Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC36.75■■■■□ 3.47
CTXN3Q4LDR2 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC35.83■■■■□ 3.33
CTXN3Q4LDR2 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
CTXN3Q4LDR2 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
CTXN3Q4LDR2 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
CTXN3Q4LDR2 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
CTXN3Q4LDR2 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
CTXN3Q4LDR2 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.22■■■■□ 3.23
CTXN3Q4LDR2 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
CTXN3Q4LDR2 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
CTXN3Q4LDR2 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
CTXN3Q4LDR2 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
CTXN3Q4LDR2 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CTXN3Q4LDR2 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CTXN3Q4LDR2 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
CTXN3Q4LDR2 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
CTXN3Q4LDR2 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CTXN3Q4LDR2 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
CTXN3Q4LDR2 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CTXN3Q4LDR2 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CTXN3Q4LDR2 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CTXN3Q4LDR2 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
CTXN3Q4LDR2 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CTXN3Q4LDR2 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CTXN3Q4LDR2 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CTXN3Q4LDR2 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CTXN3Q4LDR2 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CTXN3Q4LDR2 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CTXN3Q4LDR2 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CTXN3Q4LDR2 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CTXN3Q4LDR2 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CTXN3Q4LDR2 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CTXN3Q4LDR2 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
CTXN3Q4LDR2 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CTXN3Q4LDR2 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
CTXN3Q4LDR2 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CTXN3Q4LDR2 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CTXN3Q4LDR2 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CTXN3Q4LDR2 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
CTXN3Q4LDR2 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
CTXN3Q4LDR2 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CTXN3Q4LDR2 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
CTXN3Q4LDR2 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CTXN3Q4LDR2 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
CTXN3Q4LDR2 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
CTXN3Q4LDR2 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CTXN3Q4LDR2 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CTXN3Q4LDR2 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CTXN3Q4LDR2 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CTXN3Q4LDR2 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CTXN3Q4LDR2 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CTXN3Q4LDR2 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CTXN3Q4LDR2 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CTXN3Q4LDR2 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CTXN3Q4LDR2 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CTXN3Q4LDR2 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CTXN3Q4LDR2 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
CTXN3Q4LDR2 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
CTXN3Q4LDR2 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
CTXN3Q4LDR2 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
CTXN3Q4LDR2 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.68
CTXN3Q4LDR2 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
CTXN3Q4LDR2 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
CTXN3Q4LDR2 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC31.68■■■□□ 2.66
CTXN3Q4LDR2 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CTXN3Q4LDR2 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
CTXN3Q4LDR2 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CTXN3Q4LDR2 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CTXN3Q4LDR2 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
CTXN3Q4LDR2 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CTXN3Q4LDR2 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CTXN3Q4LDR2 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.45■■■□□ 2.63
CTXN3Q4LDR2 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
CTXN3Q4LDR2 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC31.42■■■□□ 2.62
CTXN3Q4LDR2 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CTXN3Q4LDR2 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
CTXN3Q4LDR2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
CTXN3Q4LDR2 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
CTXN3Q4LDR2 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
CTXN3Q4LDR2 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CTXN3Q4LDR2 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
CTXN3Q4LDR2 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CTXN3Q4LDR2 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
CTXN3Q4LDR2 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
CTXN3Q4LDR2 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
CTXN3Q4LDR2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CTXN3Q4LDR2 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CTXN3Q4LDR2 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CTXN3Q4LDR2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CTXN3Q4LDR2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CTXN3Q4LDR2 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CTXN3Q4LDR2 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
CTXN3Q4LDR2 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
CTXN3Q4LDR2 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CTXN3Q4LDR2 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CTXN3Q4LDR2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
CTXN3Q4LDR2 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
CTXN3Q4LDR2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
CTXN3Q4LDR2 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
CTXN3Q4LDR2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms