Protein–RNA interactions for Protein: Q86XT4

TRIM50, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM50, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM50Q86XT4 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC38.67■■■■□ 3.78
TRIM50Q86XT4 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC37.71■■■■□ 3.63
TRIM50Q86XT4 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
TRIM50Q86XT4 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
TRIM50Q86XT4 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
TRIM50Q86XT4 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
TRIM50Q86XT4 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC37.23■■■■□ 3.55
TRIM50Q86XT4 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.09■■■■□ 3.53
TRIM50Q86XT4 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
TRIM50Q86XT4 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
TRIM50Q86XT4 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
TRIM50Q86XT4 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
TRIM50Q86XT4 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
TRIM50Q86XT4 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC36.04■■■■□ 3.36
TRIM50Q86XT4 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
TRIM50Q86XT4 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
TRIM50Q86XT4 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
TRIM50Q86XT4 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
TRIM50Q86XT4 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
TRIM50Q86XT4 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
TRIM50Q86XT4 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
TRIM50Q86XT4 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
TRIM50Q86XT4 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
TRIM50Q86XT4 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
TRIM50Q86XT4 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
TRIM50Q86XT4 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
TRIM50Q86XT4 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
TRIM50Q86XT4 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.19
TRIM50Q86XT4 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
TRIM50Q86XT4 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
TRIM50Q86XT4 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
TRIM50Q86XT4 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
TRIM50Q86XT4 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
TRIM50Q86XT4 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
TRIM50Q86XT4 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.11
TRIM50Q86XT4 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
TRIM50Q86XT4 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
TRIM50Q86XT4 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
TRIM50Q86XT4 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
TRIM50Q86XT4 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.08
TRIM50Q86XT4 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
TRIM50Q86XT4 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
TRIM50Q86XT4 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
TRIM50Q86XT4 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
TRIM50Q86XT4 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
TRIM50Q86XT4 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
TRIM50Q86XT4 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
TRIM50Q86XT4 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
TRIM50Q86XT4 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
TRIM50Q86XT4 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
TRIM50Q86XT4 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
TRIM50Q86XT4 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
TRIM50Q86XT4 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
TRIM50Q86XT4 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
TRIM50Q86XT4 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
TRIM50Q86XT4 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
TRIM50Q86XT4 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
TRIM50Q86XT4 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
TRIM50Q86XT4 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
TRIM50Q86XT4 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
TRIM50Q86XT4 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
TRIM50Q86XT4 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
TRIM50Q86XT4 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
TRIM50Q86XT4 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
TRIM50Q86XT4 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
TRIM50Q86XT4 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC33.29■■■□□ 2.92
TRIM50Q86XT4 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
TRIM50Q86XT4 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
TRIM50Q86XT4 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
TRIM50Q86XT4 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.18■■■□□ 2.9
TRIM50Q86XT4 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
TRIM50Q86XT4 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
TRIM50Q86XT4 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
TRIM50Q86XT4 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
TRIM50Q86XT4 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
TRIM50Q86XT4 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
TRIM50Q86XT4 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
TRIM50Q86XT4 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
TRIM50Q86XT4 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
TRIM50Q86XT4 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
TRIM50Q86XT4 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
TRIM50Q86XT4 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
TRIM50Q86XT4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
TRIM50Q86XT4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
TRIM50Q86XT4 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
TRIM50Q86XT4 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
TRIM50Q86XT4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
TRIM50Q86XT4 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
TRIM50Q86XT4 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
TRIM50Q86XT4 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
TRIM50Q86XT4 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
TRIM50Q86XT4 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
TRIM50Q86XT4 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
TRIM50Q86XT4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
TRIM50Q86XT4 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
TRIM50Q86XT4 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
TRIM50Q86XT4 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
TRIM50Q86XT4 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
TRIM50Q86XT4 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
TRIM50Q86XT4 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms