Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC43.02■■■■■ 4.48
CACNA1SQ13698 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC42.68■■■■■ 4.42
CACNA1SQ13698 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.31■■■■■ 4.36
CACNA1SQ13698 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
CACNA1SQ13698 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
CACNA1SQ13698 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.46■■■■■ 4.23
CACNA1SQ13698 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
CACNA1SQ13698 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC41.07■■■■■ 4.17
CACNA1SQ13698 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC40.99■■■■■ 4.15
CACNA1SQ13698 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.98■■■■■ 4.15
CACNA1SQ13698 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
CACNA1SQ13698 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC40.81■■■■■ 4.12
CACNA1SQ13698 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
CACNA1SQ13698 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC40.64■■■■■ 4.1
CACNA1SQ13698 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.42■■■■■ 4.06
CACNA1SQ13698 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
CACNA1SQ13698 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
CACNA1SQ13698 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
CACNA1SQ13698 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
CACNA1SQ13698 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
CACNA1SQ13698 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
CACNA1SQ13698 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.7■■■■□ 3.95
CACNA1SQ13698 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
CACNA1SQ13698 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
CACNA1SQ13698 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC39.56■■■■□ 3.92
CACNA1SQ13698 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC39.52■■■■□ 3.92
CACNA1SQ13698 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.45■■■■□ 3.91
CACNA1SQ13698 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.37■■■■□ 3.89
CACNA1SQ13698 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
CACNA1SQ13698 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC39.29■■■■□ 3.88
CACNA1SQ13698 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC39.16■■■■□ 3.86
CACNA1SQ13698 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC39.1■■■■□ 3.85
CACNA1SQ13698 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC39.1■■■■□ 3.85
CACNA1SQ13698 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC39.04■■■■□ 3.84
CACNA1SQ13698 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC39■■■■□ 3.83
CACNA1SQ13698 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC38.97■■■■□ 3.83
CACNA1SQ13698 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC38.75■■■■□ 3.79
CACNA1SQ13698 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
CACNA1SQ13698 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
CACNA1SQ13698 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC38.53■■■■□ 3.76
CACNA1SQ13698 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
CACNA1SQ13698 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC38.39■■■■□ 3.74
CACNA1SQ13698 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC38.22■■■■□ 3.71
CACNA1SQ13698 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
CACNA1SQ13698 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
CACNA1SQ13698 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
CACNA1SQ13698 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC38.06■■■■□ 3.68
CACNA1SQ13698 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
CACNA1SQ13698 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
CACNA1SQ13698 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
CACNA1SQ13698 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC37.84■■■■□ 3.65
CACNA1SQ13698 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
CACNA1SQ13698 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
CACNA1SQ13698 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
CACNA1SQ13698 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC37.75■■■■□ 3.63
CACNA1SQ13698 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
CACNA1SQ13698 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
CACNA1SQ13698 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
CACNA1SQ13698 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC37.71■■■■□ 3.63
CACNA1SQ13698 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
CACNA1SQ13698 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
CACNA1SQ13698 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
CACNA1SQ13698 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
CACNA1SQ13698 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.6■■■■□ 3.61
CACNA1SQ13698 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
CACNA1SQ13698 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
CACNA1SQ13698 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
CACNA1SQ13698 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
CACNA1SQ13698 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
CACNA1SQ13698 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
CACNA1SQ13698 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
CACNA1SQ13698 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
CACNA1SQ13698 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
CACNA1SQ13698 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
CACNA1SQ13698 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
CACNA1SQ13698 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
CACNA1SQ13698 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
CACNA1SQ13698 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
CACNA1SQ13698 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC37.14■■■■□ 3.54
CACNA1SQ13698 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.54
CACNA1SQ13698 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
CACNA1SQ13698 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
CACNA1SQ13698 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
CACNA1SQ13698 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC37.09■■■■□ 3.53
CACNA1SQ13698 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
CACNA1SQ13698 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
CACNA1SQ13698 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
CACNA1SQ13698 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC37■■■■□ 3.51
CACNA1SQ13698 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC36.95■■■■□ 3.51
CACNA1SQ13698 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
CACNA1SQ13698 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
CACNA1SQ13698 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
CACNA1SQ13698 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
CACNA1SQ13698 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
CACNA1SQ13698 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
CACNA1SQ13698 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
CACNA1SQ13698 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
CACNA1SQ13698 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC36.79■■■■□ 3.48
CACNA1SQ13698 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC36.77■■■■□ 3.48
CACNA1SQ13698 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC36.77■■■■□ 3.48
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