Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC49.34■■■■■ 5.49
PTPRUQ92729 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC49.06■■■■■ 5.44
PTPRUQ92729 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC48.42■■■■■ 5.34
PTPRUQ92729 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.17■■■■■ 5.3
PTPRUQ92729 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.68■■■■■ 5.22
PTPRUQ92729 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.32■■■■■ 5.17
PTPRUQ92729 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.99■■■■■ 5.11
PTPRUQ92729 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.92■■■■■ 5.1
PTPRUQ92729 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC46.89■■■■■ 5.1
PTPRUQ92729 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC46.71■■■■■ 5.07
PTPRUQ92729 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.68■■■■■ 5.06
PTPRUQ92729 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC46.57■■■■■ 5.05
PTPRUQ92729 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC46.57■■■■■ 5.05
PTPRUQ92729 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC46.55■■■■■ 5.04
PTPRUQ92729 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.2■■■■■ 4.99
PTPRUQ92729 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.08■■■■■ 4.97
PTPRUQ92729 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.92■■■■■ 4.94
PTPRUQ92729 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.92■■■■■ 4.94
PTPRUQ92729 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC45.82■■■■■ 4.93
PTPRUQ92729 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.44■■■■■ 4.87
PTPRUQ92729 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC45.44■■■■■ 4.87
PTPRUQ92729 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.41■■■■■ 4.86
PTPRUQ92729 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC45.3■■■■■ 4.84
PTPRUQ92729 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.26■■■■■ 4.84
PTPRUQ92729 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.26■■■■■ 4.84
PTPRUQ92729 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.25■■■■■ 4.83
PTPRUQ92729 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC45.15■■■■■ 4.82
PTPRUQ92729 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC45.06■■■■■ 4.8
PTPRUQ92729 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.04■■■■■ 4.8
PTPRUQ92729 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.92■■■■■ 4.78
PTPRUQ92729 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC44.79■■■■■ 4.76
PTPRUQ92729 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC44.75■■■■■ 4.75
PTPRUQ92729 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC44.7■■■■■ 4.75
PTPRUQ92729 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC44.68■■■■■ 4.74
PTPRUQ92729 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC44.49■■■■■ 4.71
PTPRUQ92729 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC44.4■■■■■ 4.7
PTPRUQ92729 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.38■■■■■ 4.69
PTPRUQ92729 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC44.29■■■■■ 4.68
PTPRUQ92729 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.21■■■■■ 4.67
PTPRUQ92729 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC44.04■■■■■ 4.64
PTPRUQ92729 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC43.93■■■■■ 4.62
PTPRUQ92729 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC43.69■■■■■ 4.59
PTPRUQ92729 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC43.67■■■■■ 4.58
PTPRUQ92729 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.64■■■■■ 4.58
PTPRUQ92729 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC43.61■■■■■ 4.57
PTPRUQ92729 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.47■■■■■ 4.55
PTPRUQ92729 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC43.43■■■■■ 4.54
PTPRUQ92729 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.42■■■■■ 4.54
PTPRUQ92729 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC43.41■■■■■ 4.54
PTPRUQ92729 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.36■■■■■ 4.53
PTPRUQ92729 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC43.3■■■■■ 4.52
PTPRUQ92729 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
PTPRUQ92729 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC43.22■■■■■ 4.51
PTPRUQ92729 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC43.2■■■■■ 4.51
PTPRUQ92729 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC43.2■■■■■ 4.51
PTPRUQ92729 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.18■■■■■ 4.5
PTPRUQ92729 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.18■■■■■ 4.5
PTPRUQ92729 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC43.18■■■■■ 4.5
PTPRUQ92729 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC43.15■■■■■ 4.5
PTPRUQ92729 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.5
PTPRUQ92729 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC43.06■■■■■ 4.48
PTPRUQ92729 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.45
PTPRUQ92729 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.45
PTPRUQ92729 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.87■■■■■ 4.45
PTPRUQ92729 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.84■■■■■ 4.45
PTPRUQ92729 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC42.78■■■■■ 4.44
PTPRUQ92729 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC42.77■■■■■ 4.44
PTPRUQ92729 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
PTPRUQ92729 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC42.7■■■■■ 4.43
PTPRUQ92729 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.64■■■■■ 4.42
PTPRUQ92729 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.41
PTPRUQ92729 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.41
PTPRUQ92729 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
PTPRUQ92729 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC42.59■■■■■ 4.41
PTPRUQ92729 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
PTPRUQ92729 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC42.59■■■■■ 4.41
PTPRUQ92729 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
PTPRUQ92729 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
PTPRUQ92729 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC42.55■■■■■ 4.4
PTPRUQ92729 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
PTPRUQ92729 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC42.54■■■■■ 4.4
PTPRUQ92729 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC42.45■■■■■ 4.39
PTPRUQ92729 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
PTPRUQ92729 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
PTPRUQ92729 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
PTPRUQ92729 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
PTPRUQ92729 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
PTPRUQ92729 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC42.33■■■■■ 4.37
PTPRUQ92729 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC42.29■■■■■ 4.36
PTPRUQ92729 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC42.14■■■■■ 4.34
PTPRUQ92729 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC42.13■■■■■ 4.34
PTPRUQ92729 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.12■■■■■ 4.33
PTPRUQ92729 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC42.12■■■■■ 4.33
PTPRUQ92729 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC42.12■■■■■ 4.33
PTPRUQ92729 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
PTPRUQ92729 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
PTPRUQ92729 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.03■■■■■ 4.32
PTPRUQ92729 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.03■■■■■ 4.32
PTPRUQ92729 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC42.01■■■■■ 4.32
PTPRUQ92729 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms