Protein–RNA interactions for Protein: Q06481

APLP2, Amyloid-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APLP2Q06481 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC53.83■■■■■ 6.21
APLP2Q06481 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.81■■■■■ 6.04
APLP2Q06481 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC52.26■■■■■ 5.96
APLP2Q06481 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC52.2■■■■■ 5.95
APLP2Q06481 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.16■■■■■ 5.94
APLP2Q06481 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.11■■■■■ 5.93
APLP2Q06481 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC52■■■■■ 5.91
APLP2Q06481 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC51.17■■■■■ 5.78
APLP2Q06481 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC51.03■■■■■ 5.76
APLP2Q06481 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC50.83■■■■■ 5.73
APLP2Q06481 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC50.72■■■■■ 5.71
APLP2Q06481 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC50.37■■■■■ 5.65
APLP2Q06481 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC50.34■■■■■ 5.65
APLP2Q06481 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC50.06■■■■■ 5.6
APLP2Q06481 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC50.02■■■■■ 5.6
APLP2Q06481 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50■■■■■ 5.59
APLP2Q06481 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.93■■■■■ 5.58
APLP2Q06481 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC49.78■■■■■ 5.56
APLP2Q06481 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC49.68■■■■■ 5.54
APLP2Q06481 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC49.65■■■■■ 5.54
APLP2Q06481 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC49.31■■■■■ 5.48
APLP2Q06481 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.82■■■■■ 5.41
APLP2Q06481 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.7■■■■■ 5.39
APLP2Q06481 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.65■■■■■ 5.38
APLP2Q06481 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC48.64■■■■■ 5.38
APLP2Q06481 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.6■■■■■ 5.37
APLP2Q06481 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.49■■■■■ 5.35
APLP2Q06481 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC48.48■■■■■ 5.35
APLP2Q06481 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.4■■■■■ 5.34
APLP2Q06481 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC48.4■■■■■ 5.34
APLP2Q06481 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.27■■■■■ 5.32
APLP2Q06481 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC48.2■■■■■ 5.31
APLP2Q06481 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC48.16■■■■■ 5.3
APLP2Q06481 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC48.06■■■■■ 5.28
APLP2Q06481 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC48.04■■■■■ 5.28
APLP2Q06481 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC48■■■■■ 5.27
APLP2Q06481 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.99■■■■■ 5.27
APLP2Q06481 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.98■■■■■ 5.27
APLP2Q06481 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.74■■■■■ 5.23
APLP2Q06481 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC47.7■■■■■ 5.23
APLP2Q06481 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.69■■■■■ 5.22
APLP2Q06481 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC47.67■■■■■ 5.22
APLP2Q06481 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.66■■■■■ 5.22
APLP2Q06481 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.58■■■■■ 5.21
APLP2Q06481 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.57■■■■■ 5.21
APLP2Q06481 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.54■■■■■ 5.2
APLP2Q06481 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC47.48■■■■■ 5.19
APLP2Q06481 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC47.44■■■■■ 5.18
APLP2Q06481 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.4■■■■■ 5.18
APLP2Q06481 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC47.14■■■■■ 5.14
APLP2Q06481 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC47.08■■■■■ 5.13
APLP2Q06481 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.08■■■■■ 5.13
APLP2Q06481 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.06■■■■■ 5.12
APLP2Q06481 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.03■■■■■ 5.12
APLP2Q06481 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC47.01■■■■■ 5.12
APLP2Q06481 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.96■■■■■ 5.11
APLP2Q06481 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC46.95■■■■■ 5.11
APLP2Q06481 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC46.9■■■■■ 5.1
APLP2Q06481 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC46.9■■■■■ 5.1
APLP2Q06481 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.72■■■■■ 5.07
APLP2Q06481 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC46.7■■■■■ 5.07
APLP2Q06481 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC46.67■■■■■ 5.06
APLP2Q06481 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC46.52■■■■■ 5.04
APLP2Q06481 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.51■■■■■ 5.04
APLP2Q06481 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC46.47■■■■■ 5.03
APLP2Q06481 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC46.46■■■■■ 5.03
APLP2Q06481 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC46.45■■■■■ 5.03
APLP2Q06481 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.44■■■■■ 5.02
APLP2Q06481 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.37■■■■■ 5.01
APLP2Q06481 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.27■■■■■ 5
APLP2Q06481 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.13■■■■■ 4.98
APLP2Q06481 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.13■■■■■ 4.98
APLP2Q06481 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.11■■■■■ 4.97
APLP2Q06481 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.01■■■■■ 4.96
APLP2Q06481 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46■■■■■ 4.96
APLP2Q06481 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.99■■■■■ 4.95
APLP2Q06481 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC45.96■■■■■ 4.95
APLP2Q06481 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.94■■■■■ 4.94
APLP2Q06481 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC45.88■■■■■ 4.94
APLP2Q06481 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC45.86■■■■■ 4.93
APLP2Q06481 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.85■■■■■ 4.93
APLP2Q06481 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.85■■■■■ 4.93
APLP2Q06481 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.8■■■■■ 4.92
APLP2Q06481 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC45.8■■■■■ 4.92
APLP2Q06481 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC45.78■■■■■ 4.92
APLP2Q06481 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC45.76■■■■■ 4.92
APLP2Q06481 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.69■■■■■ 4.91
APLP2Q06481 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC45.63■■■■■ 4.9
APLP2Q06481 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC45.6■■■■■ 4.89
APLP2Q06481 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC45.6■■■■■ 4.89
APLP2Q06481 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC45.6■■■■■ 4.89
APLP2Q06481 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.56■■■■■ 4.88
APLP2Q06481 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.53■■■■■ 4.88
APLP2Q06481 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.48■■■■■ 4.87
APLP2Q06481 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.4■■■■■ 4.86
APLP2Q06481 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC45.39■■■■■ 4.86
APLP2Q06481 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC45.38■■■■■ 4.86
APLP2Q06481 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC45.37■■■■■ 4.85
APLP2Q06481 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.36■■■■■ 4.85
APLP2Q06481 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC45.36■■■■■ 4.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms