NS71 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
GKN1Q9NS71 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
GKN1Q9NS71 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
GKN1Q9NS71 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
GKN1Q9NS71 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
GKN1Q9NS71 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
GKN1Q9NS71 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
GKN1Q9NS71 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
GKN1Q9NS71 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
GKN1Q9NS71 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
GKN1Q9NS71 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
GKN1Q9NS71 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
GKN1Q9NS71 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
GKN1Q9NS71 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
GKN1Q9NS71 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
GKN1Q9NS71 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
GKN1Q9NS71 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
GKN1Q9NS71 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
GKN1Q9NS71 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC31.85■■■□□ 2.69
GKN1Q9NS71 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
GKN1Q9NS71 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
GKN1Q9NS71 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
GKN1Q9NS71 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
GKN1Q9NS71 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
GKN1Q9NS71 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
GKN1Q9NS71 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
GKN1Q9NS71 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
GKN1Q9NS71 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
GKN1Q9NS71 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
GKN1Q9NS71 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
GKN1Q9NS71 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
GKN1Q9NS71 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
GKN1Q9NS71 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
GKN1Q9NS71 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
GKN1Q9NS71 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.21■■■□□ 2.59
GKN1Q9NS71 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
GKN1Q9NS71 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
GKN1Q9NS71 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
GKN1Q9NS71 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
GKN1Q9NS71 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
GKN1Q9NS71 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
GKN1Q9NS71 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
GKN1Q9NS71 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
GKN1Q9NS71 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
GKN1Q9NS71 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
GKN1Q9NS71 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
GKN1Q9NS71 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
GKN1Q9NS71 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC30.9■■■□□ 2.54
GKN1Q9NS71 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
GKN1Q9NS71 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
GKN1Q9NS71 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
GKN1Q9NS71 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
GKN1Q9NS71 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
GKN1Q9NS71 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
GKN1Q9NS71 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
GKN1Q9NS71 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
GKN1Q9NS71 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
GKN1Q9NS71 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
GKN1Q9NS71 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
GKN1Q9NS71 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
GKN1Q9NS71 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
GKN1Q9NS71 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
GKN1Q9NS71 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
GKN1Q9NS71 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
GKN1Q9NS71 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
GKN1Q9NS71 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
GKN1Q9NS71 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
GKN1Q9NS71 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
GKN1Q9NS71 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
GKN1Q9NS71 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
GKN1Q9NS71 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
GKN1Q9NS71 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
GKN1Q9NS71 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
GKN1Q9NS71 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
GKN1Q9NS71 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
GKN1Q9NS71 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
GKN1Q9NS71 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.6 ms