Protein–RNA interactions for Protein: Q6UY18

LINGO4, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINGO4Q6UY18 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC35.03■■■■□ 3.2
LINGO4Q6UY18 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
LINGO4Q6UY18 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
LINGO4Q6UY18 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
LINGO4Q6UY18 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
LINGO4Q6UY18 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
LINGO4Q6UY18 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
LINGO4Q6UY18 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
LINGO4Q6UY18 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
LINGO4Q6UY18 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
LINGO4Q6UY18 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
LINGO4Q6UY18 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
LINGO4Q6UY18 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
LINGO4Q6UY18 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
LINGO4Q6UY18 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
LINGO4Q6UY18 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
LINGO4Q6UY18 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
LINGO4Q6UY18 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
LINGO4Q6UY18 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
LINGO4Q6UY18 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
LINGO4Q6UY18 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
LINGO4Q6UY18 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
LINGO4Q6UY18 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
LINGO4Q6UY18 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
LINGO4Q6UY18 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
LINGO4Q6UY18 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
LINGO4Q6UY18 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
LINGO4Q6UY18 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
LINGO4Q6UY18 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
LINGO4Q6UY18 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
LINGO4Q6UY18 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
LINGO4Q6UY18 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
LINGO4Q6UY18 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
LINGO4Q6UY18 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
LINGO4Q6UY18 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
LINGO4Q6UY18 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
LINGO4Q6UY18 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.27■■■□□ 2.6
LINGO4Q6UY18 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
LINGO4Q6UY18 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
LINGO4Q6UY18 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
LINGO4Q6UY18 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
LINGO4Q6UY18 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
LINGO4Q6UY18 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
LINGO4Q6UY18 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
LINGO4Q6UY18 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
LINGO4Q6UY18 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
LINGO4Q6UY18 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
LINGO4Q6UY18 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
LINGO4Q6UY18 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
LINGO4Q6UY18 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
LINGO4Q6UY18 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
LINGO4Q6UY18 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.49
LINGO4Q6UY18 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
LINGO4Q6UY18 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
LINGO4Q6UY18 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
LINGO4Q6UY18 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
LINGO4Q6UY18 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
LINGO4Q6UY18 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
LINGO4Q6UY18 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
LINGO4Q6UY18 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
LINGO4Q6UY18 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
LINGO4Q6UY18 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
LINGO4Q6UY18 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
LINGO4Q6UY18 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
LINGO4Q6UY18 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
LINGO4Q6UY18 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
LINGO4Q6UY18 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
LINGO4Q6UY18 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
LINGO4Q6UY18 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
LINGO4Q6UY18 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
LINGO4Q6UY18 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
LINGO4Q6UY18 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
LINGO4Q6UY18 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
LINGO4Q6UY18 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
LINGO4Q6UY18 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
LINGO4Q6UY18 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
LINGO4Q6UY18 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
LINGO4Q6UY18 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
LINGO4Q6UY18 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
LINGO4Q6UY18 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
LINGO4Q6UY18 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
LINGO4Q6UY18 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
LINGO4Q6UY18 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
LINGO4Q6UY18 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
LINGO4Q6UY18 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
LINGO4Q6UY18 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
LINGO4Q6UY18 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
LINGO4Q6UY18 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
LINGO4Q6UY18 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
LINGO4Q6UY18 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
LINGO4Q6UY18 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
LINGO4Q6UY18 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
LINGO4Q6UY18 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
LINGO4Q6UY18 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
LINGO4Q6UY18 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
LINGO4Q6UY18 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
LINGO4Q6UY18 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
LINGO4Q6UY18 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
LINGO4Q6UY18 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
LINGO4Q6UY18 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.6 ms