Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ60

KLHL6, Kelch-like protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL6Q8WZ60 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC33.07■■■□□ 2.89
KLHL6Q8WZ60 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
KLHL6Q8WZ60 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
KLHL6Q8WZ60 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
KLHL6Q8WZ60 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
KLHL6Q8WZ60 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
KLHL6Q8WZ60 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
KLHL6Q8WZ60 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
KLHL6Q8WZ60 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
KLHL6Q8WZ60 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
KLHL6Q8WZ60 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
KLHL6Q8WZ60 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
KLHL6Q8WZ60 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
KLHL6Q8WZ60 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
KLHL6Q8WZ60 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
KLHL6Q8WZ60 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
KLHL6Q8WZ60 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
KLHL6Q8WZ60 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
KLHL6Q8WZ60 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
KLHL6Q8WZ60 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
KLHL6Q8WZ60 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
KLHL6Q8WZ60 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
KLHL6Q8WZ60 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.25■■■□□ 2.43
KLHL6Q8WZ60 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
KLHL6Q8WZ60 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
KLHL6Q8WZ60 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
KLHL6Q8WZ60 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
KLHL6Q8WZ60 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
KLHL6Q8WZ60 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
KLHL6Q8WZ60 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
KLHL6Q8WZ60 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
KLHL6Q8WZ60 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
KLHL6Q8WZ60 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
KLHL6Q8WZ60 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
KLHL6Q8WZ60 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
KLHL6Q8WZ60 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
KLHL6Q8WZ60 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
KLHL6Q8WZ60 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
KLHL6Q8WZ60 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
KLHL6Q8WZ60 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
KLHL6Q8WZ60 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
KLHL6Q8WZ60 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
KLHL6Q8WZ60 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
KLHL6Q8WZ60 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
KLHL6Q8WZ60 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
KLHL6Q8WZ60 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
KLHL6Q8WZ60 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
KLHL6Q8WZ60 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
KLHL6Q8WZ60 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
KLHL6Q8WZ60 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
KLHL6Q8WZ60 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
KLHL6Q8WZ60 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
KLHL6Q8WZ60 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
KLHL6Q8WZ60 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
KLHL6Q8WZ60 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
KLHL6Q8WZ60 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
KLHL6Q8WZ60 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
KLHL6Q8WZ60 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KLHL6Q8WZ60 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
KLHL6Q8WZ60 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
KLHL6Q8WZ60 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
KLHL6Q8WZ60 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
KLHL6Q8WZ60 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KLHL6Q8WZ60 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KLHL6Q8WZ60 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
KLHL6Q8WZ60 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
KLHL6Q8WZ60 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KLHL6Q8WZ60 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KLHL6Q8WZ60 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KLHL6Q8WZ60 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KLHL6Q8WZ60 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KLHL6Q8WZ60 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KLHL6Q8WZ60 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
KLHL6Q8WZ60 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KLHL6Q8WZ60 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
KLHL6Q8WZ60 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KLHL6Q8WZ60 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KLHL6Q8WZ60 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KLHL6Q8WZ60 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
KLHL6Q8WZ60 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KLHL6Q8WZ60 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KLHL6Q8WZ60 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
KLHL6Q8WZ60 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KLHL6Q8WZ60 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KLHL6Q8WZ60 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KLHL6Q8WZ60 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KLHL6Q8WZ60 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
KLHL6Q8WZ60 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KLHL6Q8WZ60 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KLHL6Q8WZ60 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KLHL6Q8WZ60 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KLHL6Q8WZ60 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KLHL6Q8WZ60 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KLHL6Q8WZ60 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KLHL6Q8WZ60 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KLHL6Q8WZ60 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KLHL6Q8WZ60 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KLHL6Q8WZ60 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KLHL6Q8WZ60 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KLHL6Q8WZ60 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 825 ms