Protein–RNA interactions for Protein: Q15019

SEPT2, Septin-2, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEPT2Q15019 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC40.64■■■■■ 4.1
SEPT2Q15019 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC39.64■■■■□ 3.94
SEPT2Q15019 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
SEPT2Q15019 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
SEPT2Q15019 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
SEPT2Q15019 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.27■■■■□ 3.88
SEPT2Q15019 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC39.11■■■■□ 3.85
SEPT2Q15019 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39■■■■□ 3.83
SEPT2Q15019 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
SEPT2Q15019 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.68
SEPT2Q15019 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.68
SEPT2Q15019 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
SEPT2Q15019 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
SEPT2Q15019 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC37.85■■■■□ 3.65
SEPT2Q15019 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC37.81■■■■□ 3.64
SEPT2Q15019 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.64
SEPT2Q15019 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
SEPT2Q15019 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
SEPT2Q15019 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
SEPT2Q15019 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
SEPT2Q15019 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
SEPT2Q15019 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
SEPT2Q15019 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
SEPT2Q15019 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
SEPT2Q15019 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
SEPT2Q15019 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.49
SEPT2Q15019 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
SEPT2Q15019 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC36.73■■■■□ 3.47
SEPT2Q15019 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
SEPT2Q15019 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
SEPT2Q15019 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
SEPT2Q15019 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
SEPT2Q15019 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
SEPT2Q15019 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
SEPT2Q15019 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
SEPT2Q15019 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
SEPT2Q15019 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
SEPT2Q15019 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
SEPT2Q15019 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
SEPT2Q15019 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC35.99■■■■□ 3.35
SEPT2Q15019 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
SEPT2Q15019 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
SEPT2Q15019 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
SEPT2Q15019 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
SEPT2Q15019 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
SEPT2Q15019 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
SEPT2Q15019 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
SEPT2Q15019 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC35.58■■■■□ 3.29
SEPT2Q15019 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
SEPT2Q15019 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
SEPT2Q15019 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
SEPT2Q15019 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
SEPT2Q15019 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
SEPT2Q15019 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
SEPT2Q15019 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC35.33■■■■□ 3.25
SEPT2Q15019 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
SEPT2Q15019 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
SEPT2Q15019 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
SEPT2Q15019 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
SEPT2Q15019 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
SEPT2Q15019 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
SEPT2Q15019 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC35.1■■■■□ 3.21
SEPT2Q15019 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
SEPT2Q15019 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
SEPT2Q15019 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC35.01■■■■□ 3.2
SEPT2Q15019 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC34.98■■■■□ 3.19
SEPT2Q15019 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
SEPT2Q15019 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
SEPT2Q15019 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
SEPT2Q15019 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
SEPT2Q15019 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
SEPT2Q15019 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC34.83■■■■□ 3.17
SEPT2Q15019 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
SEPT2Q15019 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
SEPT2Q15019 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
SEPT2Q15019 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
SEPT2Q15019 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
SEPT2Q15019 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
SEPT2Q15019 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
SEPT2Q15019 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
SEPT2Q15019 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
SEPT2Q15019 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
SEPT2Q15019 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
SEPT2Q15019 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
SEPT2Q15019 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
SEPT2Q15019 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC34.54■■■■□ 3.12
SEPT2Q15019 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
SEPT2Q15019 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
SEPT2Q15019 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
SEPT2Q15019 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
SEPT2Q15019 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
SEPT2Q15019 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
SEPT2Q15019 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
SEPT2Q15019 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
SEPT2Q15019 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
SEPT2Q15019 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
SEPT2Q15019 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
SEPT2Q15019 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
SEPT2Q15019 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
SEPT2Q15019 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms