Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR39

JPH2, Junctophilin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 696 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JPH2Q9BR39 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC38.15■■■■□ 3.7
JPH2Q9BR39 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
JPH2Q9BR39 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC37.06■■■■□ 3.52
JPH2Q9BR39 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
JPH2Q9BR39 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
JPH2Q9BR39 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
JPH2Q9BR39 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
JPH2Q9BR39 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
JPH2Q9BR39 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
JPH2Q9BR39 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
JPH2Q9BR39 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
JPH2Q9BR39 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
JPH2Q9BR39 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
JPH2Q9BR39 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
JPH2Q9BR39 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
JPH2Q9BR39 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC35.37■■■■□ 3.25
JPH2Q9BR39 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC35.34■■■■□ 3.25
JPH2Q9BR39 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
JPH2Q9BR39 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
JPH2Q9BR39 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
JPH2Q9BR39 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
JPH2Q9BR39 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
JPH2Q9BR39 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
JPH2Q9BR39 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
JPH2Q9BR39 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
JPH2Q9BR39 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
JPH2Q9BR39 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
JPH2Q9BR39 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
JPH2Q9BR39 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
JPH2Q9BR39 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
JPH2Q9BR39 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
JPH2Q9BR39 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
JPH2Q9BR39 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
JPH2Q9BR39 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC34.12■■■■□ 3.05
JPH2Q9BR39 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
JPH2Q9BR39 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
JPH2Q9BR39 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
JPH2Q9BR39 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
JPH2Q9BR39 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
JPH2Q9BR39 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
JPH2Q9BR39 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
JPH2Q9BR39 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
JPH2Q9BR39 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
JPH2Q9BR39 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
JPH2Q9BR39 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
JPH2Q9BR39 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
JPH2Q9BR39 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
JPH2Q9BR39 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
JPH2Q9BR39 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
JPH2Q9BR39 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
JPH2Q9BR39 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
JPH2Q9BR39 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
JPH2Q9BR39 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
JPH2Q9BR39 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
JPH2Q9BR39 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
JPH2Q9BR39 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
JPH2Q9BR39 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC33.25■■■□□ 2.91
JPH2Q9BR39 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
JPH2Q9BR39 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
JPH2Q9BR39 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
JPH2Q9BR39 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
JPH2Q9BR39 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
JPH2Q9BR39 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
JPH2Q9BR39 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
JPH2Q9BR39 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
JPH2Q9BR39 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
JPH2Q9BR39 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
JPH2Q9BR39 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC32.9■■■□□ 2.86
JPH2Q9BR39 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
JPH2Q9BR39 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
JPH2Q9BR39 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
JPH2Q9BR39 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
JPH2Q9BR39 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
JPH2Q9BR39 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
JPH2Q9BR39 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
JPH2Q9BR39 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
JPH2Q9BR39 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
JPH2Q9BR39 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
JPH2Q9BR39 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
JPH2Q9BR39 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
JPH2Q9BR39 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
JPH2Q9BR39 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
JPH2Q9BR39 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
JPH2Q9BR39 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.79
JPH2Q9BR39 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
JPH2Q9BR39 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
JPH2Q9BR39 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
JPH2Q9BR39 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
JPH2Q9BR39 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
JPH2Q9BR39 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
JPH2Q9BR39 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
JPH2Q9BR39 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
JPH2Q9BR39 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
JPH2Q9BR39 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
JPH2Q9BR39 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
JPH2Q9BR39 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
JPH2Q9BR39 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
JPH2Q9BR39 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
JPH2Q9BR39 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
JPH2Q9BR39 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms