Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3U4

STAG2, Cohesin subunit SA-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG2Q8N3U4 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC40.01■■■■□ 3.99
STAG2Q8N3U4 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
STAG2Q8N3U4 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.82■■■■□ 3.81
STAG2Q8N3U4 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC38.8■■■■□ 3.8
STAG2Q8N3U4 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
STAG2Q8N3U4 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
STAG2Q8N3U4 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC38.52■■■■□ 3.76
STAG2Q8N3U4 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.68
STAG2Q8N3U4 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.83■■■■□ 3.65
STAG2Q8N3U4 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
STAG2Q8N3U4 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
STAG2Q8N3U4 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
STAG2Q8N3U4 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
STAG2Q8N3U4 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
STAG2Q8N3U4 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
STAG2Q8N3U4 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
STAG2Q8N3U4 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.52
STAG2Q8N3U4 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC36.96■■■■□ 3.51
STAG2Q8N3U4 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
STAG2Q8N3U4 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC36.74■■■■□ 3.47
STAG2Q8N3U4 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
STAG2Q8N3U4 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
STAG2Q8N3U4 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
STAG2Q8N3U4 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
STAG2Q8N3U4 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
STAG2Q8N3U4 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
STAG2Q8N3U4 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
STAG2Q8N3U4 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
STAG2Q8N3U4 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
STAG2Q8N3U4 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
STAG2Q8N3U4 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
STAG2Q8N3U4 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC35.82■■■■□ 3.32
STAG2Q8N3U4 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC35.79■■■■□ 3.32
STAG2Q8N3U4 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
STAG2Q8N3U4 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
STAG2Q8N3U4 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC35.7■■■■□ 3.31
STAG2Q8N3U4 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
STAG2Q8N3U4 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
STAG2Q8N3U4 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
STAG2Q8N3U4 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
STAG2Q8N3U4 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
STAG2Q8N3U4 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
STAG2Q8N3U4 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
STAG2Q8N3U4 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
STAG2Q8N3U4 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.24
STAG2Q8N3U4 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
STAG2Q8N3U4 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
STAG2Q8N3U4 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
STAG2Q8N3U4 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
STAG2Q8N3U4 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
STAG2Q8N3U4 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.19
STAG2Q8N3U4 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
STAG2Q8N3U4 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
STAG2Q8N3U4 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
STAG2Q8N3U4 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
STAG2Q8N3U4 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
STAG2Q8N3U4 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
STAG2Q8N3U4 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
STAG2Q8N3U4 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
STAG2Q8N3U4 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
STAG2Q8N3U4 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
STAG2Q8N3U4 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
STAG2Q8N3U4 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
STAG2Q8N3U4 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
STAG2Q8N3U4 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC34.46■■■■□ 3.11
STAG2Q8N3U4 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
STAG2Q8N3U4 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
STAG2Q8N3U4 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
STAG2Q8N3U4 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
STAG2Q8N3U4 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
STAG2Q8N3U4 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
STAG2Q8N3U4 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
STAG2Q8N3U4 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
STAG2Q8N3U4 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
STAG2Q8N3U4 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
STAG2Q8N3U4 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
STAG2Q8N3U4 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
STAG2Q8N3U4 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
STAG2Q8N3U4 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC34.08■■■■□ 3.05
STAG2Q8N3U4 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
STAG2Q8N3U4 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
STAG2Q8N3U4 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
STAG2Q8N3U4 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
STAG2Q8N3U4 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
STAG2Q8N3U4 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
STAG2Q8N3U4 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
STAG2Q8N3U4 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
STAG2Q8N3U4 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
STAG2Q8N3U4 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
STAG2Q8N3U4 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
STAG2Q8N3U4 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
STAG2Q8N3U4 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
STAG2Q8N3U4 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
STAG2Q8N3U4 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
STAG2Q8N3U4 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC33.79■■■■□ 3
STAG2Q8N3U4 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
STAG2Q8N3U4 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
STAG2Q8N3U4 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
STAG2Q8N3U4 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
STAG2Q8N3U4 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms