Protein–RNA interactions for Protein: P52179

MYOM1, Myomesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYOM1P52179 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC47.53■■■■■ 5.2
MYOM1P52179 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.56■■■■■ 5.04
MYOM1P52179 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.17■■■■■ 4.98
MYOM1P52179 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.14■■■■■ 4.98
MYOM1P52179 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC46.11■■■■■ 4.97
MYOM1P52179 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.07■■■■■ 4.97
MYOM1P52179 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC45.99■■■■■ 4.95
MYOM1P52179 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC45.28■■■■■ 4.84
MYOM1P52179 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC45.2■■■■■ 4.83
MYOM1P52179 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC45■■■■■ 4.79
MYOM1P52179 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC44.82■■■■■ 4.77
MYOM1P52179 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.56■■■■■ 4.72
MYOM1P52179 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC44.43■■■■■ 4.7
MYOM1P52179 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC44.41■■■■■ 4.7
MYOM1P52179 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.3■■■■■ 4.68
MYOM1P52179 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC44.28■■■■■ 4.68
MYOM1P52179 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC44.14■■■■■ 4.66
MYOM1P52179 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.12■■■■■ 4.65
MYOM1P52179 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.98■■■■■ 4.63
MYOM1P52179 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC43.94■■■■■ 4.63
MYOM1P52179 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.7■■■■■ 4.59
MYOM1P52179 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.3■■■■■ 4.52
MYOM1P52179 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.49
MYOM1P52179 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.07■■■■■ 4.49
MYOM1P52179 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC43.05■■■■■ 4.48
MYOM1P52179 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
MYOM1P52179 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
MYOM1P52179 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
MYOM1P52179 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
MYOM1P52179 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
MYOM1P52179 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
MYOM1P52179 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.64■■■■■ 4.42
MYOM1P52179 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC42.58■■■■■ 4.41
MYOM1P52179 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.54■■■■■ 4.4
MYOM1P52179 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC42.46■■■■■ 4.39
MYOM1P52179 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC42.39■■■■■ 4.38
MYOM1P52179 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC42.36■■■■■ 4.37
MYOM1P52179 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
MYOM1P52179 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.13■■■■■ 4.34
MYOM1P52179 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.07■■■■■ 4.33
MYOM1P52179 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.06■■■■■ 4.32
MYOM1P52179 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
MYOM1P52179 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.05■■■■■ 4.32
MYOM1P52179 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
MYOM1P52179 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.93■■■■■ 4.3
MYOM1P52179 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC41.91■■■■■ 4.3
MYOM1P52179 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC41.85■■■■■ 4.29
MYOM1P52179 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC41.82■■■■■ 4.28
MYOM1P52179 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC41.8■■■■■ 4.28
MYOM1P52179 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
MYOM1P52179 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
MYOM1P52179 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC41.65■■■■■ 4.26
MYOM1P52179 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.56■■■■■ 4.24
MYOM1P52179 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC41.53■■■■■ 4.24
MYOM1P52179 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC41.52■■■■■ 4.24
MYOM1P52179 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC41.45■■■■■ 4.23
MYOM1P52179 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
MYOM1P52179 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
MYOM1P52179 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
MYOM1P52179 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
MYOM1P52179 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC41.33■■■■■ 4.21
MYOM1P52179 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
MYOM1P52179 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
MYOM1P52179 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
MYOM1P52179 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
MYOM1P52179 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
MYOM1P52179 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
MYOM1P52179 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
MYOM1P52179 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC40.79■■■■■ 4.12
MYOM1P52179 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
MYOM1P52179 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC40.72■■■■■ 4.11
MYOM1P52179 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
MYOM1P52179 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
MYOM1P52179 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC40.69■■■■■ 4.1
MYOM1P52179 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC40.69■■■■■ 4.1
MYOM1P52179 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.65■■■■■ 4.1
MYOM1P52179 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
MYOM1P52179 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
MYOM1P52179 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
MYOM1P52179 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC40.56■■■■■ 4.08
MYOM1P52179 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC40.46■■■■■ 4.07
MYOM1P52179 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.4■■■■■ 4.06
MYOM1P52179 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC40.36■■■■■ 4.05
MYOM1P52179 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
MYOM1P52179 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
MYOM1P52179 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
MYOM1P52179 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC40.33■■■■■ 4.05
MYOM1P52179 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
MYOM1P52179 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
MYOM1P52179 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
MYOM1P52179 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
MYOM1P52179 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
MYOM1P52179 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
MYOM1P52179 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.15■■■■■ 4.02
MYOM1P52179 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC40.15■■■■■ 4.02
MYOM1P52179 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
MYOM1P52179 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
MYOM1P52179 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC40.07■■■■■ 4
MYOM1P52179 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
MYOM1P52179 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms