Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR5

UBQLN4, Ubiquilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN4Q9NRR5 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.32■■■□□ 2.6
UBQLN4Q9NRR5 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
UBQLN4Q9NRR5 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
UBQLN4Q9NRR5 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
UBQLN4Q9NRR5 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
UBQLN4Q9NRR5 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
UBQLN4Q9NRR5 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.44
UBQLN4Q9NRR5 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
UBQLN4Q9NRR5 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
UBQLN4Q9NRR5 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
UBQLN4Q9NRR5 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
UBQLN4Q9NRR5 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
UBQLN4Q9NRR5 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
UBQLN4Q9NRR5 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
UBQLN4Q9NRR5 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
UBQLN4Q9NRR5 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
UBQLN4Q9NRR5 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
UBQLN4Q9NRR5 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
UBQLN4Q9NRR5 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
UBQLN4Q9NRR5 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
UBQLN4Q9NRR5 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
UBQLN4Q9NRR5 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
UBQLN4Q9NRR5 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
UBQLN4Q9NRR5 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
UBQLN4Q9NRR5 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
UBQLN4Q9NRR5 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
UBQLN4Q9NRR5 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
UBQLN4Q9NRR5 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
UBQLN4Q9NRR5 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
UBQLN4Q9NRR5 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
UBQLN4Q9NRR5 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
UBQLN4Q9NRR5 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
UBQLN4Q9NRR5 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
UBQLN4Q9NRR5 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
UBQLN4Q9NRR5 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
UBQLN4Q9NRR5 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
UBQLN4Q9NRR5 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
UBQLN4Q9NRR5 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
UBQLN4Q9NRR5 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
UBQLN4Q9NRR5 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
UBQLN4Q9NRR5 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
UBQLN4Q9NRR5 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
UBQLN4Q9NRR5 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
UBQLN4Q9NRR5 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
UBQLN4Q9NRR5 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
UBQLN4Q9NRR5 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
UBQLN4Q9NRR5 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
UBQLN4Q9NRR5 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
UBQLN4Q9NRR5 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
UBQLN4Q9NRR5 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
UBQLN4Q9NRR5 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
UBQLN4Q9NRR5 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
UBQLN4Q9NRR5 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
UBQLN4Q9NRR5 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
UBQLN4Q9NRR5 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
UBQLN4Q9NRR5 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
UBQLN4Q9NRR5 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
UBQLN4Q9NRR5 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
UBQLN4Q9NRR5 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
UBQLN4Q9NRR5 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
UBQLN4Q9NRR5 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
UBQLN4Q9NRR5 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
UBQLN4Q9NRR5 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
UBQLN4Q9NRR5 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
UBQLN4Q9NRR5 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
UBQLN4Q9NRR5 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
UBQLN4Q9NRR5 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
UBQLN4Q9NRR5 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
UBQLN4Q9NRR5 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
UBQLN4Q9NRR5 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
UBQLN4Q9NRR5 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
UBQLN4Q9NRR5 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
UBQLN4Q9NRR5 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
UBQLN4Q9NRR5 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
UBQLN4Q9NRR5 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBQLN4Q9NRR5 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBQLN4Q9NRR5 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
UBQLN4Q9NRR5 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
UBQLN4Q9NRR5 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
UBQLN4Q9NRR5 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
UBQLN4Q9NRR5 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
UBQLN4Q9NRR5 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
UBQLN4Q9NRR5 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
UBQLN4Q9NRR5 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
UBQLN4Q9NRR5 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
UBQLN4Q9NRR5 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
UBQLN4Q9NRR5 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
UBQLN4Q9NRR5 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
UBQLN4Q9NRR5 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
UBQLN4Q9NRR5 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
UBQLN4Q9NRR5 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
UBQLN4Q9NRR5 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
UBQLN4Q9NRR5 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
UBQLN4Q9NRR5 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
UBQLN4Q9NRR5 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
UBQLN4Q9NRR5 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
UBQLN4Q9NRR5 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
UBQLN4Q9NRR5 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
UBQLN4Q9NRR5 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
UBQLN4Q9NRR5 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms