Protein–RNA interactions for Protein: Q14126

DSG2, Desmoglein-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG2Q14126 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC32.47■■■□□ 2.79
DSG2Q14126 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
DSG2Q14126 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
DSG2Q14126 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
DSG2Q14126 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
DSG2Q14126 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
DSG2Q14126 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
DSG2Q14126 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
DSG2Q14126 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
DSG2Q14126 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
DSG2Q14126 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
DSG2Q14126 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
DSG2Q14126 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
DSG2Q14126 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
DSG2Q14126 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
DSG2Q14126 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
DSG2Q14126 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
DSG2Q14126 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
DSG2Q14126 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
DSG2Q14126 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
DSG2Q14126 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
DSG2Q14126 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
DSG2Q14126 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
DSG2Q14126 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
DSG2Q14126 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
DSG2Q14126 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
DSG2Q14126 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
DSG2Q14126 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
DSG2Q14126 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
DSG2Q14126 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
DSG2Q14126 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
DSG2Q14126 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
DSG2Q14126 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
DSG2Q14126 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
DSG2Q14126 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
DSG2Q14126 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
DSG2Q14126 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
DSG2Q14126 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
DSG2Q14126 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
DSG2Q14126 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
DSG2Q14126 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
DSG2Q14126 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
DSG2Q14126 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
DSG2Q14126 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
DSG2Q14126 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
DSG2Q14126 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
DSG2Q14126 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
DSG2Q14126 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
DSG2Q14126 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
DSG2Q14126 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
DSG2Q14126 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
DSG2Q14126 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
DSG2Q14126 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
DSG2Q14126 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
DSG2Q14126 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
DSG2Q14126 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DSG2Q14126 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
DSG2Q14126 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DSG2Q14126 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
DSG2Q14126 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
DSG2Q14126 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
DSG2Q14126 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
DSG2Q14126 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
DSG2Q14126 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
DSG2Q14126 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
DSG2Q14126 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DSG2Q14126 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
DSG2Q14126 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
DSG2Q14126 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DSG2Q14126 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
DSG2Q14126 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DSG2Q14126 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DSG2Q14126 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
DSG2Q14126 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
DSG2Q14126 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
DSG2Q14126 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
DSG2Q14126 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DSG2Q14126 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DSG2Q14126 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DSG2Q14126 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
DSG2Q14126 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DSG2Q14126 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DSG2Q14126 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DSG2Q14126 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DSG2Q14126 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
DSG2Q14126 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DSG2Q14126 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DSG2Q14126 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
DSG2Q14126 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DSG2Q14126 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DSG2Q14126 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
DSG2Q14126 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DSG2Q14126 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DSG2Q14126 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DSG2Q14126 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DSG2Q14126 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
DSG2Q14126 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
DSG2Q14126 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DSG2Q14126 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DSG2Q14126 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms