Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA7

TSSK1B, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK1BQ9BXA7 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC33.56■■■□□ 2.96
TSSK1BQ9BXA7 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
TSSK1BQ9BXA7 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.26■■■□□ 2.91
TSSK1BQ9BXA7 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
TSSK1BQ9BXA7 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
TSSK1BQ9BXA7 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
TSSK1BQ9BXA7 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
TSSK1BQ9BXA7 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
TSSK1BQ9BXA7 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
TSSK1BQ9BXA7 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
TSSK1BQ9BXA7 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
TSSK1BQ9BXA7 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
TSSK1BQ9BXA7 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
TSSK1BQ9BXA7 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC32.06■■■□□ 2.72
TSSK1BQ9BXA7 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
TSSK1BQ9BXA7 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.69
TSSK1BQ9BXA7 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
TSSK1BQ9BXA7 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC31.76■■■□□ 2.67
TSSK1BQ9BXA7 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
TSSK1BQ9BXA7 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
TSSK1BQ9BXA7 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
TSSK1BQ9BXA7 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
TSSK1BQ9BXA7 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
TSSK1BQ9BXA7 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
TSSK1BQ9BXA7 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
TSSK1BQ9BXA7 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
TSSK1BQ9BXA7 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.6
TSSK1BQ9BXA7 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
TSSK1BQ9BXA7 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
TSSK1BQ9BXA7 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
TSSK1BQ9BXA7 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
TSSK1BQ9BXA7 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
TSSK1BQ9BXA7 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
TSSK1BQ9BXA7 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
TSSK1BQ9BXA7 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
TSSK1BQ9BXA7 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
TSSK1BQ9BXA7 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
TSSK1BQ9BXA7 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
TSSK1BQ9BXA7 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
TSSK1BQ9BXA7 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
TSSK1BQ9BXA7 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
TSSK1BQ9BXA7 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
TSSK1BQ9BXA7 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TSSK1BQ9BXA7 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TSSK1BQ9BXA7 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TSSK1BQ9BXA7 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TSSK1BQ9BXA7 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TSSK1BQ9BXA7 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TSSK1BQ9BXA7 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TSSK1BQ9BXA7 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
TSSK1BQ9BXA7 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TSSK1BQ9BXA7 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
TSSK1BQ9BXA7 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TSSK1BQ9BXA7 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TSSK1BQ9BXA7 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TSSK1BQ9BXA7 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TSSK1BQ9BXA7 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TSSK1BQ9BXA7 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TSSK1BQ9BXA7 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TSSK1BQ9BXA7 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TSSK1BQ9BXA7 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TSSK1BQ9BXA7 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TSSK1BQ9BXA7 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TSSK1BQ9BXA7 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TSSK1BQ9BXA7 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TSSK1BQ9BXA7 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TSSK1BQ9BXA7 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TSSK1BQ9BXA7 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TSSK1BQ9BXA7 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
TSSK1BQ9BXA7 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TSSK1BQ9BXA7 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TSSK1BQ9BXA7 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TSSK1BQ9BXA7 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TSSK1BQ9BXA7 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TSSK1BQ9BXA7 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TSSK1BQ9BXA7 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
TSSK1BQ9BXA7 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TSSK1BQ9BXA7 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TSSK1BQ9BXA7 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TSSK1BQ9BXA7 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TSSK1BQ9BXA7 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TSSK1BQ9BXA7 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TSSK1BQ9BXA7 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TSSK1BQ9BXA7 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TSSK1BQ9BXA7 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TSSK1BQ9BXA7 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TSSK1BQ9BXA7 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TSSK1BQ9BXA7 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TSSK1BQ9BXA7 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TSSK1BQ9BXA7 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
TSSK1BQ9BXA7 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TSSK1BQ9BXA7 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TSSK1BQ9BXA7 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TSSK1BQ9BXA7 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TSSK1BQ9BXA7 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TSSK1BQ9BXA7 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TSSK1BQ9BXA7 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TSSK1BQ9BXA7 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TSSK1BQ9BXA7 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TSSK1BQ9BXA7 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms