Protein–RNA interactions for Protein: P35680

HNF1B, Hepatocyte nuclear factor 1-beta, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF1BP35680 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC34.4■■■■□ 3.1
HNF1BP35680 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
HNF1BP35680 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
HNF1BP35680 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
HNF1BP35680 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
HNF1BP35680 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
HNF1BP35680 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
HNF1BP35680 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
HNF1BP35680 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
HNF1BP35680 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
HNF1BP35680 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
HNF1BP35680 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
HNF1BP35680 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
HNF1BP35680 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
HNF1BP35680 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
HNF1BP35680 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
HNF1BP35680 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
HNF1BP35680 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
HNF1BP35680 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
HNF1BP35680 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
HNF1BP35680 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
HNF1BP35680 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
HNF1BP35680 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
HNF1BP35680 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
HNF1BP35680 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
HNF1BP35680 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
HNF1BP35680 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
HNF1BP35680 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
HNF1BP35680 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
HNF1BP35680 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
HNF1BP35680 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.01■■■□□ 2.55
HNF1BP35680 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.54
HNF1BP35680 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
HNF1BP35680 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
HNF1BP35680 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
HNF1BP35680 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
HNF1BP35680 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
HNF1BP35680 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
HNF1BP35680 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
HNF1BP35680 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
HNF1BP35680 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
HNF1BP35680 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
HNF1BP35680 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
HNF1BP35680 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
HNF1BP35680 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
HNF1BP35680 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
HNF1BP35680 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
HNF1BP35680 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
HNF1BP35680 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
HNF1BP35680 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
HNF1BP35680 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
HNF1BP35680 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
HNF1BP35680 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
HNF1BP35680 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
HNF1BP35680 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
HNF1BP35680 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
HNF1BP35680 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
HNF1BP35680 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
HNF1BP35680 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
HNF1BP35680 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
HNF1BP35680 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
HNF1BP35680 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
HNF1BP35680 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
HNF1BP35680 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
HNF1BP35680 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
HNF1BP35680 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
HNF1BP35680 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
HNF1BP35680 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
HNF1BP35680 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
HNF1BP35680 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
HNF1BP35680 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
HNF1BP35680 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
HNF1BP35680 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
HNF1BP35680 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
HNF1BP35680 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
HNF1BP35680 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
HNF1BP35680 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
HNF1BP35680 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
HNF1BP35680 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
HNF1BP35680 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
HNF1BP35680 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
HNF1BP35680 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
HNF1BP35680 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
HNF1BP35680 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
HNF1BP35680 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
HNF1BP35680 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
HNF1BP35680 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
HNF1BP35680 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
HNF1BP35680 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
HNF1BP35680 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
HNF1BP35680 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
HNF1BP35680 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
HNF1BP35680 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
HNF1BP35680 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
HNF1BP35680 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
HNF1BP35680 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
HNF1BP35680 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
HNF1BP35680 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
HNF1BP35680 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
HNF1BP35680 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms