Protein–RNA interactions for Protein: Q16322

KCNA10, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 10, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA10Q16322 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC38.87■■■■□ 3.81
KCNA10Q16322 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC38.46■■■■□ 3.75
KCNA10Q16322 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.93■■■■□ 3.66
KCNA10Q16322 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
KCNA10Q16322 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
KCNA10Q16322 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
KCNA10Q16322 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
KCNA10Q16322 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC37.06■■■■□ 3.52
KCNA10Q16322 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
KCNA10Q16322 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC36.67■■■■□ 3.46
KCNA10Q16322 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
KCNA10Q16322 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
KCNA10Q16322 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC36.5■■■■□ 3.43
KCNA10Q16322 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
KCNA10Q16322 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
KCNA10Q16322 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
KCNA10Q16322 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
KCNA10Q16322 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
KCNA10Q16322 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
KCNA10Q16322 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
KCNA10Q16322 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
KCNA10Q16322 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
KCNA10Q16322 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC35.62■■■■□ 3.29
KCNA10Q16322 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
KCNA10Q16322 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
KCNA10Q16322 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
KCNA10Q16322 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
KCNA10Q16322 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
KCNA10Q16322 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
KCNA10Q16322 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
KCNA10Q16322 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
KCNA10Q16322 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
KCNA10Q16322 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
KCNA10Q16322 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC35.01■■■■□ 3.2
KCNA10Q16322 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC34.97■■■■□ 3.19
KCNA10Q16322 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
KCNA10Q16322 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
KCNA10Q16322 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
KCNA10Q16322 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
KCNA10Q16322 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
KCNA10Q16322 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
KCNA10Q16322 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
KCNA10Q16322 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
KCNA10Q16322 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
KCNA10Q16322 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
KCNA10Q16322 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
KCNA10Q16322 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
KCNA10Q16322 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
KCNA10Q16322 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
KCNA10Q16322 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
KCNA10Q16322 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
KCNA10Q16322 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
KCNA10Q16322 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
KCNA10Q16322 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
KCNA10Q16322 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
KCNA10Q16322 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
KCNA10Q16322 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
KCNA10Q16322 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
KCNA10Q16322 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
KCNA10Q16322 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
KCNA10Q16322 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
KCNA10Q16322 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
KCNA10Q16322 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
KCNA10Q16322 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
KCNA10Q16322 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
KCNA10Q16322 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
KCNA10Q16322 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
KCNA10Q16322 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
KCNA10Q16322 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
KCNA10Q16322 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
KCNA10Q16322 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
KCNA10Q16322 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
KCNA10Q16322 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
KCNA10Q16322 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
KCNA10Q16322 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
KCNA10Q16322 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC33.43■■■□□ 2.94
KCNA10Q16322 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
KCNA10Q16322 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
KCNA10Q16322 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
KCNA10Q16322 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
KCNA10Q16322 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
KCNA10Q16322 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
KCNA10Q16322 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
KCNA10Q16322 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
KCNA10Q16322 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
KCNA10Q16322 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
KCNA10Q16322 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
KCNA10Q16322 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC33.19■■■□□ 2.9
KCNA10Q16322 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
KCNA10Q16322 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
KCNA10Q16322 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
KCNA10Q16322 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
KCNA10Q16322 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
KCNA10Q16322 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
KCNA10Q16322 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
KCNA10Q16322 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
KCNA10Q16322 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
KCNA10Q16322 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
KCNA10Q16322 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
KCNA10Q16322 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms