Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX4

MYO5C, Unconventional myosin-Vc, humanhuman

Predictions only

Length 1,742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO5CQ9NQX4 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC53.54■■■■■ 6.16
MYO5CQ9NQX4 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC53.2■■■■■ 6.11
MYO5CQ9NQX4 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC52.52■■■■■ 6
MYO5CQ9NQX4 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.29■■■■■ 5.96
MYO5CQ9NQX4 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.85■■■■■ 5.89
MYO5CQ9NQX4 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC51.52■■■■■ 5.84
MYO5CQ9NQX4 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.22■■■■■ 5.79
MYO5CQ9NQX4 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC51.06■■■■■ 5.77
MYO5CQ9NQX4 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50.89■■■■■ 5.74
MYO5CQ9NQX4 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC50.84■■■■■ 5.73
MYO5CQ9NQX4 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC50.67■■■■■ 5.7
MYO5CQ9NQX4 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC50.65■■■■■ 5.7
MYO5CQ9NQX4 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC50.56■■■■■ 5.68
MYO5CQ9NQX4 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC50.4■■■■■ 5.66
MYO5CQ9NQX4 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC50.14■■■■■ 5.62
MYO5CQ9NQX4 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC50.01■■■■■ 5.6
MYO5CQ9NQX4 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.98■■■■■ 5.59
MYO5CQ9NQX4 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.96■■■■■ 5.59
MYO5CQ9NQX4 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC49.88■■■■■ 5.58
MYO5CQ9NQX4 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.34■■■■■ 5.49
MYO5CQ9NQX4 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC49.34■■■■■ 5.49
MYO5CQ9NQX4 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC49.32■■■■■ 5.49
MYO5CQ9NQX4 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.15■■■■■ 5.46
MYO5CQ9NQX4 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC49.14■■■■■ 5.46
MYO5CQ9NQX4 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC49.12■■■■■ 5.45
MYO5CQ9NQX4 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC49.11■■■■■ 5.45
MYO5CQ9NQX4 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49■■■■■ 5.43
MYO5CQ9NQX4 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.97■■■■■ 5.43
MYO5CQ9NQX4 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.87■■■■■ 5.41
MYO5CQ9NQX4 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC48.8■■■■■ 5.4
MYO5CQ9NQX4 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC48.76■■■■■ 5.4
MYO5CQ9NQX4 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC48.59■■■■■ 5.37
MYO5CQ9NQX4 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC48.52■■■■■ 5.36
MYO5CQ9NQX4 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC48.52■■■■■ 5.36
MYO5CQ9NQX4 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC48.45■■■■■ 5.35
MYO5CQ9NQX4 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC48.25■■■■■ 5.31
MYO5CQ9NQX4 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC48.11■■■■■ 5.29
MYO5CQ9NQX4 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.08■■■■■ 5.29
MYO5CQ9NQX4 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.82■■■■■ 5.25
MYO5CQ9NQX4 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC47.8■■■■■ 5.24
MYO5CQ9NQX4 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC47.73■■■■■ 5.23
MYO5CQ9NQX4 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC47.49■■■■■ 5.19
MYO5CQ9NQX4 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC47.46■■■■■ 5.19
MYO5CQ9NQX4 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.42■■■■■ 5.18
MYO5CQ9NQX4 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC47.3■■■■■ 5.16
MYO5CQ9NQX4 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.25■■■■■ 5.15
MYO5CQ9NQX4 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC47.22■■■■■ 5.15
MYO5CQ9NQX4 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.16■■■■■ 5.14
MYO5CQ9NQX4 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.03■■■■■ 5.12
MYO5CQ9NQX4 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC47.02■■■■■ 5.12
MYO5CQ9NQX4 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC46.99■■■■■ 5.11
MYO5CQ9NQX4 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.92■■■■■ 5.1
MYO5CQ9NQX4 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC46.91■■■■■ 5.1
MYO5CQ9NQX4 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC46.89■■■■■ 5.1
MYO5CQ9NQX4 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC46.82■■■■■ 5.09
MYO5CQ9NQX4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC46.8■■■■■ 5.08
MYO5CQ9NQX4 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC46.78■■■■■ 5.08
MYO5CQ9NQX4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.76■■■■■ 5.08
MYO5CQ9NQX4 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC46.71■■■■■ 5.07
MYO5CQ9NQX4 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.7■■■■■ 5.07
MYO5CQ9NQX4 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC46.68■■■■■ 5.06
MYO5CQ9NQX4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC46.67■■■■■ 5.06
MYO5CQ9NQX4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC46.67■■■■■ 5.06
MYO5CQ9NQX4 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.66■■■■■ 5.06
MYO5CQ9NQX4 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC46.5■■■■■ 5.03
MYO5CQ9NQX4 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.46■■■■■ 5.03
MYO5CQ9NQX4 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.46■■■■■ 5.03
MYO5CQ9NQX4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC46.45■■■■■ 5.03
MYO5CQ9NQX4 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.44■■■■■ 5.02
MYO5CQ9NQX4 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC46.44■■■■■ 5.02
MYO5CQ9NQX4 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC46.33■■■■■ 5.01
MYO5CQ9NQX4 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.32■■■■■ 5
MYO5CQ9NQX4 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC46.3■■■■■ 5
MYO5CQ9NQX4 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.22■■■■■ 4.99
MYO5CQ9NQX4 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.21■■■■■ 4.99
MYO5CQ9NQX4 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.2■■■■■ 4.99
MYO5CQ9NQX4 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.19■■■■■ 4.98
MYO5CQ9NQX4 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.13■■■■■ 4.98
MYO5CQ9NQX4 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC46.12■■■■■ 4.97
MYO5CQ9NQX4 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC46.11■■■■■ 4.97
MYO5CQ9NQX4 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.07■■■■■ 4.97
MYO5CQ9NQX4 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC46.07■■■■■ 4.97
MYO5CQ9NQX4 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC46.03■■■■■ 4.96
MYO5CQ9NQX4 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.03■■■■■ 4.96
MYO5CQ9NQX4 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC46.03■■■■■ 4.96
MYO5CQ9NQX4 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.98■■■■■ 4.95
MYO5CQ9NQX4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC45.97■■■■■ 4.95
MYO5CQ9NQX4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC45.95■■■■■ 4.95
MYO5CQ9NQX4 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.78■■■■■ 4.92
MYO5CQ9NQX4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC45.77■■■■■ 4.92
MYO5CQ9NQX4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC45.77■■■■■ 4.92
MYO5CQ9NQX4 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC45.77■■■■■ 4.92
MYO5CQ9NQX4 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.77■■■■■ 4.92
MYO5CQ9NQX4 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.75■■■■■ 4.91
MYO5CQ9NQX4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.72■■■■■ 4.91
MYO5CQ9NQX4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC45.71■■■■■ 4.91
MYO5CQ9NQX4 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC45.65■■■■■ 4.9
MYO5CQ9NQX4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC45.64■■■■■ 4.9
MYO5CQ9NQX4 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC45.62■■■■■ 4.89
MYO5CQ9NQX4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC45.6■■■■■ 4.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms