Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z4F1

LRP10, Low-density lipoprotein receptor-related protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP10Q7Z4F1 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC44.2■■■■■ 4.67
LRP10Q7Z4F1 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC43.11■■■■■ 4.49
LRP10Q7Z4F1 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
LRP10Q7Z4F1 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
LRP10Q7Z4F1 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
LRP10Q7Z4F1 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.67■■■■■ 4.42
LRP10Q7Z4F1 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC42.52■■■■■ 4.4
LRP10Q7Z4F1 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.4■■■■■ 4.38
LRP10Q7Z4F1 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
LRP10Q7Z4F1 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC41.39■■■■■ 4.22
LRP10Q7Z4F1 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.33■■■■■ 4.21
LRP10Q7Z4F1 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC41.31■■■■■ 4.2
LRP10Q7Z4F1 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.14■■■■■ 4.18
LRP10Q7Z4F1 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC41.13■■■■■ 4.17
LRP10Q7Z4F1 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC41.13■■■■■ 4.17
LRP10Q7Z4F1 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC40.98■■■■■ 4.15
LRP10Q7Z4F1 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
LRP10Q7Z4F1 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
LRP10Q7Z4F1 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC40.73■■■■■ 4.11
LRP10Q7Z4F1 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.54■■■■■ 4.08
LRP10Q7Z4F1 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
LRP10Q7Z4F1 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
LRP10Q7Z4F1 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
LRP10Q7Z4F1 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC40.06■■■■■ 4
LRP10Q7Z4F1 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
LRP10Q7Z4F1 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
LRP10Q7Z4F1 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
LRP10Q7Z4F1 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
LRP10Q7Z4F1 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC39.8■■■■□ 3.96
LRP10Q7Z4F1 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC39.79■■■■□ 3.96
LRP10Q7Z4F1 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
LRP10Q7Z4F1 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
LRP10Q7Z4F1 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
LRP10Q7Z4F1 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.47■■■■□ 3.91
LRP10Q7Z4F1 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC39.4■■■■□ 3.9
LRP10Q7Z4F1 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
LRP10Q7Z4F1 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC39.26■■■■□ 3.88
LRP10Q7Z4F1 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
LRP10Q7Z4F1 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
LRP10Q7Z4F1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.09■■■■□ 3.85
LRP10Q7Z4F1 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC39.06■■■■□ 3.84
LRP10Q7Z4F1 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
LRP10Q7Z4F1 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC39.02■■■■□ 3.84
LRP10Q7Z4F1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC38.93■■■■□ 3.82
LRP10Q7Z4F1 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC38.86■■■■□ 3.81
LRP10Q7Z4F1 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
LRP10Q7Z4F1 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC38.73■■■■□ 3.79
LRP10Q7Z4F1 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
LRP10Q7Z4F1 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.65■■■■□ 3.78
LRP10Q7Z4F1 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.57■■■■□ 3.76
LRP10Q7Z4F1 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC38.56■■■■□ 3.76
LRP10Q7Z4F1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
LRP10Q7Z4F1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
LRP10Q7Z4F1 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC38.44■■■■□ 3.74
LRP10Q7Z4F1 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.43■■■■□ 3.74
LRP10Q7Z4F1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
LRP10Q7Z4F1 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
LRP10Q7Z4F1 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
LRP10Q7Z4F1 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
LRP10Q7Z4F1 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC38.22■■■■□ 3.71
LRP10Q7Z4F1 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
LRP10Q7Z4F1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC38.1■■■■□ 3.69
LRP10Q7Z4F1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
LRP10Q7Z4F1 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
LRP10Q7Z4F1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
LRP10Q7Z4F1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC37.98■■■■□ 3.67
LRP10Q7Z4F1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC37.96■■■■□ 3.67
LRP10Q7Z4F1 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC37.92■■■■□ 3.66
LRP10Q7Z4F1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
LRP10Q7Z4F1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
LRP10Q7Z4F1 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
LRP10Q7Z4F1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
LRP10Q7Z4F1 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
LRP10Q7Z4F1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
LRP10Q7Z4F1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
LRP10Q7Z4F1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
LRP10Q7Z4F1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
LRP10Q7Z4F1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
LRP10Q7Z4F1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
LRP10Q7Z4F1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
LRP10Q7Z4F1 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC37.66■■■■□ 3.62
LRP10Q7Z4F1 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.61
LRP10Q7Z4F1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
LRP10Q7Z4F1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
LRP10Q7Z4F1 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
LRP10Q7Z4F1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
LRP10Q7Z4F1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC37.51■■■■□ 3.6
LRP10Q7Z4F1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
LRP10Q7Z4F1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
LRP10Q7Z4F1 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
LRP10Q7Z4F1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC37.47■■■■□ 3.59
LRP10Q7Z4F1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
LRP10Q7Z4F1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
LRP10Q7Z4F1 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
LRP10Q7Z4F1 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
LRP10Q7Z4F1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
LRP10Q7Z4F1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.57
LRP10Q7Z4F1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
LRP10Q7Z4F1 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
LRP10Q7Z4F1 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms