Protein–RNA interactions for Protein: Q96AX9

MIB2, E3 ubiquitin-protein ligase MIB2, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIB2Q96AX9 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC31.36■■■□□ 2.61
MIB2Q96AX9 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.22■■■□□ 2.59
MIB2Q96AX9 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
MIB2Q96AX9 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
MIB2Q96AX9 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
MIB2Q96AX9 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
MIB2Q96AX9 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
MIB2Q96AX9 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
MIB2Q96AX9 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
MIB2Q96AX9 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
MIB2Q96AX9 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
MIB2Q96AX9 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
MIB2Q96AX9 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
MIB2Q96AX9 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
MIB2Q96AX9 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
MIB2Q96AX9 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
MIB2Q96AX9 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
MIB2Q96AX9 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
MIB2Q96AX9 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
MIB2Q96AX9 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
MIB2Q96AX9 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MIB2Q96AX9 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
MIB2Q96AX9 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
MIB2Q96AX9 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
MIB2Q96AX9 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
MIB2Q96AX9 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
MIB2Q96AX9 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
MIB2Q96AX9 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
MIB2Q96AX9 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
MIB2Q96AX9 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
MIB2Q96AX9 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MIB2Q96AX9 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
MIB2Q96AX9 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
MIB2Q96AX9 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
MIB2Q96AX9 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
MIB2Q96AX9 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
MIB2Q96AX9 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
MIB2Q96AX9 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
MIB2Q96AX9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MIB2Q96AX9 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MIB2Q96AX9 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MIB2Q96AX9 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
MIB2Q96AX9 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MIB2Q96AX9 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MIB2Q96AX9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28■■■□□ 2.07
MIB2Q96AX9 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MIB2Q96AX9 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MIB2Q96AX9 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MIB2Q96AX9 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MIB2Q96AX9 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MIB2Q96AX9 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MIB2Q96AX9 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MIB2Q96AX9 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MIB2Q96AX9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MIB2Q96AX9 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MIB2Q96AX9 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MIB2Q96AX9 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MIB2Q96AX9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MIB2Q96AX9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MIB2Q96AX9 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MIB2Q96AX9 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MIB2Q96AX9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MIB2Q96AX9 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MIB2Q96AX9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MIB2Q96AX9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MIB2Q96AX9 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MIB2Q96AX9 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MIB2Q96AX9 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
MIB2Q96AX9 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MIB2Q96AX9 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MIB2Q96AX9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MIB2Q96AX9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MIB2Q96AX9 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MIB2Q96AX9 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MIB2Q96AX9 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MIB2Q96AX9 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MIB2Q96AX9 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MIB2Q96AX9 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MIB2Q96AX9 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MIB2Q96AX9 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MIB2Q96AX9 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MIB2Q96AX9 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MIB2Q96AX9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MIB2Q96AX9 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MIB2Q96AX9 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MIB2Q96AX9 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MIB2Q96AX9 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MIB2Q96AX9 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MIB2Q96AX9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MIB2Q96AX9 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MIB2Q96AX9 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MIB2Q96AX9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MIB2Q96AX9 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MIB2Q96AX9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MIB2Q96AX9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
MIB2Q96AX9 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MIB2Q96AX9 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MIB2Q96AX9 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MIB2Q96AX9 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MIB2Q96AX9 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms