Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC36.58■■■■□ 3.45
CCDC142Q17RM4 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
CCDC142Q17RM4 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
CCDC142Q17RM4 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
CCDC142Q17RM4 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
CCDC142Q17RM4 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
CCDC142Q17RM4 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.24
CCDC142Q17RM4 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.71■■■■□ 3.15
CCDC142Q17RM4 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
CCDC142Q17RM4 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
CCDC142Q17RM4 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
CCDC142Q17RM4 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CCDC142Q17RM4 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CCDC142Q17RM4 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CCDC142Q17RM4 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CCDC142Q17RM4 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CCDC142Q17RM4 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CCDC142Q17RM4 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CCDC142Q17RM4 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CCDC142Q17RM4 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CCDC142Q17RM4 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
CCDC142Q17RM4 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CCDC142Q17RM4 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CCDC142Q17RM4 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CCDC142Q17RM4 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
CCDC142Q17RM4 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
CCDC142Q17RM4 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CCDC142Q17RM4 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CCDC142Q17RM4 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CCDC142Q17RM4 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CCDC142Q17RM4 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
CCDC142Q17RM4 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
CCDC142Q17RM4 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
CCDC142Q17RM4 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.83
CCDC142Q17RM4 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
CCDC142Q17RM4 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CCDC142Q17RM4 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CCDC142Q17RM4 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CCDC142Q17RM4 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
CCDC142Q17RM4 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CCDC142Q17RM4 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CCDC142Q17RM4 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CCDC142Q17RM4 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CCDC142Q17RM4 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CCDC142Q17RM4 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CCDC142Q17RM4 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CCDC142Q17RM4 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CCDC142Q17RM4 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
CCDC142Q17RM4 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CCDC142Q17RM4 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CCDC142Q17RM4 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CCDC142Q17RM4 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CCDC142Q17RM4 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
CCDC142Q17RM4 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CCDC142Q17RM4 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
CCDC142Q17RM4 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
CCDC142Q17RM4 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
CCDC142Q17RM4 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
CCDC142Q17RM4 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
CCDC142Q17RM4 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
CCDC142Q17RM4 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
CCDC142Q17RM4 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
CCDC142Q17RM4 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
CCDC142Q17RM4 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
CCDC142Q17RM4 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
CCDC142Q17RM4 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
CCDC142Q17RM4 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
CCDC142Q17RM4 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
CCDC142Q17RM4 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CCDC142Q17RM4 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CCDC142Q17RM4 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CCDC142Q17RM4 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CCDC142Q17RM4 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC31.5■■■□□ 2.63
CCDC142Q17RM4 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CCDC142Q17RM4 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CCDC142Q17RM4 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CCDC142Q17RM4 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.61
CCDC142Q17RM4 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
CCDC142Q17RM4 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
CCDC142Q17RM4 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CCDC142Q17RM4 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CCDC142Q17RM4 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CCDC142Q17RM4 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
CCDC142Q17RM4 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
CCDC142Q17RM4 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
CCDC142Q17RM4 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
CCDC142Q17RM4 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
CCDC142Q17RM4 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CCDC142Q17RM4 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CCDC142Q17RM4 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CCDC142Q17RM4 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CCDC142Q17RM4 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CCDC142Q17RM4 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CCDC142Q17RM4 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CCDC142Q17RM4 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CCDC142Q17RM4 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CCDC142Q17RM4 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CCDC142Q17RM4 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CCDC142Q17RM4 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CCDC142Q17RM4 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
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