Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.54■■■□□ 2.64
SGCZQ96LD1 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SGCZQ96LD1 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
SGCZQ96LD1 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
SGCZQ96LD1 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
SGCZQ96LD1 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SGCZQ96LD1 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
SGCZQ96LD1 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SGCZQ96LD1 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SGCZQ96LD1 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SGCZQ96LD1 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SGCZQ96LD1 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SGCZQ96LD1 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SGCZQ96LD1 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SGCZQ96LD1 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SGCZQ96LD1 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SGCZQ96LD1 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SGCZQ96LD1 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SGCZQ96LD1 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SGCZQ96LD1 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SGCZQ96LD1 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SGCZQ96LD1 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SGCZQ96LD1 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SGCZQ96LD1 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SGCZQ96LD1 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SGCZQ96LD1 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SGCZQ96LD1 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SGCZQ96LD1 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SGCZQ96LD1 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SGCZQ96LD1 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SGCZQ96LD1 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SGCZQ96LD1 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SGCZQ96LD1 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SGCZQ96LD1 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SGCZQ96LD1 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SGCZQ96LD1 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SGCZQ96LD1 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SGCZQ96LD1 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SGCZQ96LD1 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SGCZQ96LD1 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SGCZQ96LD1 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SGCZQ96LD1 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SGCZQ96LD1 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
SGCZQ96LD1 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SGCZQ96LD1 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SGCZQ96LD1 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SGCZQ96LD1 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SGCZQ96LD1 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SGCZQ96LD1 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SGCZQ96LD1 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SGCZQ96LD1 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SGCZQ96LD1 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SGCZQ96LD1 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SGCZQ96LD1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SGCZQ96LD1 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SGCZQ96LD1 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SGCZQ96LD1 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SGCZQ96LD1 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SGCZQ96LD1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SGCZQ96LD1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SGCZQ96LD1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SGCZQ96LD1 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SGCZQ96LD1 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SGCZQ96LD1 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SGCZQ96LD1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SGCZQ96LD1 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SGCZQ96LD1 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SGCZQ96LD1 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SGCZQ96LD1 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SGCZQ96LD1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SGCZQ96LD1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SGCZQ96LD1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SGCZQ96LD1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SGCZQ96LD1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SGCZQ96LD1 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SGCZQ96LD1 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SGCZQ96LD1 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SGCZQ96LD1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SGCZQ96LD1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SGCZQ96LD1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SGCZQ96LD1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SGCZQ96LD1 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SGCZQ96LD1 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SGCZQ96LD1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SGCZQ96LD1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SGCZQ96LD1 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
SGCZQ96LD1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SGCZQ96LD1 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SGCZQ96LD1 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SGCZQ96LD1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SGCZQ96LD1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SGCZQ96LD1 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SGCZQ96LD1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SGCZQ96LD1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SGCZQ96LD1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SGCZQ96LD1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SGCZQ96LD1 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SGCZQ96LD1 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SGCZQ96LD1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SGCZQ96LD1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms