Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTR5

CFAP47, Cilia- and flagella-associated protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 3,102 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP47Q6ZTR5 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
CFAP47Q6ZTR5 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
CFAP47Q6ZTR5 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC32.32■■■□□ 2.76
CFAP47Q6ZTR5 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CFAP47Q6ZTR5 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
CFAP47Q6ZTR5 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
CFAP47Q6ZTR5 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CFAP47Q6ZTR5 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
CFAP47Q6ZTR5 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CFAP47Q6ZTR5 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
CFAP47Q6ZTR5 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CFAP47Q6ZTR5 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CFAP47Q6ZTR5 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CFAP47Q6ZTR5 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CFAP47Q6ZTR5 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CFAP47Q6ZTR5 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.76■■■□□ 2.52
CFAP47Q6ZTR5 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CFAP47Q6ZTR5 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CFAP47Q6ZTR5 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
CFAP47Q6ZTR5 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
CFAP47Q6ZTR5 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CFAP47Q6ZTR5 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CFAP47Q6ZTR5 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CFAP47Q6ZTR5 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CFAP47Q6ZTR5 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CFAP47Q6ZTR5 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.44
CFAP47Q6ZTR5 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CFAP47Q6ZTR5 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CFAP47Q6ZTR5 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CFAP47Q6ZTR5 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CFAP47Q6ZTR5 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CFAP47Q6ZTR5 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
CFAP47Q6ZTR5 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CFAP47Q6ZTR5 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.76■■■□□ 2.36
CFAP47Q6ZTR5 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CFAP47Q6ZTR5 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CFAP47Q6ZTR5 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CFAP47Q6ZTR5 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CFAP47Q6ZTR5 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CFAP47Q6ZTR5 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CFAP47Q6ZTR5 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CFAP47Q6ZTR5 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CFAP47Q6ZTR5 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CFAP47Q6ZTR5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CFAP47Q6ZTR5 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CFAP47Q6ZTR5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CFAP47Q6ZTR5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CFAP47Q6ZTR5 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CFAP47Q6ZTR5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CFAP47Q6ZTR5 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CFAP47Q6ZTR5 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CFAP47Q6ZTR5 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CFAP47Q6ZTR5 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CFAP47Q6ZTR5 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CFAP47Q6ZTR5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CFAP47Q6ZTR5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CFAP47Q6ZTR5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CFAP47Q6ZTR5 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CFAP47Q6ZTR5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CFAP47Q6ZTR5 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CFAP47Q6ZTR5 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CFAP47Q6ZTR5 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CFAP47Q6ZTR5 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CFAP47Q6ZTR5 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CFAP47Q6ZTR5 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CFAP47Q6ZTR5 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CFAP47Q6ZTR5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CFAP47Q6ZTR5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CFAP47Q6ZTR5 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CFAP47Q6ZTR5 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CFAP47Q6ZTR5 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CFAP47Q6ZTR5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CFAP47Q6ZTR5 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CFAP47Q6ZTR5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CFAP47Q6ZTR5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CFAP47Q6ZTR5 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CFAP47Q6ZTR5 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CFAP47Q6ZTR5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CFAP47Q6ZTR5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CFAP47Q6ZTR5 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CFAP47Q6ZTR5 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CFAP47Q6ZTR5 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CFAP47Q6ZTR5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CFAP47Q6ZTR5 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CFAP47Q6ZTR5 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CFAP47Q6ZTR5 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CFAP47Q6ZTR5 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CFAP47Q6ZTR5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CFAP47Q6ZTR5 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CFAP47Q6ZTR5 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CFAP47Q6ZTR5 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CFAP47Q6ZTR5 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CFAP47Q6ZTR5 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CFAP47Q6ZTR5 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CFAP47Q6ZTR5 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CFAP47Q6ZTR5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CFAP47Q6ZTR5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CFAP47Q6ZTR5 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CFAP47Q6ZTR5 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CFAP47Q6ZTR5 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
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