Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC56.23■■■■■ 6.59
GOLGA3Q08378 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC55.38■■■■■ 6.46
GOLGA3Q08378 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.89■■■■■ 6.38
GOLGA3Q08378 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.63■■■■■ 6.34
GOLGA3Q08378 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC54.55■■■■■ 6.32
GOLGA3Q08378 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC54.48■■■■■ 6.31
GOLGA3Q08378 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.46■■■■■ 6.31
GOLGA3Q08378 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC54.34■■■■■ 6.29
GOLGA3Q08378 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC53.21■■■■■ 6.11
GOLGA3Q08378 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC53■■■■■ 6.07
GOLGA3Q08378 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC52.93■■■■■ 6.06
GOLGA3Q08378 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC52.78■■■■■ 6.04
GOLGA3Q08378 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC52.7■■■■■ 6.03
GOLGA3Q08378 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC52.58■■■■■ 6.01
GOLGA3Q08378 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC52.57■■■■■ 6.01
GOLGA3Q08378 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC52.57■■■■■ 6.01
GOLGA3Q08378 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC52.46■■■■■ 5.99
GOLGA3Q08378 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC52.27■■■■■ 5.96
GOLGA3Q08378 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC52.25■■■■■ 5.96
GOLGA3Q08378 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.13■■■■■ 5.94
GOLGA3Q08378 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC52.02■■■■■ 5.92
GOLGA3Q08378 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.9■■■■■ 5.9
GOLGA3Q08378 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.78■■■■■ 5.88
GOLGA3Q08378 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC51.66■■■■■ 5.86
GOLGA3Q08378 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC51.64■■■■■ 5.86
GOLGA3Q08378 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.23■■■■■ 5.79
GOLGA3Q08378 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC51.23■■■■■ 5.79
GOLGA3Q08378 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC51.09■■■■■ 5.77
GOLGA3Q08378 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.06■■■■■ 5.76
GOLGA3Q08378 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC50.91■■■■■ 5.74
GOLGA3Q08378 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.84■■■■■ 5.73
GOLGA3Q08378 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC50.82■■■■■ 5.73
GOLGA3Q08378 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.81■■■■■ 5.72
GOLGA3Q08378 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.79■■■■■ 5.72
GOLGA3Q08378 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC50.73■■■■■ 5.71
GOLGA3Q08378 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC50.57■■■■■ 5.69
GOLGA3Q08378 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC50.43■■■■■ 5.66
GOLGA3Q08378 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC50.39■■■■■ 5.66
GOLGA3Q08378 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC50.34■■■■■ 5.65
GOLGA3Q08378 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC50.34■■■■■ 5.65
GOLGA3Q08378 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC50.22■■■■■ 5.63
GOLGA3Q08378 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC50.06■■■■■ 5.6
GOLGA3Q08378 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC50.05■■■■■ 5.6
GOLGA3Q08378 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.97■■■■■ 5.59
GOLGA3Q08378 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC49.78■■■■■ 5.56
GOLGA3Q08378 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC49.74■■■■■ 5.55
GOLGA3Q08378 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC49.72■■■■■ 5.55
GOLGA3Q08378 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC49.64■■■■■ 5.54
GOLGA3Q08378 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.63■■■■■ 5.53
GOLGA3Q08378 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.51■■■■■ 5.52
GOLGA3Q08378 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.48■■■■■ 5.51
GOLGA3Q08378 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC49.42■■■■■ 5.5
GOLGA3Q08378 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC49.41■■■■■ 5.5
GOLGA3Q08378 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC49.27■■■■■ 5.48
GOLGA3Q08378 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC49.27■■■■■ 5.48
GOLGA3Q08378 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC49.15■■■■■ 5.46
GOLGA3Q08378 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC49.15■■■■■ 5.46
GOLGA3Q08378 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC49.11■■■■■ 5.45
GOLGA3Q08378 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC48.99■■■■■ 5.43
GOLGA3Q08378 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC48.95■■■■■ 5.43
GOLGA3Q08378 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.78■■■■■ 5.4
GOLGA3Q08378 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC48.77■■■■■ 5.4
GOLGA3Q08378 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC48.77■■■■■ 5.4
GOLGA3Q08378 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC48.74■■■■■ 5.39
GOLGA3Q08378 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC48.74■■■■■ 5.39
GOLGA3Q08378 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC48.7■■■■■ 5.39
GOLGA3Q08378 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.67■■■■■ 5.38
GOLGA3Q08378 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC48.67■■■■■ 5.38
GOLGA3Q08378 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC48.64■■■■■ 5.38
GOLGA3Q08378 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC48.64■■■■■ 5.38
GOLGA3Q08378 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.59■■■■■ 5.37
GOLGA3Q08378 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.55■■■■■ 5.36
GOLGA3Q08378 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.54■■■■■ 5.36
GOLGA3Q08378 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC48.51■■■■■ 5.36
GOLGA3Q08378 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC48.51■■■■■ 5.36
GOLGA3Q08378 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC48.51■■■■■ 5.36
GOLGA3Q08378 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC48.46■■■■■ 5.35
GOLGA3Q08378 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC48.45■■■■■ 5.35
GOLGA3Q08378 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC48.42■■■■■ 5.34
GOLGA3Q08378 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.38■■■■■ 5.33
GOLGA3Q08378 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.36■■■■■ 5.33
GOLGA3Q08378 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC48.33■■■■■ 5.33
GOLGA3Q08378 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC48.25■■■■■ 5.31
GOLGA3Q08378 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.24■■■■■ 5.31
GOLGA3Q08378 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.21■■■■■ 5.31
GOLGA3Q08378 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC48.16■■■■■ 5.3
GOLGA3Q08378 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.11■■■■■ 5.29
GOLGA3Q08378 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC48.06■■■■■ 5.28
GOLGA3Q08378 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC48.06■■■■■ 5.28
GOLGA3Q08378 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.04■■■■■ 5.28
GOLGA3Q08378 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.01■■■■■ 5.28
GOLGA3Q08378 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC48.01■■■■■ 5.28
GOLGA3Q08378 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.99■■■■■ 5.27
GOLGA3Q08378 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC47.97■■■■■ 5.27
GOLGA3Q08378 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.91■■■■■ 5.26
GOLGA3Q08378 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC47.91■■■■■ 5.26
GOLGA3Q08378 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.91■■■■■ 5.26
GOLGA3Q08378 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC47.84■■■■■ 5.25
GOLGA3Q08378 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.82■■■■■ 5.25
GOLGA3Q08378 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.82■■■■■ 5.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.1 ms