Protein–RNA interactions for Protein: Q96AH8

RAB7B, Ras-related protein Rab-7b, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB7BQ96AH8 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC34.52■■■■□ 3.12
RAB7BQ96AH8 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
RAB7BQ96AH8 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
RAB7BQ96AH8 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
RAB7BQ96AH8 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
RAB7BQ96AH8 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
RAB7BQ96AH8 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
RAB7BQ96AH8 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.87
RAB7BQ96AH8 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
RAB7BQ96AH8 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
RAB7BQ96AH8 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
RAB7BQ96AH8 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
RAB7BQ96AH8 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
RAB7BQ96AH8 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
RAB7BQ96AH8 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
RAB7BQ96AH8 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
RAB7BQ96AH8 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
RAB7BQ96AH8 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
RAB7BQ96AH8 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
RAB7BQ96AH8 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
RAB7BQ96AH8 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
RAB7BQ96AH8 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
RAB7BQ96AH8 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
RAB7BQ96AH8 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
RAB7BQ96AH8 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
RAB7BQ96AH8 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
RAB7BQ96AH8 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
RAB7BQ96AH8 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
RAB7BQ96AH8 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
RAB7BQ96AH8 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
RAB7BQ96AH8 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
RAB7BQ96AH8 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
RAB7BQ96AH8 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
RAB7BQ96AH8 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
RAB7BQ96AH8 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
RAB7BQ96AH8 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
RAB7BQ96AH8 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
RAB7BQ96AH8 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
RAB7BQ96AH8 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
RAB7BQ96AH8 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
RAB7BQ96AH8 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
RAB7BQ96AH8 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
RAB7BQ96AH8 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
RAB7BQ96AH8 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
RAB7BQ96AH8 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
RAB7BQ96AH8 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
RAB7BQ96AH8 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
RAB7BQ96AH8 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
RAB7BQ96AH8 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
RAB7BQ96AH8 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.44
RAB7BQ96AH8 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
RAB7BQ96AH8 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
RAB7BQ96AH8 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
RAB7BQ96AH8 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
RAB7BQ96AH8 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
RAB7BQ96AH8 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
RAB7BQ96AH8 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RAB7BQ96AH8 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RAB7BQ96AH8 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
RAB7BQ96AH8 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
RAB7BQ96AH8 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RAB7BQ96AH8 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RAB7BQ96AH8 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RAB7BQ96AH8 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RAB7BQ96AH8 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RAB7BQ96AH8 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RAB7BQ96AH8 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RAB7BQ96AH8 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RAB7BQ96AH8 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
RAB7BQ96AH8 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RAB7BQ96AH8 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RAB7BQ96AH8 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RAB7BQ96AH8 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RAB7BQ96AH8 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
RAB7BQ96AH8 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RAB7BQ96AH8 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RAB7BQ96AH8 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RAB7BQ96AH8 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RAB7BQ96AH8 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RAB7BQ96AH8 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RAB7BQ96AH8 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RAB7BQ96AH8 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RAB7BQ96AH8 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RAB7BQ96AH8 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RAB7BQ96AH8 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RAB7BQ96AH8 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RAB7BQ96AH8 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RAB7BQ96AH8 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RAB7BQ96AH8 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RAB7BQ96AH8 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RAB7BQ96AH8 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RAB7BQ96AH8 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RAB7BQ96AH8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RAB7BQ96AH8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RAB7BQ96AH8 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RAB7BQ96AH8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RAB7BQ96AH8 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RAB7BQ96AH8 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RAB7BQ96AH8 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
RAB7BQ96AH8 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms