Protein–RNA interactions for Protein: Q96SJ8

TSPAN18, Tetraspanin-18, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN18Q96SJ8 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC37.16■■■■□ 3.54
TSPAN18Q96SJ8 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
TSPAN18Q96SJ8 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
TSPAN18Q96SJ8 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC36.04■■■■□ 3.36
TSPAN18Q96SJ8 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
TSPAN18Q96SJ8 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
TSPAN18Q96SJ8 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
TSPAN18Q96SJ8 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.34■■■■□ 3.25
TSPAN18Q96SJ8 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.25
TSPAN18Q96SJ8 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
TSPAN18Q96SJ8 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
TSPAN18Q96SJ8 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
TSPAN18Q96SJ8 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
TSPAN18Q96SJ8 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
TSPAN18Q96SJ8 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
TSPAN18Q96SJ8 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
TSPAN18Q96SJ8 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
TSPAN18Q96SJ8 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
TSPAN18Q96SJ8 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
TSPAN18Q96SJ8 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
TSPAN18Q96SJ8 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
TSPAN18Q96SJ8 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
TSPAN18Q96SJ8 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
TSPAN18Q96SJ8 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
TSPAN18Q96SJ8 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
TSPAN18Q96SJ8 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
TSPAN18Q96SJ8 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
TSPAN18Q96SJ8 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
TSPAN18Q96SJ8 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
TSPAN18Q96SJ8 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
TSPAN18Q96SJ8 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
TSPAN18Q96SJ8 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
TSPAN18Q96SJ8 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
TSPAN18Q96SJ8 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
TSPAN18Q96SJ8 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
TSPAN18Q96SJ8 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
TSPAN18Q96SJ8 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
TSPAN18Q96SJ8 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
TSPAN18Q96SJ8 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
TSPAN18Q96SJ8 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
TSPAN18Q96SJ8 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
TSPAN18Q96SJ8 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
TSPAN18Q96SJ8 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
TSPAN18Q96SJ8 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
TSPAN18Q96SJ8 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
TSPAN18Q96SJ8 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
TSPAN18Q96SJ8 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
TSPAN18Q96SJ8 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
TSPAN18Q96SJ8 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
TSPAN18Q96SJ8 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
TSPAN18Q96SJ8 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
TSPAN18Q96SJ8 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
TSPAN18Q96SJ8 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
TSPAN18Q96SJ8 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
TSPAN18Q96SJ8 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
TSPAN18Q96SJ8 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
TSPAN18Q96SJ8 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.25■■■□□ 2.75
TSPAN18Q96SJ8 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
TSPAN18Q96SJ8 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
TSPAN18Q96SJ8 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
TSPAN18Q96SJ8 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
TSPAN18Q96SJ8 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
TSPAN18Q96SJ8 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
TSPAN18Q96SJ8 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
TSPAN18Q96SJ8 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
TSPAN18Q96SJ8 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC32.01■■■□□ 2.72
TSPAN18Q96SJ8 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
TSPAN18Q96SJ8 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
TSPAN18Q96SJ8 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
TSPAN18Q96SJ8 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
TSPAN18Q96SJ8 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
TSPAN18Q96SJ8 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
TSPAN18Q96SJ8 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
TSPAN18Q96SJ8 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
TSPAN18Q96SJ8 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
TSPAN18Q96SJ8 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
TSPAN18Q96SJ8 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
TSPAN18Q96SJ8 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
TSPAN18Q96SJ8 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
TSPAN18Q96SJ8 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
TSPAN18Q96SJ8 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
TSPAN18Q96SJ8 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
TSPAN18Q96SJ8 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
TSPAN18Q96SJ8 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
TSPAN18Q96SJ8 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
TSPAN18Q96SJ8 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
TSPAN18Q96SJ8 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
TSPAN18Q96SJ8 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
TSPAN18Q96SJ8 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
TSPAN18Q96SJ8 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
TSPAN18Q96SJ8 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
TSPAN18Q96SJ8 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
TSPAN18Q96SJ8 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
TSPAN18Q96SJ8 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
TSPAN18Q96SJ8 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
TSPAN18Q96SJ8 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
TSPAN18Q96SJ8 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
TSPAN18Q96SJ8 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
TSPAN18Q96SJ8 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
TSPAN18Q96SJ8 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms