Protein–RNA interactions for Protein: P80188

LCN2, Neutrophil gelatinase-associated lipocalin, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN2P80188 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LCN2P80188 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LCN2P80188 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
LCN2P80188 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
LCN2P80188 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LCN2P80188 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LCN2P80188 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
LCN2P80188 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LCN2P80188 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LCN2P80188 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LCN2P80188 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LCN2P80188 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
LCN2P80188 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LCN2P80188 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LCN2P80188 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LCN2P80188 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LCN2P80188 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LCN2P80188 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LCN2P80188 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LCN2P80188 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LCN2P80188 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LCN2P80188 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LCN2P80188 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LCN2P80188 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LCN2P80188 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LCN2P80188 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LCN2P80188 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LCN2P80188 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LCN2P80188 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LCN2P80188 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LCN2P80188 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LCN2P80188 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LCN2P80188 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LCN2P80188 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LCN2P80188 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LCN2P80188 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LCN2P80188 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LCN2P80188 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LCN2P80188 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LCN2P80188 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LCN2P80188 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LCN2P80188 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LCN2P80188 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LCN2P80188 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LCN2P80188 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LCN2P80188 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LCN2P80188 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LCN2P80188 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LCN2P80188 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
LCN2P80188 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LCN2P80188 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LCN2P80188 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
LCN2P80188 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LCN2P80188 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LCN2P80188 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LCN2P80188 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LCN2P80188 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LCN2P80188 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LCN2P80188 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LCN2P80188 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LCN2P80188 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LCN2P80188 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LCN2P80188 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LCN2P80188 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LCN2P80188 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LCN2P80188 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LCN2P80188 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LCN2P80188 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LCN2P80188 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LCN2P80188 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LCN2P80188 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LCN2P80188 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LCN2P80188 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LCN2P80188 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LCN2P80188 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LCN2P80188 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LCN2P80188 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LCN2P80188 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LCN2P80188 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LCN2P80188 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LCN2P80188 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LCN2P80188 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LCN2P80188 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LCN2P80188 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LCN2P80188 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LCN2P80188 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LCN2P80188 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LCN2P80188 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LCN2P80188 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LCN2P80188 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LCN2P80188 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LCN2P80188 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LCN2P80188 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LCN2P80188 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LCN2P80188 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LCN2P80188 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LCN2P80188 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LCN2P80188 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LCN2P80188 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LCN2P80188 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms