Protein–RNA interactions for Protein: Q92692

NECTIN2, Nectin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN2Q92692 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC44.34■■■■■ 4.69
NECTIN2Q92692 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.16■■■■■ 4.5
NECTIN2Q92692 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
NECTIN2Q92692 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC42.95■■■■■ 4.47
NECTIN2Q92692 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.95■■■■■ 4.47
NECTIN2Q92692 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
NECTIN2Q92692 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC42.83■■■■■ 4.45
NECTIN2Q92692 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.26■■■■■ 4.36
NECTIN2Q92692 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
NECTIN2Q92692 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC41.69■■■■■ 4.27
NECTIN2Q92692 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC41.49■■■■■ 4.23
NECTIN2Q92692 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.36■■■■■ 4.21
NECTIN2Q92692 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.34■■■■■ 4.21
NECTIN2Q92692 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC41.32■■■■■ 4.21
NECTIN2Q92692 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC41.17■■■■■ 4.18
NECTIN2Q92692 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC41.16■■■■■ 4.18
NECTIN2Q92692 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC41.05■■■■■ 4.16
NECTIN2Q92692 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
NECTIN2Q92692 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
NECTIN2Q92692 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC40.72■■■■■ 4.11
NECTIN2Q92692 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.65■■■■■ 4.1
NECTIN2Q92692 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
NECTIN2Q92692 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
NECTIN2Q92692 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
NECTIN2Q92692 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
NECTIN2Q92692 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
NECTIN2Q92692 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
NECTIN2Q92692 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
NECTIN2Q92692 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC39.9■■■■□ 3.98
NECTIN2Q92692 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC39.85■■■■□ 3.97
NECTIN2Q92692 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
NECTIN2Q92692 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
NECTIN2Q92692 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC39.62■■■■□ 3.93
NECTIN2Q92692 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.61■■■■□ 3.93
NECTIN2Q92692 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
NECTIN2Q92692 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
NECTIN2Q92692 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
NECTIN2Q92692 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.29■■■■□ 3.88
NECTIN2Q92692 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC39.24■■■■□ 3.87
NECTIN2Q92692 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC39.22■■■■□ 3.87
NECTIN2Q92692 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
NECTIN2Q92692 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
NECTIN2Q92692 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.12■■■■□ 3.85
NECTIN2Q92692 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
NECTIN2Q92692 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC39.03■■■■□ 3.84
NECTIN2Q92692 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
NECTIN2Q92692 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC38.95■■■■□ 3.83
NECTIN2Q92692 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC38.92■■■■□ 3.82
NECTIN2Q92692 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.91■■■■□ 3.82
NECTIN2Q92692 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.82■■■■□ 3.8
NECTIN2Q92692 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC38.82■■■■□ 3.8
NECTIN2Q92692 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC38.8■■■■□ 3.8
NECTIN2Q92692 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC38.74■■■■□ 3.79
NECTIN2Q92692 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.73■■■■□ 3.79
NECTIN2Q92692 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC38.72■■■■□ 3.79
NECTIN2Q92692 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
NECTIN2Q92692 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC38.59■■■■□ 3.77
NECTIN2Q92692 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.56■■■■□ 3.76
NECTIN2Q92692 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
NECTIN2Q92692 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
NECTIN2Q92692 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
NECTIN2Q92692 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
NECTIN2Q92692 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
NECTIN2Q92692 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
NECTIN2Q92692 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC38.23■■■■□ 3.71
NECTIN2Q92692 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
NECTIN2Q92692 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
NECTIN2Q92692 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
NECTIN2Q92692 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
NECTIN2Q92692 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC38■■■■□ 3.67
NECTIN2Q92692 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
NECTIN2Q92692 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC37.86■■■■□ 3.65
NECTIN2Q92692 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
NECTIN2Q92692 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
NECTIN2Q92692 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC37.79■■■■□ 3.64
NECTIN2Q92692 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.64
NECTIN2Q92692 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.63
NECTIN2Q92692 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.74■■■■□ 3.63
NECTIN2Q92692 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
NECTIN2Q92692 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
NECTIN2Q92692 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
NECTIN2Q92692 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
NECTIN2Q92692 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
NECTIN2Q92692 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
NECTIN2Q92692 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
NECTIN2Q92692 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
NECTIN2Q92692 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
NECTIN2Q92692 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
NECTIN2Q92692 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
NECTIN2Q92692 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
NECTIN2Q92692 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
NECTIN2Q92692 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
NECTIN2Q92692 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
NECTIN2Q92692 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC37.52■■■■□ 3.6
NECTIN2Q92692 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
NECTIN2Q92692 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
NECTIN2Q92692 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
NECTIN2Q92692 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
NECTIN2Q92692 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
NECTIN2Q92692 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms