Protein–RNA interactions for Protein: Q01459

CTBS, Di-N-acetylchitobiase, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBSQ01459 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC33.8■■■■□ 3
CTBSQ01459 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
CTBSQ01459 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
CTBSQ01459 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
CTBSQ01459 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CTBSQ01459 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
CTBSQ01459 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
CTBSQ01459 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CTBSQ01459 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
CTBSQ01459 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
CTBSQ01459 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
CTBSQ01459 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.6■■■□□ 2.65
CTBSQ01459 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CTBSQ01459 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CTBSQ01459 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
CTBSQ01459 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
CTBSQ01459 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC31.37■■■□□ 2.61
CTBSQ01459 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC31.32■■■□□ 2.6
CTBSQ01459 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CTBSQ01459 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
CTBSQ01459 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CTBSQ01459 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CTBSQ01459 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CTBSQ01459 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CTBSQ01459 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CTBSQ01459 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.7■■■□□ 2.51
CTBSQ01459 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CTBSQ01459 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CTBSQ01459 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
CTBSQ01459 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CTBSQ01459 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CTBSQ01459 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CTBSQ01459 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CTBSQ01459 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CTBSQ01459 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CTBSQ01459 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CTBSQ01459 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CTBSQ01459 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
CTBSQ01459 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CTBSQ01459 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CTBSQ01459 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CTBSQ01459 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CTBSQ01459 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
CTBSQ01459 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CTBSQ01459 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CTBSQ01459 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CTBSQ01459 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CTBSQ01459 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CTBSQ01459 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CTBSQ01459 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CTBSQ01459 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CTBSQ01459 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CTBSQ01459 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CTBSQ01459 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CTBSQ01459 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CTBSQ01459 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
CTBSQ01459 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CTBSQ01459 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
CTBSQ01459 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CTBSQ01459 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CTBSQ01459 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CTBSQ01459 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CTBSQ01459 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CTBSQ01459 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CTBSQ01459 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CTBSQ01459 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CTBSQ01459 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CTBSQ01459 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CTBSQ01459 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CTBSQ01459 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CTBSQ01459 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CTBSQ01459 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CTBSQ01459 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CTBSQ01459 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CTBSQ01459 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CTBSQ01459 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CTBSQ01459 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CTBSQ01459 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CTBSQ01459 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CTBSQ01459 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CTBSQ01459 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CTBSQ01459 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CTBSQ01459 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CTBSQ01459 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CTBSQ01459 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CTBSQ01459 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CTBSQ01459 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CTBSQ01459 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CTBSQ01459 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CTBSQ01459 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CTBSQ01459 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CTBSQ01459 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CTBSQ01459 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CTBSQ01459 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CTBSQ01459 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CTBSQ01459 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CTBSQ01459 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CTBSQ01459 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CTBSQ01459 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CTBSQ01459 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms