Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR10

SPATA25, Spermatogenesis-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA25Q9BR10 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPATA25Q9BR10 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPATA25Q9BR10 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPATA25Q9BR10 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPATA25Q9BR10 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPATA25Q9BR10 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPATA25Q9BR10 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPATA25Q9BR10 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SPATA25Q9BR10 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPATA25Q9BR10 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPATA25Q9BR10 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPATA25Q9BR10 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPATA25Q9BR10 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPATA25Q9BR10 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPATA25Q9BR10 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPATA25Q9BR10 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPATA25Q9BR10 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPATA25Q9BR10 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPATA25Q9BR10 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPATA25Q9BR10 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPATA25Q9BR10 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPATA25Q9BR10 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPATA25Q9BR10 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPATA25Q9BR10 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPATA25Q9BR10 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPATA25Q9BR10 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPATA25Q9BR10 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPATA25Q9BR10 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPATA25Q9BR10 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPATA25Q9BR10 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPATA25Q9BR10 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPATA25Q9BR10 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPATA25Q9BR10 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPATA25Q9BR10 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPATA25Q9BR10 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPATA25Q9BR10 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPATA25Q9BR10 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPATA25Q9BR10 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SPATA25Q9BR10 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPATA25Q9BR10 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SPATA25Q9BR10 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPATA25Q9BR10 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SPATA25Q9BR10 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPATA25Q9BR10 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPATA25Q9BR10 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPATA25Q9BR10 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPATA25Q9BR10 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPATA25Q9BR10 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPATA25Q9BR10 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPATA25Q9BR10 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPATA25Q9BR10 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPATA25Q9BR10 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPATA25Q9BR10 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPATA25Q9BR10 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPATA25Q9BR10 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPATA25Q9BR10 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPATA25Q9BR10 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPATA25Q9BR10 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPATA25Q9BR10 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SPATA25Q9BR10 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPATA25Q9BR10 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPATA25Q9BR10 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SPATA25Q9BR10 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPATA25Q9BR10 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPATA25Q9BR10 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SPATA25Q9BR10 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPATA25Q9BR10 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPATA25Q9BR10 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPATA25Q9BR10 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPATA25Q9BR10 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPATA25Q9BR10 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPATA25Q9BR10 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPATA25Q9BR10 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPATA25Q9BR10 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPATA25Q9BR10 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPATA25Q9BR10 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPATA25Q9BR10 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPATA25Q9BR10 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPATA25Q9BR10 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPATA25Q9BR10 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPATA25Q9BR10 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPATA25Q9BR10 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SPATA25Q9BR10 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPATA25Q9BR10 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPATA25Q9BR10 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPATA25Q9BR10 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPATA25Q9BR10 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPATA25Q9BR10 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPATA25Q9BR10 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPATA25Q9BR10 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPATA25Q9BR10 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPATA25Q9BR10 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPATA25Q9BR10 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPATA25Q9BR10 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPATA25Q9BR10 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPATA25Q9BR10 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPATA25Q9BR10 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPATA25Q9BR10 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPATA25Q9BR10 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SPATA25Q9BR10 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms