Protein–RNA interactions for Protein: Q86YV5

PRAG1, Tyrosine-protein kinase PRAG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAG1Q86YV5 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC49.29■■■■■ 5.48
PRAG1Q86YV5 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC48.79■■■■■ 5.4
PRAG1Q86YV5 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.12■■■■■ 5.29
PRAG1Q86YV5 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC48.02■■■■■ 5.28
PRAG1Q86YV5 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.94■■■■■ 5.27
PRAG1Q86YV5 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.74■■■■■ 5.23
PRAG1Q86YV5 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.7■■■■■ 5.23
PRAG1Q86YV5 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC47.64■■■■■ 5.22
PRAG1Q86YV5 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC46.63■■■■■ 5.05
PRAG1Q86YV5 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.51■■■■■ 5.04
PRAG1Q86YV5 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC46.43■■■■■ 5.02
PRAG1Q86YV5 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC46.35■■■■■ 5.01
PRAG1Q86YV5 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC46.27■■■■■ 5
PRAG1Q86YV5 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC46.25■■■■■ 4.99
PRAG1Q86YV5 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC46.23■■■■■ 4.99
PRAG1Q86YV5 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.1■■■■■ 4.97
PRAG1Q86YV5 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.03■■■■■ 4.96
PRAG1Q86YV5 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC45.88■■■■■ 4.94
PRAG1Q86YV5 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC45.81■■■■■ 4.92
PRAG1Q86YV5 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.71■■■■■ 4.91
PRAG1Q86YV5 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.69■■■■■ 4.91
PRAG1Q86YV5 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.69■■■■■ 4.9
PRAG1Q86YV5 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.57■■■■■ 4.88
PRAG1Q86YV5 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC45.33■■■■■ 4.85
PRAG1Q86YV5 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.25■■■■■ 4.83
PRAG1Q86YV5 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.98■■■■■ 4.79
PRAG1Q86YV5 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC44.98■■■■■ 4.79
PRAG1Q86YV5 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.86■■■■■ 4.77
PRAG1Q86YV5 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.83■■■■■ 4.77
PRAG1Q86YV5 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC44.83■■■■■ 4.77
PRAG1Q86YV5 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.68■■■■■ 4.74
PRAG1Q86YV5 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.59■■■■■ 4.73
PRAG1Q86YV5 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC44.58■■■■■ 4.73
PRAG1Q86YV5 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.57■■■■■ 4.73
PRAG1Q86YV5 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.51■■■■■ 4.72
PRAG1Q86YV5 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC44.35■■■■■ 4.69
PRAG1Q86YV5 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC44.34■■■■■ 4.69
PRAG1Q86YV5 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC44.33■■■■■ 4.69
PRAG1Q86YV5 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC44.29■■■■■ 4.68
PRAG1Q86YV5 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.17■■■■■ 4.66
PRAG1Q86YV5 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC44■■■■■ 4.63
PRAG1Q86YV5 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC44■■■■■ 4.63
PRAG1Q86YV5 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC43.92■■■■■ 4.62
PRAG1Q86YV5 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.8■■■■■ 4.6
PRAG1Q86YV5 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43.69■■■■■ 4.58
PRAG1Q86YV5 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC43.65■■■■■ 4.58
PRAG1Q86YV5 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.58■■■■■ 4.57
PRAG1Q86YV5 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.57■■■■■ 4.57
PRAG1Q86YV5 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC43.56■■■■■ 4.56
PRAG1Q86YV5 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.39■■■■■ 4.54
PRAG1Q86YV5 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43.36■■■■■ 4.53
PRAG1Q86YV5 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
PRAG1Q86YV5 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.33■■■■■ 4.53
PRAG1Q86YV5 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.25■■■■■ 4.51
PRAG1Q86YV5 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC43.24■■■■■ 4.51
PRAG1Q86YV5 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC43.21■■■■■ 4.51
PRAG1Q86YV5 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.49
PRAG1Q86YV5 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC43.07■■■■■ 4.49
PRAG1Q86YV5 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
PRAG1Q86YV5 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.95■■■■■ 4.47
PRAG1Q86YV5 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC42.94■■■■■ 4.46
PRAG1Q86YV5 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC42.93■■■■■ 4.46
PRAG1Q86YV5 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC42.92■■■■■ 4.46
PRAG1Q86YV5 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
PRAG1Q86YV5 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC42.81■■■■■ 4.44
PRAG1Q86YV5 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC42.81■■■■■ 4.44
PRAG1Q86YV5 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
PRAG1Q86YV5 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC42.77■■■■■ 4.44
PRAG1Q86YV5 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
PRAG1Q86YV5 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.71■■■■■ 4.43
PRAG1Q86YV5 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
PRAG1Q86YV5 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
PRAG1Q86YV5 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.42
PRAG1Q86YV5 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
PRAG1Q86YV5 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC42.59■■■■■ 4.41
PRAG1Q86YV5 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC42.58■■■■■ 4.41
PRAG1Q86YV5 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
PRAG1Q86YV5 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC42.56■■■■■ 4.4
PRAG1Q86YV5 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
PRAG1Q86YV5 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
PRAG1Q86YV5 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC42.42■■■■■ 4.38
PRAG1Q86YV5 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
PRAG1Q86YV5 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
PRAG1Q86YV5 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC42.35■■■■■ 4.37
PRAG1Q86YV5 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
PRAG1Q86YV5 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.32■■■■■ 4.37
PRAG1Q86YV5 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
PRAG1Q86YV5 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.24■■■■■ 4.35
PRAG1Q86YV5 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.22■■■■■ 4.35
PRAG1Q86YV5 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC42.21■■■■■ 4.35
PRAG1Q86YV5 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
PRAG1Q86YV5 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
PRAG1Q86YV5 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC42.14■■■■■ 4.34
PRAG1Q86YV5 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC42.14■■■■■ 4.34
PRAG1Q86YV5 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC42.12■■■■■ 4.33
PRAG1Q86YV5 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC42.12■■■■■ 4.33
PRAG1Q86YV5 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
PRAG1Q86YV5 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
PRAG1Q86YV5 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
PRAG1Q86YV5 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.96■■■■■ 4.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms