Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWN8

ARAP3, Arf-GAP with Rho-GAP domain, ANK repeat and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARAP3Q8WWN8 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC53.74■■■■■ 6.19
ARAP3Q8WWN8 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC53.47■■■■■ 6.15
ARAP3Q8WWN8 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC53.1■■■■■ 6.09
ARAP3Q8WWN8 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.29■■■■■ 5.96
ARAP3Q8WWN8 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.72■■■■■ 5.87
ARAP3Q8WWN8 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC51.35■■■■■ 5.81
ARAP3Q8WWN8 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC51.32■■■■■ 5.81
ARAP3Q8WWN8 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC51.23■■■■■ 5.79
ARAP3Q8WWN8 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC51.13■■■■■ 5.78
ARAP3Q8WWN8 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC51.08■■■■■ 5.77
ARAP3Q8WWN8 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.07■■■■■ 5.77
ARAP3Q8WWN8 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.05■■■■■ 5.76
ARAP3Q8WWN8 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC50.86■■■■■ 5.73
ARAP3Q8WWN8 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC50.72■■■■■ 5.71
ARAP3Q8WWN8 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC50.6■■■■■ 5.69
ARAP3Q8WWN8 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.51■■■■■ 5.68
ARAP3Q8WWN8 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC50.14■■■■■ 5.62
ARAP3Q8WWN8 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC49.92■■■■■ 5.58
ARAP3Q8WWN8 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.76■■■■■ 5.56
ARAP3Q8WWN8 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC49.75■■■■■ 5.56
ARAP3Q8WWN8 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC49.75■■■■■ 5.55
ARAP3Q8WWN8 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.59■■■■■ 5.53
ARAP3Q8WWN8 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC49.59■■■■■ 5.53
ARAP3Q8WWN8 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC49.5■■■■■ 5.52
ARAP3Q8WWN8 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC49.41■■■■■ 5.5
ARAP3Q8WWN8 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.35■■■■■ 5.49
ARAP3Q8WWN8 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC49.25■■■■■ 5.48
ARAP3Q8WWN8 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC49.19■■■■■ 5.46
ARAP3Q8WWN8 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC49.16■■■■■ 5.46
ARAP3Q8WWN8 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC49.13■■■■■ 5.45
ARAP3Q8WWN8 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC49.04■■■■■ 5.44
ARAP3Q8WWN8 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC48.97■■■■■ 5.43
ARAP3Q8WWN8 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.79■■■■■ 5.4
ARAP3Q8WWN8 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.72■■■■■ 5.39
ARAP3Q8WWN8 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC48.59■■■■■ 5.37
ARAP3Q8WWN8 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC48.5■■■■■ 5.35
ARAP3Q8WWN8 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC48.38■■■■■ 5.34
ARAP3Q8WWN8 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC48.36■■■■■ 5.33
ARAP3Q8WWN8 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC48.35■■■■■ 5.33
ARAP3Q8WWN8 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC48.04■■■■■ 5.28
ARAP3Q8WWN8 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.97■■■■■ 5.27
ARAP3Q8WWN8 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.83■■■■■ 5.25
ARAP3Q8WWN8 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC47.63■■■■■ 5.22
ARAP3Q8WWN8 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC47.61■■■■■ 5.21
ARAP3Q8WWN8 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC47.59■■■■■ 5.21
ARAP3Q8WWN8 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC47.49■■■■■ 5.19
ARAP3Q8WWN8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC47.46■■■■■ 5.19
ARAP3Q8WWN8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC47.46■■■■■ 5.19
ARAP3Q8WWN8 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.45■■■■■ 5.19
ARAP3Q8WWN8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC47.37■■■■■ 5.17
ARAP3Q8WWN8 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.34■■■■■ 5.17
ARAP3Q8WWN8 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC47.31■■■■■ 5.16
ARAP3Q8WWN8 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC47.27■■■■■ 5.16
ARAP3Q8WWN8 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC47.25■■■■■ 5.15
ARAP3Q8WWN8 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC47.24■■■■■ 5.15
ARAP3Q8WWN8 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC47.2■■■■■ 5.15
ARAP3Q8WWN8 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC47.14■■■■■ 5.14
ARAP3Q8WWN8 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.13■■■■■ 5.14
ARAP3Q8WWN8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC47.13■■■■■ 5.14
ARAP3Q8WWN8 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.1■■■■■ 5.13
ARAP3Q8WWN8 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC47.1■■■■■ 5.13
ARAP3Q8WWN8 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.97■■■■■ 5.11
ARAP3Q8WWN8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.95■■■■■ 5.11
ARAP3Q8WWN8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC46.9■■■■■ 5.1
ARAP3Q8WWN8 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.87■■■■■ 5.09
ARAP3Q8WWN8 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.83■■■■■ 5.09
ARAP3Q8WWN8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC46.83■■■■■ 5.09
ARAP3Q8WWN8 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.81■■■■■ 5.08
ARAP3Q8WWN8 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.8■■■■■ 5.08
ARAP3Q8WWN8 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC46.76■■■■■ 5.08
ARAP3Q8WWN8 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC46.69■■■■■ 5.07
ARAP3Q8WWN8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.65■■■■■ 5.06
ARAP3Q8WWN8 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC46.54■■■■■ 5.04
ARAP3Q8WWN8 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.53■■■■■ 5.04
ARAP3Q8WWN8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC46.46■■■■■ 5.03
ARAP3Q8WWN8 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.43■■■■■ 5.02
ARAP3Q8WWN8 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC46.43■■■■■ 5.02
ARAP3Q8WWN8 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.36■■■■■ 5.01
ARAP3Q8WWN8 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC46.36■■■■■ 5.01
ARAP3Q8WWN8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC46.36■■■■■ 5.01
ARAP3Q8WWN8 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC46.34■■■■■ 5.01
ARAP3Q8WWN8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.33■■■■■ 5.01
ARAP3Q8WWN8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC46.33■■■■■ 5.01
ARAP3Q8WWN8 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC46.33■■■■■ 5.01
ARAP3Q8WWN8 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.28■■■■■ 5
ARAP3Q8WWN8 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.27■■■■■ 5
ARAP3Q8WWN8 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.21■■■■■ 4.99
ARAP3Q8WWN8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC46.18■■■■■ 4.98
ARAP3Q8WWN8 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC46.17■■■■■ 4.98
ARAP3Q8WWN8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC46.16■■■■■ 4.98
ARAP3Q8WWN8 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC46.13■■■■■ 4.98
ARAP3Q8WWN8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC46.13■■■■■ 4.97
ARAP3Q8WWN8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.1■■■■■ 4.97
ARAP3Q8WWN8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC46.09■■■■■ 4.97
ARAP3Q8WWN8 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC46.09■■■■■ 4.97
ARAP3Q8WWN8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.07■■■■■ 4.97
ARAP3Q8WWN8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC46.07■■■■■ 4.97
ARAP3Q8WWN8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC46.07■■■■■ 4.97
ARAP3Q8WWN8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.05■■■■■ 4.96
ARAP3Q8WWN8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC46.04■■■■■ 4.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms