Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

Predictions only

Length 746 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.98■■■□□ 2.71
EXT1Q16394 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
EXT1Q16394 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
EXT1Q16394 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
EXT1Q16394 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
EXT1Q16394 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
EXT1Q16394 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
EXT1Q16394 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
EXT1Q16394 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
EXT1Q16394 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
EXT1Q16394 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
EXT1Q16394 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
EXT1Q16394 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
EXT1Q16394 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
EXT1Q16394 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
EXT1Q16394 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
EXT1Q16394 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
EXT1Q16394 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
EXT1Q16394 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
EXT1Q16394 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
EXT1Q16394 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
EXT1Q16394 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
EXT1Q16394 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
EXT1Q16394 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
EXT1Q16394 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
EXT1Q16394 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
EXT1Q16394 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
EXT1Q16394 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
EXT1Q16394 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
EXT1Q16394 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
EXT1Q16394 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
EXT1Q16394 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
EXT1Q16394 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
EXT1Q16394 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
EXT1Q16394 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
EXT1Q16394 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
EXT1Q16394 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
EXT1Q16394 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
EXT1Q16394 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
EXT1Q16394 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
EXT1Q16394 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
EXT1Q16394 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
EXT1Q16394 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
EXT1Q16394 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
EXT1Q16394 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
EXT1Q16394 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
EXT1Q16394 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
EXT1Q16394 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
EXT1Q16394 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
EXT1Q16394 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
EXT1Q16394 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
EXT1Q16394 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
EXT1Q16394 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
EXT1Q16394 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
EXT1Q16394 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
EXT1Q16394 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
EXT1Q16394 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
EXT1Q16394 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
EXT1Q16394 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
EXT1Q16394 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
EXT1Q16394 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
EXT1Q16394 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
EXT1Q16394 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
EXT1Q16394 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
EXT1Q16394 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
EXT1Q16394 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
EXT1Q16394 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
EXT1Q16394 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
EXT1Q16394 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
EXT1Q16394 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EXT1Q16394 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
EXT1Q16394 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
EXT1Q16394 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
EXT1Q16394 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
EXT1Q16394 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
EXT1Q16394 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
EXT1Q16394 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
EXT1Q16394 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
EXT1Q16394 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
EXT1Q16394 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
EXT1Q16394 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
EXT1Q16394 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
EXT1Q16394 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
EXT1Q16394 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
EXT1Q16394 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
EXT1Q16394 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
EXT1Q16394 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
EXT1Q16394 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
EXT1Q16394 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
EXT1Q16394 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
EXT1Q16394 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
EXT1Q16394 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
EXT1Q16394 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
EXT1Q16394 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
EXT1Q16394 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
EXT1Q16394 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
EXT1Q16394 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EXT1Q16394 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EXT1Q16394 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EXT1Q16394 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms