Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ7

TM4SF19, Transmembrane 4 L6 family member 19, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF19Q96DZ7 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC32.69■■■□□ 2.82
TM4SF19Q96DZ7 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
TM4SF19Q96DZ7 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
TM4SF19Q96DZ7 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
TM4SF19Q96DZ7 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
TM4SF19Q96DZ7 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
TM4SF19Q96DZ7 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
TM4SF19Q96DZ7 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
TM4SF19Q96DZ7 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
TM4SF19Q96DZ7 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
TM4SF19Q96DZ7 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
TM4SF19Q96DZ7 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
TM4SF19Q96DZ7 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
TM4SF19Q96DZ7 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
TM4SF19Q96DZ7 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
TM4SF19Q96DZ7 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
TM4SF19Q96DZ7 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TM4SF19Q96DZ7 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TM4SF19Q96DZ7 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TM4SF19Q96DZ7 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TM4SF19Q96DZ7 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TM4SF19Q96DZ7 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TM4SF19Q96DZ7 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TM4SF19Q96DZ7 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TM4SF19Q96DZ7 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TM4SF19Q96DZ7 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TM4SF19Q96DZ7 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TM4SF19Q96DZ7 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TM4SF19Q96DZ7 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TM4SF19Q96DZ7 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TM4SF19Q96DZ7 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TM4SF19Q96DZ7 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TM4SF19Q96DZ7 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TM4SF19Q96DZ7 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TM4SF19Q96DZ7 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TM4SF19Q96DZ7 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TM4SF19Q96DZ7 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TM4SF19Q96DZ7 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TM4SF19Q96DZ7 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TM4SF19Q96DZ7 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TM4SF19Q96DZ7 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TM4SF19Q96DZ7 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TM4SF19Q96DZ7 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TM4SF19Q96DZ7 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TM4SF19Q96DZ7 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TM4SF19Q96DZ7 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TM4SF19Q96DZ7 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TM4SF19Q96DZ7 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TM4SF19Q96DZ7 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
TM4SF19Q96DZ7 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TM4SF19Q96DZ7 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TM4SF19Q96DZ7 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TM4SF19Q96DZ7 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TM4SF19Q96DZ7 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TM4SF19Q96DZ7 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TM4SF19Q96DZ7 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TM4SF19Q96DZ7 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TM4SF19Q96DZ7 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
TM4SF19Q96DZ7 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TM4SF19Q96DZ7 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TM4SF19Q96DZ7 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TM4SF19Q96DZ7 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TM4SF19Q96DZ7 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
TM4SF19Q96DZ7 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TM4SF19Q96DZ7 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TM4SF19Q96DZ7 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TM4SF19Q96DZ7 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TM4SF19Q96DZ7 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TM4SF19Q96DZ7 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TM4SF19Q96DZ7 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TM4SF19Q96DZ7 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TM4SF19Q96DZ7 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
TM4SF19Q96DZ7 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TM4SF19Q96DZ7 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TM4SF19Q96DZ7 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TM4SF19Q96DZ7 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TM4SF19Q96DZ7 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TM4SF19Q96DZ7 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TM4SF19Q96DZ7 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TM4SF19Q96DZ7 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TM4SF19Q96DZ7 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TM4SF19Q96DZ7 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TM4SF19Q96DZ7 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TM4SF19Q96DZ7 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TM4SF19Q96DZ7 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TM4SF19Q96DZ7 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TM4SF19Q96DZ7 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TM4SF19Q96DZ7 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TM4SF19Q96DZ7 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TM4SF19Q96DZ7 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TM4SF19Q96DZ7 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TM4SF19Q96DZ7 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TM4SF19Q96DZ7 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TM4SF19Q96DZ7 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TM4SF19Q96DZ7 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TM4SF19Q96DZ7 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TM4SF19Q96DZ7 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
TM4SF19Q96DZ7 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TM4SF19Q96DZ7 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TM4SF19Q96DZ7 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms