Protein–RNA interactions for Protein: Q16352

INA, Alpha-internexin, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INAQ16352 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.4■■■□□ 2.62
INAQ16352 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
INAQ16352 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
INAQ16352 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.85■■■□□ 2.53
INAQ16352 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
INAQ16352 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
INAQ16352 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
INAQ16352 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
INAQ16352 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
INAQ16352 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
INAQ16352 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
INAQ16352 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
INAQ16352 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
INAQ16352 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
INAQ16352 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
INAQ16352 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
INAQ16352 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
INAQ16352 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
INAQ16352 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
INAQ16352 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
INAQ16352 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
INAQ16352 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
INAQ16352 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
INAQ16352 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
INAQ16352 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
INAQ16352 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
INAQ16352 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
INAQ16352 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
INAQ16352 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
INAQ16352 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
INAQ16352 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
INAQ16352 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
INAQ16352 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
INAQ16352 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
INAQ16352 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
INAQ16352 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
INAQ16352 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
INAQ16352 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
INAQ16352 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
INAQ16352 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
INAQ16352 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
INAQ16352 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
INAQ16352 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
INAQ16352 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
INAQ16352 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
INAQ16352 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
INAQ16352 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
INAQ16352 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
INAQ16352 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
INAQ16352 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
INAQ16352 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
INAQ16352 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
INAQ16352 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
INAQ16352 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
INAQ16352 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
INAQ16352 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
INAQ16352 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
INAQ16352 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
INAQ16352 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
INAQ16352 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
INAQ16352 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
INAQ16352 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
INAQ16352 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
INAQ16352 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
INAQ16352 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
INAQ16352 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
INAQ16352 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
INAQ16352 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
INAQ16352 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
INAQ16352 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
INAQ16352 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
INAQ16352 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
INAQ16352 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
INAQ16352 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
INAQ16352 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
INAQ16352 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
INAQ16352 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
INAQ16352 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
INAQ16352 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
INAQ16352 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
INAQ16352 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
INAQ16352 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
INAQ16352 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
INAQ16352 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
INAQ16352 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
INAQ16352 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
INAQ16352 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
INAQ16352 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
INAQ16352 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
INAQ16352 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
INAQ16352 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
INAQ16352 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
INAQ16352 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
INAQ16352 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
INAQ16352 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
INAQ16352 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
INAQ16352 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
INAQ16352 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
INAQ16352 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
INAQ16352 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms