Protein–RNA interactions for Protein: Q5T442

GJC2, Gap junction gamma-2 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC2Q5T442 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC39.07■■■■□ 3.84
GJC2Q5T442 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC38.68■■■■□ 3.78
GJC2Q5T442 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.19■■■■□ 3.7
GJC2Q5T442 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
GJC2Q5T442 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
GJC2Q5T442 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
GJC2Q5T442 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
GJC2Q5T442 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC37.45■■■■□ 3.59
GJC2Q5T442 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
GJC2Q5T442 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC36.93■■■■□ 3.5
GJC2Q5T442 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
GJC2Q5T442 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
GJC2Q5T442 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC36.69■■■■□ 3.46
GJC2Q5T442 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
GJC2Q5T442 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
GJC2Q5T442 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
GJC2Q5T442 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
GJC2Q5T442 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
GJC2Q5T442 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
GJC2Q5T442 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
GJC2Q5T442 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
GJC2Q5T442 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
GJC2Q5T442 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
GJC2Q5T442 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC35.86■■■■□ 3.33
GJC2Q5T442 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
GJC2Q5T442 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
GJC2Q5T442 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
GJC2Q5T442 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
GJC2Q5T442 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
GJC2Q5T442 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
GJC2Q5T442 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
GJC2Q5T442 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
GJC2Q5T442 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
GJC2Q5T442 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
GJC2Q5T442 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC35.24■■■■□ 3.23
GJC2Q5T442 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
GJC2Q5T442 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
GJC2Q5T442 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
GJC2Q5T442 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
GJC2Q5T442 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
GJC2Q5T442 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
GJC2Q5T442 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
GJC2Q5T442 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
GJC2Q5T442 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
GJC2Q5T442 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
GJC2Q5T442 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
GJC2Q5T442 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
GJC2Q5T442 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
GJC2Q5T442 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
GJC2Q5T442 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
GJC2Q5T442 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
GJC2Q5T442 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
GJC2Q5T442 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
GJC2Q5T442 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
GJC2Q5T442 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
GJC2Q5T442 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
GJC2Q5T442 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
GJC2Q5T442 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
GJC2Q5T442 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
GJC2Q5T442 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
GJC2Q5T442 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
GJC2Q5T442 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
GJC2Q5T442 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
GJC2Q5T442 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
GJC2Q5T442 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
GJC2Q5T442 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
GJC2Q5T442 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
GJC2Q5T442 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
GJC2Q5T442 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
GJC2Q5T442 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
GJC2Q5T442 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
GJC2Q5T442 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
GJC2Q5T442 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
GJC2Q5T442 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
GJC2Q5T442 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
GJC2Q5T442 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
GJC2Q5T442 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
GJC2Q5T442 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
GJC2Q5T442 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
GJC2Q5T442 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
GJC2Q5T442 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
GJC2Q5T442 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
GJC2Q5T442 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
GJC2Q5T442 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
GJC2Q5T442 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
GJC2Q5T442 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
GJC2Q5T442 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC33.61■■■□□ 2.97
GJC2Q5T442 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
GJC2Q5T442 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC33.55■■■□□ 2.96
GJC2Q5T442 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
GJC2Q5T442 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
GJC2Q5T442 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
GJC2Q5T442 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
GJC2Q5T442 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
GJC2Q5T442 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
GJC2Q5T442 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
GJC2Q5T442 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.93
GJC2Q5T442 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
GJC2Q5T442 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
GJC2Q5T442 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms